| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1894241 = | 299 (0.670) | 12 (0.030) | 5/90 | NT | 6.0% | coding (1558/1599 nt) | yoaD | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, regulator of cellulose production |
| ? | CP009273 | 1894274 = | 135 (0.380) | coding (1591/1599 nt) | yoaD | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, regulator of cellulose production | |||||
Only 100 of 462 total aligned reads displayed.
AAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAAC > CP009273/1894208‑1894339 | aaTGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgtt > 1:18984594/1‑67 (MQ=255) aTGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttac < 1:27135202/68‑1 (MQ=255) aTGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttac < 1:5180026/68‑1 (MQ=255) aTGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttac < 1:5433088/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg < 1:35152737/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg < 1:35763959/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg < 1:5067856/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttaca < 1:34874878/68‑2 (MQ=255) ggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacgt > 1:25425911/1‑68 (MQ=255) gcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacgttacc > 1:27491025/1‑65 (MQ=255) gaagatgagtaagcgttaacgtaacggcataatgggcgtgatatgtccattatgccgTTACGTTAACg < 1:7338744‑M2/11‑1 (MQ=255) cGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACg < 1:17743828/67‑1 (MQ=255) gggCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGc < 1:30608910/67‑1 (MQ=255) gCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGGATTATGGACATATCTCGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCtt < 1:29153655/67‑1 (MQ=255) gCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCtt < 1:7939984/67‑1 (MQ=255) tgagtaagcgttaacgtaaCCGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACCTTAAAGCTTAc < 1:35418480‑M1/49‑1 (MQ=255) cAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTa < 1:15746724/67‑1 (MQ=255) ccAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCAAGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCa > 1:647065/1‑68 (MQ=255) cAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCa < 1:28252646/67‑1 (MQ=255) cAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCa < 1:4364141/67‑1 (MQ=255) aagcgttaacgtaaCGGCATTATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTTACGCTTACTCa < 1:17062725‑M1/52‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATc < 1:29015869/68‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATc < 1:4518170/68‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATc < 1:32114335/68‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGAAATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATc < 1:31402564/68‑1 (MQ=255) gccgccCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCa > 1:19699483/1‑68 (MQ=255) gccgccCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTAATCATCTTCa > 1:25085858/1‑68 (MQ=255) cccgcccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGt > 1:28735068/1‑68 (MQ=255) cccgcccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGt > 1:3607936/1‑68 (MQ=255) cccgcccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGt > 1:31128923/1‑68 (MQ=255) cccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTgcg > 1:9802911/1‑67 (MQ=255) ccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGcc < 1:16595909/68‑1 (MQ=255) CGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCg > 1:12616944‑M1/1‑68 (MQ=255) GCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGt < 1:6746791‑M1/68‑1 (MQ=255) ATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGtt < 1:15277116‑M1/67‑1 (MQ=255) ATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGtt < 1:24791277‑M1/67‑1 (MQ=255) ATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTg < 1:23152751‑M1/68‑1 (MQ=255) TAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGtt < 1:3808365‑M1/66‑1 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:9203176‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:10268286‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:29441162‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:32712908‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:33373561‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:34638510‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:7719236‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:7516203‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:35924261‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:36593837‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:7201574‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:21413648‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:2039636‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:18103363‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:16003580‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:22871347‑M1/1‑68 (MQ=255) TGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGctct < 1:11059531‑M1/68‑1 (MQ=255) TGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGctct > 1:25858912‑M1/1‑68 (MQ=255) TGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGctct < 1:1623851‑M1/68‑1 (MQ=255) GGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCtt < 1:4684352‑M1/68‑1 (MQ=255) GGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCtt < 1:18796174‑M1/68‑1 (MQ=255) 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gTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAac > 1:19307142‑M2/2‑67 (MQ=255) | AAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAAC > CP009273/1894208‑1894339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |