| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1811061 = | 14 (0.840) | 3 (0.190) | 3/270 | 1.8 | 22.1% | coding (334/708 nt) | ispD | 2‑C‑methyl‑D‑erythritol 4‑phosphate cytidylyltransferase |
| ? | NC_002947 | 1811088 = | 8 (0.510) | coding (361/708 nt) | ispD | 2‑C‑methyl‑D‑erythritol 4‑phosphate cytidylyltransferase | |||||
CGTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACACCCTCAAGCGTGCCGACAGCCATGGCCGGGTGAGTGCTACCGTGGACCGCA > NC_002947/1810974‑1811211 | cgTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGgacgac > 2:319139/1‑150 (MQ=255) gAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCg < 1:319139/150‑1 (MQ=255) gACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGc < 1:98587/150‑1 (MQ=255) tCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCctg > 1:359093/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTg > 2:55471/1‑150 (MQ=255) gccagcaggccacccaccgggtcgtccgccagctccgacaacagcttgtccaggtcGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCt < 1:191753‑M1/32‑1 (MQ=255) gccagcaggccacccaccgggtcgtccgccagctccgacaacagcttgtccaggtcGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCt > 2:191753‑M1/57‑88 (MQ=255) ctgcATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACAcc < 2:335096/150‑1 (MQ=255) cATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACACCCTc < 1:167426/150‑1 (MQ=255) cACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACACCCTCAAGCGTGCCGACAGCCATGGCCGGGTGAGTGCTACCGTg < 1:275134/150‑1 (MQ=255) aggtcgctgcgcgccaggttcggccgcgcagcGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGc < 1:191753‑M2/56‑1 (MQ=255) aggtcgctgcgcgccaggttcggccgcgcagcGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGc > 2:191753‑M2/33‑88 (MQ=255) ctgcgcgccaggttcggccgcgcagcGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACACCCTCAAGCGTGCCGACAGCCATGGCCGGGTGAGTGCTACCGTGGACCgca > 2:230510‑M2/27‑150 (MQ=255) | CGTGAACGCGCTGACTCGGTGCTTAACGCCTTGCTGGTGCTGCATGCCCAGGGGGCGGCGGACAGCGACTGGGTGCTGGTGCACGATGCTGCGCGGCCGAACCTGGCGCGCAGCGACCTGGACAAGCTGTTGTCGGAGCTGGCGGACGACCCGGTGGGTGGCCTGCTGGCGGTGCCGGCGCGCGACACCCTCAAGCGTGCCGACAGCCATGGCCGGGTGAGTGCTACCGTGGACCGCA > NC_002947/1810974‑1811211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |