New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5133802 = | 18 (0.670) | 6 (0.230) | 5/278 | 2.5 | 27.3% | coding (300/438 nt) | PP_4515 | MarR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 5133835 = | 15 (0.590) | coding (267/438 nt) | PP_4515 | MarR family transcriptional regulator |
GCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACA > NC_002947/5133705‑5133980 | gcATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGcc > 1:422773/1‑150 (MQ=255) ctgcatgACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCg < 2:391784/144‑1 (MQ=255) tGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGc < 2:76299/150‑1 (MQ=255) ccGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTgcg > 2:88354/1‑150 (MQ=255) tCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAgg < 1:577994/150‑1 (MQ=255) aCAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGAc > 2:518666/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGt > 1:240109/1‑150 (MQ=255) cGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGc < 1:119764/150‑1 (MQ=255) tcGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGctc > 1:97987/1‑150 (MQ=255) cGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGctct > 1:335117/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGc > 1:473152/1‑150 (MQ=255) ggcgggcgaagaagattgtactgtgcccgccgATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCAcc > 1:398194‑M2/33‑60 (MQ=255) ggcgggcgaagaagattgtactgtgcccgccgATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCAcc < 2:398194‑M2/28‑1 (MQ=255) ggcgaagaagattgtactgtgcccgccgATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGcttctt > 1:375495‑M2/29‑150 (MQ=255) ggcgaagaagattgtactgtgcccgccgATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGAGCAAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGATGTGTCGGGgcttcta > 1:375479‑M2/29‑149 (MQ=255) agaagattgtactgtgcccgccgATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAg > 1:20684‑M2/24‑150 (MQ=255) tACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCg > 2:570071/1‑150 (MQ=255) ttcGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTgc < 1:445429/150‑1 (MQ=255) ttcGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTgc < 1:421133/150‑1 (MQ=255) ttcGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTgc < 1:421129/150‑1 (MQ=255) tgtgcccgccgATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTgc > 2:312544‑M2/12‑150 (MQ=255) gccgATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACTCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAaca > 1:85075‑M2/5‑150 (MQ=255) | GCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACA > NC_002947/5133705‑5133980 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |