| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1242300 = | 945 (2.120) | 366 (0.870) | 54/106 | NT | 28.9% | coding (533/1698 nt) | treA | periplasmic trehalase |
| ? | CP009273 | = 1292972 | 906 (2.150) | coding (606/2676 nt) | adhE | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase/iron‑dependent alcohol dehydrogenase/pyruvate‑formate lyase deactivase | |||||
Only 100 of 1565 total aligned reads displayed.
CAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGT > CP009273/1292905‑1293038 | agTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTAt > 1:3323328/1‑67 (MQ=255) ttCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcg < 1:8945982‑M2/67‑4 (MQ=255) ttCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCgg < 1:9280833/68‑1 (MQ=255) ttatcTATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgac > 1:35023938‑M2/3‑63 (MQ=255) tCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgac > 1:25836319‑M2/1‑63 (MQ=255) tCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGc < 1:29934151/68‑1 (MQ=255) tCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGc < 1:31995799/68‑1 (MQ=255) cATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgact > 1:20093087‑M2/1‑62 (MQ=255) cATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgact > 1:27581332‑M2/1‑62 (MQ=255) cGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTa > 1:36415075/1‑68 (MQ=255) gATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttat > 1:28743989‑M2/1‑58 (MQ=255) gATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttat > 1:13876898‑M2/1‑58 (MQ=255) gATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTaa < 1:19124747/68‑1 (MQ=255) gATAACAACTGGAGTCTTGCAAGCGCCTTCACCGATAGCTGGTTTACCTTAGCTGTATGCGGCTTTaa < 1:7082103/68‑1 (MQ=255) aTAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTaa > 1:21747969/1‑67 (MQ=255) acTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGc > 1:22504664/1‑67 (MQ=255) ggAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCgg > 1:10442305/1‑68 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgacc < 1:34612651‑M2/66‑21 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgacc < 1:24697688‑M2/66‑21 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGa > 1:16734754/1‑67 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGa > 1:638767/1‑67 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGa > 1:15418840/1‑67 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGa > 1:19447953/1‑67 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGa > 1:1226002/1‑67 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGa > 1:7437700/1‑67 (MQ=255) gtTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGacca > 1:32483562/1‑67 (MQ=255) gtTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGacc < 1:4542663/66‑1 (MQ=255) tGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGAccacca > 1:26780470/1‑68 (MQ=255) ccGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTc > 1:11607015/1‑68 (MQ=255) ccGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTc > 1:11236569/1‑68 (MQ=255) ccGCGCCAACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGt < 1:22716771/67‑1 (MQ=255) cgcgCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTcg < 1:6763259/68‑1 (MQ=255) gcgcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaag > 1:29285301‑M2/1‑36 (MQ=255) gcgcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaag > 1:28257927‑M2/1‑36 (MQ=255) gcgcCTACAACGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaag > 1:15907444‑M2/1‑36 (MQ=255) gcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtc > 1:19782001‑M2/1‑34 (MQ=255) gcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagt > 1:23067484‑M2/1‑34 (MQ=255) gcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagt > 1:12025797‑M2/1‑34 (MQ=255) gcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagt > 1:30162692‑M2/1‑34 (MQ=255) gcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagt > 1:488357‑M2/1‑34 (MQ=255) gcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGa > 1:34313373/1‑68 (MQ=255) ccTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTcgcgtg > 1:10957071/1‑66 (MQ=255) ccTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAg > 1:23900706/1‑68 (MQ=255) cTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAgg < 1:14107824/68‑1 (MQ=255) tACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGa < 1:13269028/68‑1 (MQ=255) tACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGa < 1:14803021/68‑1 (MQ=255) tACACCGATAGCAGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGGCGCGAGGa < 1:26159158/68‑1 (MQ=255) acacCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTGGCGAGGAt < 1:18543591/68‑1 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaaca < 1:31159198‑M2/68‑41 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:8133557/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:34849780/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:36010323/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:37126135/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:4151954/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:2737502/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:18278725/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:16275607/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCAGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:33732026/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGATTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGCGGATCa > 1:22077505/1‑68 (MQ=255) ccGATAGCTGGTTTACCGGTGCTGTATGCGGCTTTAACCATGGCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAg < 1:27900017/68‑1 (MQ=255) ccGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacat > 1:32889512‑M2/1‑27 (MQ=255) ccGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAg < 1:17910113/68‑1 (MQ=255) cGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAgg < 1:5607867/68‑1 (MQ=255) gATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGt < 1:12920374/68‑1 (MQ=255) gATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGt < 1:20452787/68‑1 (MQ=255) gATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGt < 1:36870300/68‑1 (MQ=255) gATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGt < 1:3883995/68‑1 (MQ=255) aTAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGtt > 1:2071125/1‑68 (MQ=255) tAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtg > 1:27061115‑M2/1‑23 (MQ=255) aGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGa > 1:15111477/1‑68 (MQ=255) aGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGa > 1:25047847/1‑68 (MQ=255) cTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg > 1:21184764/1‑68 (MQ=255) cTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg > 1:5211422/1‑68 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagt > 1:17523924‑M2/1‑19 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGAt < 1:24244236/66‑1 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg < 1:35669034/67‑1 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg < 1:26494924/67‑1 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg < 1:30914420/67‑1 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg < 1:18910206/67‑1 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg < 1:10000724/67‑1 (MQ=255) ggTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg > 1:33978088/1‑66 (MQ=255) ggTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTc < 1:23335747/68‑1 (MQ=255) ggTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTc < 1:3531578/68‑1 (MQ=255) ggTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCAAGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTc < 1:17187527/68‑1 (MQ=255) aCCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagtaactgt > 1:14390241‑M2/1‑13 (MQ=255) aCCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagtaactgt > 1:8517676‑M2/1‑13 (MQ=255) aCCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagtaactgt > 1:28920070‑M2/1‑13 (MQ=255) aCCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGggt > 1:33496623/1‑68 (MQ=255) cGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagtaactgtcc > 1:768980‑M2/1‑11 (MQ=255) cGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGggtgg < 1:25467743/68‑1 (MQ=255) cGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGggtgg > 1:30434091/1‑68 (MQ=255) ggAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGggtggt < 1:21505507/68‑1 (MQ=255) ggAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGggtggt < 1:6146380/68‑1 (MQ=255) aGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagtaactgtccca > 1:13599792‑M2/1‑8 (MQ=255) gCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGAt > 1:9623950/1‑54 (MQ=255) gCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCa > 1:5940051/1‑68 (MQ=255) gCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCa > 1:29722672/1‑68 (MQ=255) gCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCa > 1:12612768/1‑68 (MQ=255) tGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagtaactgtcccagt > 1:31495813‑M2/1‑5 (MQ=255) tGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagtaactgtcccagt > 1:28499737‑M2/1‑5 (MQ=255) | CAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGT > CP009273/1292905‑1293038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |