New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3333655 | 353 (0.790) | 21 (0.060) | 13/94 | NT | 6.3% | coding (22/978 nt) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter |
? | CP009273 | = 3333682 | 327 (0.880) | coding (49/978 nt) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter |
Only 100 of 496 total aligned reads displayed.
CCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCCGCCGCTGA > CP009273/3333615‑3333748 | ccTGAAGAATGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAAATGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt < 1:23414907/68‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt < 1:12234382/68‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt > 1:10299245/1‑68 (MQ=255) tGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTac < 1:5222861‑M2/68‑3 (MQ=255) tGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTac > 1:28825057‑M2/1‑66 (MQ=255) gaagaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTaca > 1:29652398‑M2/1‑65 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:20527190‑M2/68‑6 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:85598‑M2/68‑6 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:14072435‑M2/68‑6 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt > 1:28533715‑M2/1‑63 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacag > 1:16186857‑M2/1‑63 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCAACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:27431546‑M2/68‑6 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg < 1:1066753‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg < 1:1832383‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg < 1:28068619‑M2/67‑7 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccg < 1:3958828‑M2/67‑10 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccg < 1:5543834‑M2/67‑10 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccg < 1:25537664‑M2/67‑10 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccg < 1:22583743‑M2/67‑10 (MQ=255) cGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtag > 1:4479681‑M2/1‑55 (MQ=255) cGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGAcc > 1:14597842/1‑67 (MQ=255) cGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGAcc > 1:18735101/1‑67 (MQ=255) gTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGGCGTTTACAGTGCCGACCGc < 1:33831717/68‑1 (MQ=255) tAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCg > 1:20000184/1‑65 (MQ=255) aGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTg > 1:33437467/1‑68 (MQ=255) aGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTg > 1:11279421/1‑68 (MQ=255) aGATGCCTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTg > 1:6377832/1‑68 (MQ=255) gATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTgg > 1:32359917/1‑68 (MQ=255) aTGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGt > 1:9601253/1‑68 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtagctaaaagc > 1:6261799‑M2/1‑48 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtagctaaaag > 1:35314291‑M2/1‑48 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTgg < 1:7721764/66‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTgg < 1:29498256/66‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTgg < 1:10157762/66‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGtt > 1:12991808/1‑68 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGtt < 1:24701760/68‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGt < 1:31648827/67‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGATGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtagctaaaag > 1:2099777‑M2/1‑48 (MQ=255) gCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGGCTGGttt > 1:1148250/1‑68 (MQ=255) gCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGttt > 1:19577888/1‑68 (MQ=255) cTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGtttt > 1:2526082/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:19327012/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:35819087/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:36200480/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:4858264/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:35903266/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:679998/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:18216292/1‑68 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:31107983/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:10831231/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:9041021/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:17184372/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:36831575/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:35190520/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGt < 1:12407806/68‑1 (MQ=255) aCGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:7433715/1‑66 (MQ=255) gCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:1377214/1‑68 (MQ=255) cACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt < 1:34103454/67‑1 (MQ=255) cACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt < 1:31258241/67‑1 (MQ=255) aCTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct > 1:31999510‑M2/1‑32 (MQ=255) aCTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttc > 1:2606191‑M2/1‑32 (MQ=255) aCTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:26809026/1‑66 (MQ=255) aCTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:28298438/1‑66 (MQ=255) aCTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:16680868/1‑66 (MQ=255) tAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTTCCGCGTCTATTCTTTg > 1:20688757/1‑67 (MQ=255) tAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTg > 1:15649137/1‑67 (MQ=255) tAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTg < 1:17495677/67‑1 (MQ=255) tAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTg > 1:4137804/1‑67 (MQ=255) tAATTGTGGTTTTAATTTTGGTCGTTTacagtcccgtagctaaaagcatctaacgtcctttcttcag > 1:1184996‑M2/1‑27 (MQ=255) ttgttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGa > 1:9728957/1‑68 (MQ=255) ttgttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGa > 1:15097346/1‑68 (MQ=255) ttgttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGa > 1:16306559/1‑68 (MQ=255) ttgttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGa > 1:16821234/1‑68 (MQ=255) ttgttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGa > 1:21687586/1‑68 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGCCCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:25072922/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCTaa > 1:29282884/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:30122156/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:13419355/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:14838509/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:1535791/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:17718194/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:2649294/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:3316766/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAAc < 1:36531461/68‑1 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGACTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGac > 1:27896552/1‑66 (MQ=255) tgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAAcc < 1:5998015/67‑1 (MQ=255) tgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCt > 1:21373552/1‑68 (MQ=255) tttACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCttt < 1:30703564/67‑1 (MQ=255) tACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGc > 1:32655404/1‑68 (MQ=255) tttGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATc > 1:34465895/1‑67 (MQ=255) gTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCccgcc > 1:19086438/1‑68 (MQ=255) gTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCccgcc > 1:7917447/1‑68 (MQ=255) tCGTTTTCAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCccgcc < 1:947598/67‑1 (MQ=255) tCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCccgcc < 1:10036450/67‑1 (MQ=255) tCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCccgcc < 1:25885385/67‑1 (MQ=255) tCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCccgcc > 1:24081374/1‑67 (MQ=255) gTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATTCCGCCGCt < 1:34777067/68‑1 (MQ=255) gTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCCGCCGCt < 1:1364809/68‑1 (MQ=255) ttACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCCGGCGCTGa < 1:35604517/68‑1 (MQ=255) tACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCCGCCGCTGa > 1:24224884/1‑67 (MQ=255) | CCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCCGCCGCTGA > CP009273/3333615‑3333748 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |