New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 3787938 | 36 (0.510) | coding (697/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein |
CGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCG > NC_002947/3787761‑3788056 | cGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTc < 8:229840/149‑1 (MQ=255) cGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTc < 5:332192/149‑1 (MQ=255) cGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTc < 2:214697/149‑1 (MQ=255) 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2:140868‑M1/15‑149 (MQ=255) gcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCttgag < 3:166244‑M1/136‑1 (MQ=255) gTCCATGTTCCACGACGTCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCttgaggttga < 3:237570/149‑1 (MQ=255) tCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGgcg > 2:237597/1‑149 (MQ=255) | CGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCG > NC_002947/3787761‑3788056 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |