| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1894241 = | 299 (0.670) | 12 (0.030) | 5/90 | NT | 6.0% | coding (1558/1599 nt) | yoaD | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, regulator of cellulose production |
| ? | CP009273 | 1894274 = | 135 (0.380) | coding (1591/1599 nt) | yoaD | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, regulator of cellulose production | |||||
Only 100 of 514 total aligned reads displayed.
GTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCG > CP009273/1894174‑1894308 | gTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCgcccgccc > 1:7281416/1‑68 (MQ=255)gTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCgcccgccc > 1:27023416/1‑68 (MQ=255)gTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCgcccgccc > 1:26757817/1‑68 (MQ=255)gTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCgcccgccc > 1:12468491/1‑68 (MQ=255)gTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCgcccgccc > 1:15983579/1‑68 (MQ=255) gttgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaacg > 1:10804663‑M1/67‑68 (MQ=255) gttgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaac > 1:19307142‑M1/67‑67 (MQ=255) aCGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGcccgcccg < 1:13488140/67‑1 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggctcacgttgaatatgagtaagcgtttaggtaaCGGc > 1:21952726‑M1/65‑68 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCgg > 1:7627438‑M1/65‑67 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCgg > 1:17433428‑M1/65‑67 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCgg > 1:32060904‑M1/65‑67 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCgg > 1:28702859‑M1/65‑67 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGc < 1:8543566‑M1/4‑1 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGc < 1:19472467‑M1/4‑1 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGc < 1:18068825‑M1/4‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:10070595/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:21170022/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:29269168/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:27146639/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:18762140/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc > 1:14963527/1‑68 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:5624391/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:36282151/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:12365051/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:14570166/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:17329639/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:16408742/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:5868686/68‑1 (MQ=255) gatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCa > 1:20659081‑M1/64‑68 (MQ=255) gCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCa > 1:15722277/1‑68 (MQ=255) gCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCa > 1:20381903/1‑68 (MQ=255) gCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCa > 1:21514677/1‑68 (MQ=255) gCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCa > 1:891255/1‑68 (MQ=255) gCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCa > 1:33732119/1‑68 (MQ=255) gCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCa > 1:32784141/1‑68 (MQ=255) cacaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCAt > 1:22715648/1‑68 (MQ=255) cacaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCAt > 1:2417141/1‑68 (MQ=255) tctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCATa < 1:7028081‑M1/7‑1 (MQ=255) tctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCATa < 1:13359136‑M1/7‑1 (MQ=255) tctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCATa < 1:26022121‑M1/7‑1 (MQ=255) acaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCAt < 1:31584329/67‑1 (MQ=255) acaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCAt < 1:27445182/67‑1 (MQ=255) acaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATa < 1:23966413/68‑1 (MQ=255) acaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATa > 1:30734003/1‑68 (MQ=255) acaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATa > 1:8116159/1‑68 (MQ=255) acaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATa > 1:22330576/1‑68 (MQ=255) acaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATa < 1:11604648/68‑1 (MQ=255) acaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATa > 1:11225304/1‑68 (MQ=255) gCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATg > 1:24376094/1‑68 (MQ=255) gCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATg > 1:28315948/1‑68 (MQ=255) ttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCATAATgg < 1:35059265‑M1/11‑1 (MQ=255) gtcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCATAATgg > 1:5393882‑M1/57‑67 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATaa < 1:4689660/64‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATgg < 1:36940488/67‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATgg < 1:7395093/67‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATgg < 1:16655294/67‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGa < 1:17832018/68‑1 (MQ=255) tGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACat > 1:11379264/1‑68 (MQ=255) tGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACat > 1:35410761/1‑68 (MQ=255) gCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACata < 1:35863862/68‑1 (MQ=255) gCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACata < 1:31845847/68‑1 (MQ=255) gCCGCTACGTCATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATCGACaca < 1:36139424/68‑3 (MQ=255) ccGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACata > 1:6761031/1‑67 (MQ=255) ccGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACata > 1:9668996/1‑67 (MQ=255) cGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACatat < 1:34310026/67‑1 (MQ=255) tACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACg < 1:1440836/68‑1 (MQ=255) aCGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGTCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGc < 1:24510883/68‑1 (MQ=255) gTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGccc < 1:33361195/68‑1 (MQ=255) gTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGccc < 1:3224441/68‑1 (MQ=255) gTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGccc < 1:15190142/68‑1 (MQ=255) gTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGccc < 1:31110988/68‑1 (MQ=255) gTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGccc < 1:30420020/68‑1 (MQ=255) gATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCa < 1:29724423/67‑1 (MQ=255) gATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCAt < 1:24902871/68‑1 (MQ=255) gATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCAt > 1:36665826/1‑68 (MQ=255) tttCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTAt < 1:26610402/68‑1 (MQ=255) tCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGc < 1:6087149/68‑1 (MQ=255) cccAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGcc < 1:9347587/68‑1 (MQ=255) aTGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttac < 1:34697758/68‑1 (MQ=255) aTGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttac < 1:5180026/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg < 1:10556818/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg < 1:13911265/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg > 1:19130901/1‑68 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg < 1:29452921/68‑1 (MQ=255) ggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacgt > 1:23583200/1‑68 (MQ=255) ggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacgt > 1:7880052/1‑68 (MQ=255) cGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACg < 1:5071618/67‑1 (MQ=255) 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cccgcccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGt > 1:27895267/1‑68 (MQ=255) ccgcccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGt < 1:35667856/67‑1 (MQ=255) | GTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCG > CP009273/1894174‑1894308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |