| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2499292 | 379 (0.850) | 22 (0.060) | 12/98 | NT | 5.6% | coding (820/1086 nt) | ypdF | Xaa‑Pro aminopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2499321 | 410 (1.050) | coding (791/1086 nt) | ypdF | Xaa‑Pro aminopeptidase | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2499220‑2499292‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccggcgTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT < CP009273/2499321‑2499256 CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:19458866/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:3019430/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGACGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:15500758/1‑67 ccATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGG < 1:35986520/66‑1 AATGCCGATAGCGTGTCCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:19580268/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:33378612/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:24951491/68‑1 ATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC > 1:4893030/1‑67 ATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC > 1:21981953/1‑67 CGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGC > 1:7421422/1‑67 CCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGGGTGCGCGGCCAGCAGG > 1:4912690/1‑68 CCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCGGCCAGCAGG > 1:18016620/1‑68 GTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGGGCGCTGCCAGGAGGTTGAC > 1:6885283/1‑68 TGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGAT > 1:22255678/1‑67 AGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCG > 1:21270777/1‑68 TAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATT > 1:9355673/1‑67 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCCGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAG > 1:35652286/1‑68 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCCGCAGGGTGACGATGCCGCGCGCCGGGGCATCACcg > 1:2547892/1‑66 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGGCGGGTCATTACAG > 1:27789093/1‑68 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAG > 1:10194344/1‑68 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAG > 1:25944008/1‑68 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAG > 1:29791161/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGA > 1:36276490/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGA > 1:16773214/1‑68 CTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGC > 1:29497810/1‑68 CTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGC > 1:19770892/1‑68 TTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCA > 1:22208386/1‑68 GTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTT > 1:32821864/1‑68 TAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGCTGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTA > 1:20916930/1‑68 TAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGGCATTACAGAAGCAGGTTA > 1:35747303/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:4625493/1‑68 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:32363926/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:15047734/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:2993661/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGTTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGACGCAGGGTATGGCG > 1:1305036/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGCCGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:4017259/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGA < 1:30502282/68‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGA < 1:15708367/68‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:26095670/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:26890110/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:35196551/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:33924031/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:3662835/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:36433628/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:25181685/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:35796721/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:31560380/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:14164527/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:13798/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:12175936/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:11771988/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:892663/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:8270428/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:20103107/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:20484131/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:20992652/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:21200872/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:25479688/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:7307491/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:17758681/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:17378784/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:23431574/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:24274808/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:24440729/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:16828656/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTGGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCACGTTATGGCG > 1:6863756/1‑67 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:19566270/1‑66 CGGCGTGCTCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:19910476/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:5604197/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:7622367/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:8877024/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:18914700/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:33893633/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:19772840/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:23316238/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:23657862/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:15868065/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA > 1:6549719/1‑68 GCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT > 1:18465210/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:36306923/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:188123/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:35414538/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:7741837/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:19821355/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:1790895/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:12439726/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:31356246/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:13703486/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:30205449/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:5405264/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:3316410/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:12898811/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:7269022/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:2157692/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:27842935/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:28610267/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:30115710/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:8899681/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:18763164/67‑1 GTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:15494605/1‑67 CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2499220‑2499292‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccggcgTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT < CP009273/2499321‑2499256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |