| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1617825 = | 20 (0.520) | 12 (0.350) | 9/234 | 1.1 | 43.9% | intergenic (‑38/+135) | PP_1417/PP_1418 | tricarboxylate transport protein TctB/tricarboxylate transport protein TctC |
| ? | NC_002947 | 1617914 = | 13 (0.380) | intergenic (‑127/+46) | PP_1417/PP_1418 | tricarboxylate transport protein TctB/tricarboxylate transport protein TctC | |||||
CTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCG > NC_002947/1617839‑1618038 | CTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGcc < 1:36202‑M1/136‑1 (MQ=255) cgatacgatgcttcgtacagatcgcatcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAgc > 1:745825‑M2/60‑136 (MQ=255) cgatacgatgcttcgtacagatcgcatcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAgc > 1:102602‑M2/60‑136 (MQ=255) gatacgatgcttcgtacagatcgcatcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTcc > 1:181999‑M2/59‑76 (MQ=255) gatacgatgcttcgtacagatcgcatcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTcc < 2:181999‑M2/18‑1 (MQ=255) gatgcttcgtacagatcgcatcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGc < 2:780191‑M2/60‑1 (MQ=255) gatgcttcgtacagatcgcatcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGc > 1:780191‑M2/54‑113 (MQ=255) aTCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTg > 1:325398/1‑136 (MQ=255) aTCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTg > 2:76310/1‑136 (MQ=255) aTCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTg > 2:101378/1‑136 (MQ=255) catcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgctcGCGACGCAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGCCAGGCTTACTGGATCAGGCCGAAGGCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGcttc > 2:910060‑M2/36‑136 (MQ=255) catcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgatcGCGACGCAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTACGCCACTTgcttg > 2:907081‑M2/36‑135 (MQ=255) aTCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGcttct > 1:508614/1‑136 (MQ=255) gCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCGTCTTcac > 1:940833/1‑136 (MQ=255) gtgCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGCTCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATa > 1:377877/1‑136 (MQ=255) gtgCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGc > 1:617351/1‑39 (MQ=255) gtgCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGc < 2:617351/39‑1 (MQ=255) gtgCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATa > 1:278256/1‑136 (MQ=255) cAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTcaca > 1:791/1‑130 (MQ=255) cAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTcaca < 2:791/130‑1 (MQ=255) cAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCg > 2:467734/1‑136 (MQ=255) aGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCGTGTAGTCAGCCACGTGCTTCTTCACATAGCCgg > 2:467430/1‑135 (MQ=255) cagcttcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGc > 2:927255‑M2/18‑136 (MQ=255) cagcttcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGc > 1:382887‑M2/18‑136 (MQ=255) agcttcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTcaca > 2:737577‑M2/17‑123 (MQ=255) agcttcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTcaca < 1:737577‑M2/107‑1 (MQ=255) tcgcgcccgatcGCGACGCAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTcttg > 1:797811‑M2/13‑135 (MQ=255) tcgcgcccgatcCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTc > 1:60805‑M2/13‑136 (MQ=255) cgcgcccgatcCCGCCACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCATGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACATTCTTCTTCACATAGCCGTCCCGCTCTACg > 2:160125‑M2/12‑136 (MQ=255) | CTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCG > NC_002947/1617839‑1618038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |