| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3333655 | 353 (0.790) | 21 (0.060) | 13/94 | NT | 6.3% | coding (22/978 nt) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter |
| ? | CP009273 | = 3333682 | 327 (0.880) | coding (49/978 nt) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter | |||||
Only 100 of 614 total aligned reads displayed.
AAAATCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTT > CP009273/3333588‑3333721 | aaaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:30630244‑M1/68‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGtt < 1:17561638/68‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:3629355‑M1/67‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:22841755‑M1/67‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:18782639‑M1/67‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:18322762‑M1/67‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:15141933‑M1/67‑1 (MQ=255) aaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTa < 1:17862820/68‑1 (MQ=255) gCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAAttgttgt > 1:4104023/1‑67 (MQ=255) gCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTgg > 1:32112947/1‑68 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGTAGAAAGGACGATAGATGCGTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGt < 1:23328038/67‑1 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGTAGAAAGGACG‑TATATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAAttgttgtt < 1:22023645/66‑3 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTgg < 1:21555243/66‑1 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGtt > 1:28281135/1‑68 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGtt > 1:8276501/1‑68 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGt < 1:13159098/67‑1 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGt < 1:27091170/67‑1 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGt < 1:25973661/67‑1 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGt < 1:14934905/67‑1 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGt < 1:19951101/67‑1 (MQ=255) ccGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTAc < 1:30020173/68‑1 (MQ=255) ccGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTAc < 1:18503041/68‑1 (MQ=255) ccGGCGAGTATAACTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTAc < 1:5975331/68‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCTCTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGt < 1:28012001/66‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGt < 1:26681507/66‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGt < 1:28543021/66‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGt < 1:9060250/66‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCg > 1:13858469/1‑68 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCg < 1:14053073/68‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCg < 1:29795687/68‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt < 1:16881376/68‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt > 1:20954201/1‑68 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt > 1:31056352/1‑68 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt < 1:12234382/68‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt > 1:7731637/1‑68 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGACACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt < 1:14431449/68‑1 (MQ=255) cTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTaaacgaccaaaagtaacccaacaatta > 1:14656503‑M1/1‑40 (MQ=255) tGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTac < 1:6089984‑M2/68‑3 (MQ=255) tGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTac < 1:5222861‑M2/68‑3 (MQ=255) tGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTAGGTTTACTTTTGGTCGGTTac < 1:33306162‑M2/68‑3 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:16194210‑M2/68‑6 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt > 1:11896811‑M2/1‑63 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:4947666‑M2/68‑6 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:85598‑M2/68‑6 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg < 1:30234682‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTCTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgc < 1:10815678‑M2/68‑8 (MQ=255) aaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgc > 1:1100906‑M2/1‑60 (MQ=255) aaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgc > 1:634704‑M2/1‑60 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgt > 1:25569860‑M1/1‑31 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccg < 1:3958828‑M2/67‑10 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccg < 1:11313903‑M2/67‑10 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTATacagtgccg < 1:10194938‑M2/67‑10 (MQ=255) aCGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgta > 1:17353448‑M1/1‑29 (MQ=255) cGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCg < 1:29558091/68‑1 (MQ=255) cGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCg < 1:1342103/68‑1 (MQ=255) ttAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCg > 1:20530025/1‑66 (MQ=255) gATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTgg > 1:32359917/1‑68 (MQ=255) aTGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGt > 1:27525264/1‑68 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTaaacgaccgaaagtaaaccaagaattaacagtgccgtagctaaaagc > 1:36101741‑M1/1‑21 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTgg < 1:34992681/66‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTgg < 1:16695035/66‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGtt < 1:35306389/68‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGtt > 1:33906333/1‑68 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGt < 1:31648827/67‑1 (MQ=255) gCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGttt > 1:4510678/1‑68 (MQ=255) cTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGtttt > 1:25099373/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:3760412/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:35694666/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:36826049/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:19542966/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:679998/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:15444578/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTATTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:24629129/1‑68 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:26538189/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:22477223/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:24151798/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:28749650/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGt < 1:12407806/68‑1 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:5543834‑M1/67‑59 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:9595189‑M1/67‑59 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:36430935‑M1/67‑59 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:35221439‑M1/67‑59 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:10164342‑M1/67‑59 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:15826379‑M1/67‑59 (MQ=255) gCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:35868867/1‑68 (MQ=255) gCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:19237593/1‑68 (MQ=255) cACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtccttt < 1:33529177‑M1/67‑62 (MQ=255) cACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt < 1:31258241/67‑1 (MQ=255) aCTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct < 1:19710419‑M1/68‑64 (MQ=255) aCTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct < 1:10565566‑M1/68‑64 (MQ=255) aCTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct < 1:11736607‑M1/68‑64 (MQ=255) aCTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct > 1:7618538‑M1/1‑5 (MQ=255) aCTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct < 1:21286761‑M1/68‑64 (MQ=255) cTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaatttacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct > 1:10062525‑M1/1‑4 (MQ=255) gTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttcttca < 1:16425146‑M1/68‑67 (MQ=255) gTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttcttca < 1:29304555‑M1/68‑67 (MQ=255) gTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttcttca < 1:33101539‑M1/68‑67 (MQ=255) gTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgacgtagctaaaagcatctaacgtcctttcttca < 1:1069416‑M1/68‑67 (MQ=255) gTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttcttca > 1:34486042‑M2/1‑29 (MQ=255) gTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCttt > 1:25297423/1‑68 (MQ=255) | AAAATCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTT > CP009273/3333588‑3333721 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |