| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3147712 | 283 (0.640) | 19 (0.050) | 10/94 | NT | 6.3% | coding (866/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD |
| ? | CP009273 | = 3147725 | 331 (0.890) | coding (853/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD | |||||
Only 100 of 504 total aligned reads displayed.
CCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGG > CP009273/3147659‑3147792 | cccccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGAc > 1:20127263/1‑67 (MQ=255) ccccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgc > 1:19075085‑M2/1‑66 (MQ=255) cccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgc < 1:11843120‑M2/67‑3 (MQ=255) cGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgca > 1:1033970‑M2/1‑63 (MQ=255) cGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgca > 1:27396033‑M2/1‑63 (MQ=255) ggCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgca < 1:12158767‑M2/67‑6 (MQ=255) gCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatc < 1:12461101‑M2/68‑8 (MQ=255) cGTCACACCGAAGTACCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatc > 1:33353726‑M2/1‑60 (MQ=255) cGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatc < 1:7469062‑M2/67‑8 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgca > 1:8763248‑M2/1‑57 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:10737817/67‑1 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:2112899/67‑1 (MQ=255) cacaCCGAAGAAACGTTAAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCGGACgcgcatcgca > 1:23734916‑M2/1‑57 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgctgct > 1:34761338/1‑67 (MQ=255) ccGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCtgctgc < 1:29765206/68‑1 (MQ=255) ccGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCtgctgc < 1:19759046/68‑1 (MQ=255) ccGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCtgctgc < 1:696772/68‑1 (MQ=255) aGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTg > 1:22002874/1‑68 (MQ=255) aGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTg > 1:4119340/1‑68 (MQ=255) aGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTg > 1:32648608/1‑68 (MQ=255) aGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTg > 1:12807067/1‑68 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTgg < 1:23180470/66‑1 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTgg < 1:10050741/66‑1 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTgg < 1:17923060/66‑1 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGcc < 1:2793788/68‑1 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGcc < 1:22542960/68‑1 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGcc < 1:8573447/68‑1 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGcc < 1:6390620/68‑1 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGc < 1:29274811/67‑1 (MQ=255) cGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttagccgtgagt > 1:18704979‑M2/1‑44 (MQ=255) cGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCtt < 1:26889138/68‑1 (MQ=255) cGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCt > 1:13088498/1‑67 (MQ=255) gTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTc > 1:22219933/1‑68 (MQ=255) ttAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCa < 1:7134454/67‑1 (MQ=255) aaCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGcc < 1:17524798/68‑1 (MQ=255) aaCTCACGGCTAAATTGCCATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaac > 1:252556‑M2/1‑38 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacg > 1:14044704‑M2/1‑37 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacg > 1:30959768‑M2/1‑37 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCg > 1:13830576/1‑68 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCg < 1:11062893/68‑1 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCg > 1:35323772/1‑68 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCg > 1:4584990/1‑67 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:14675826/68‑1 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:30705829/68‑1 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:31249737/68‑1 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:14985139/68‑1 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:34581641/68‑1 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:36687444/68‑1 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGAGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:24307239/68‑1 (MQ=255) tCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacgtt > 1:30364709‑M2/1‑35 (MQ=255) tCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTc < 1:34926411/68‑1 (MQ=255) tCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTc > 1:17252862/1‑68 (MQ=255) cGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATg < 1:9610538/68‑1 (MQ=255) cTAATTTGCGACGAGCTTTCATATCCTACTCTCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGga < 1:1440350/67‑1 (MQ=255) cTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGga < 1:3005962/67‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:4683099/68‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:4261304/68‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:25704470/68‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:22727353/68‑1 (MQ=255) aTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatc < 1:16368262/68‑1 (MQ=255) tGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCCTGCCGTCATGGATGatca > 1:30611988/1‑67 (MQ=255) tGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatca > 1:26602069/1‑67 (MQ=255) gATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatca > 1:2048810/1‑67 (MQ=255) gATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatca > 1:33640116/1‑67 (MQ=255) gATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatca > 1:32053468/1‑67 (MQ=255) gATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatca > 1:22317424/1‑67 (MQ=255) gATGCGCTTTCATAGACGACGCGCTTCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatcat < 1:14282957/68‑1 (MQ=255) tGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatcatc < 1:28582358/67‑1 (MQ=255) tGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATcc > 1:21785642/1‑68 (MQ=255) tGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATcc > 1:21662891/1‑68 (MQ=255) tttCATAGCCTACGCTCATCGCTGCTGCGCGGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgagc < 1:9095742/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:13223383/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:15785929/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:5582285/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:29448196/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:370478/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:167986/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:33162567/67‑1 (MQ=255) tatCATAGCCGACGCGCTTCGCGGCTGCGCTGGCCGTCATGCCGTCATGGATGATCATCATgcgcgc < 1:8000173/65‑1 (MQ=255) ttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCt < 1:28933872/68‑1 (MQ=255) ttCATACCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCt < 1:15623985/68‑1 (MQ=255) tCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCtt < 1:13574757/68‑1 (MQ=255) cATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCGTa > 1:5411054/1‑68 (MQ=255) cATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGAGCATCGTCCGCGCCTTa > 1:36061321/1‑68 (MQ=255) aTAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTAt > 1:35628013/1‑68 (MQ=255) aTAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTAt > 1:4880668/1‑68 (MQ=255) aGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGc > 1:32868740/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATgga > 1:28154385/1‑65 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCa > 1:30553803/1‑67 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:5886118/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:20610925/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:27523812/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGAGCCTTATGCAg > 1:19469298/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATAGCTGCTGCGCTGGACTTCATGCCGTCTTGGATGCTCATCATCCGCGCGTtgtggtg > 1:1611127/1‑65 (MQ=255) cGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGa < 1:32134792/68‑1 (MQ=255) gtcgcgCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGa < 1:15484109/65‑1 (MQ=255) cgcgCATCGCTGCTTCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACg < 1:24030721/67‑1 (MQ=255) cgcgCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACgg > 1:18865540/1‑68 (MQ=255) cgcgCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACg < 1:21338557/67‑1 (MQ=255) cgcgCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACg < 1:24734560/67‑1 (MQ=255) | CCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGG > CP009273/3147659‑3147792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |