| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 3787908 = | 40 (0.570) | 31 (0.440) | 27/280 | 2.8 | 44.9% | coding (727/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 3787938 | 36 (0.510) | coding (697/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein | |||||
CAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTC > NC_002947/3787792‑3788086 | cagtGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTa > 2:302578/1‑147 (MQ=255)cAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtc < 3:124618‑M2/149‑3 (MQ=255) ccgaaagtgtagcgctgctcgtcacccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTaga > 3:111556‑M1/117‑149 (MQ=255) ccgaaagtgtagcgctgctcgtcacccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTaga > 3:95719‑M1/117‑149 (MQ=255) ccTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacga > 7:153682‑M2/1‑142 (MQ=255) tGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGt > 2:222479/1‑148 (MQ=255) aTGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAg > 1:317207/1‑148 (MQ=255) tGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGaa < 1:188550/149‑1 (MQ=255) gcgctgctcgtcacccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAAt > 3:104683‑M1/106‑149 (MQ=255) ccGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGAt < 2:317207/149‑1 (MQ=255) aaCAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCAACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGAtgtt < 1:222479/149‑1 (MQ=255) gtcacccgactcgccggccagggtgcgggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacatcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGcc < 1:214160‑M1/37‑1 (MQ=255) cAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaag > 4:124618‑M2/1‑126 (MQ=255) 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tcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCtt < 2:263391‑M1/81‑1 (MQ=255) gTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACATCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggcc < 1:214160‑M2/134‑38 (MQ=255) gTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTccaact > 6:320397/1‑144 (MQ=255) cacaCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTATCCAGCCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACCACCCCGACACCGGCAAGCTGCCGTAGACGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCATAAccc > 4:353286/1‑148 (MQ=255) ggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACt < 7:154518‑M1/76‑1 (MQ=255) ggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACt > 8:154518‑M1/64‑139 (MQ=255) ggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCg > 1:330774‑M1/64‑149 (MQ=255) aCCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCgg > 2:142474/1‑149 (MQ=255) cccGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgt < 8:83093‑M2/149‑58 (MQ=255) cccGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgt > 3:232460‑M2/1‑92 (MQ=255) 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tCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGgcg > 2:237597/1‑149 (MQ=255) gacgCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCAc > 7:278439/1‑149 (MQ=255) gCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGcc > 8:390467/1‑149 (MQ=255) cGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCg < 4:386171/148‑1 (MQ=255) cGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCg > 3:386171/1‑148 (MQ=255) aGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtcct < 1:140868‑M2/149‑133 (MQ=255) aGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCAGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACAGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGAATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCg > 4:176196/1‑147 (MQ=255) gCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtcctt > 6:396326‑M2/1‑16 (MQ=255) ggCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttga > 2:140868‑M2/1‑14 (MQ=255) gCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgag < 3:166244‑M2/149‑137 (MQ=255) cAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTAAGTCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCt > 7:343827/1‑147 (MQ=255) tGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGc < 4:137280/149‑1 (MQ=255) ccGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCt > 3:249265/1‑148 (MQ=255) ccGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTc < 5:320397/149‑1 (MQ=255) ccGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGa < 7:83093/148‑1 (MQ=255) gTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGt > 8:301419/1‑149 (MQ=255) tAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAgg < 6:17929/149‑1 (MQ=255) agagGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTc > 2:87632/1‑149 (MQ=255) | CAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGG‑TCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑CCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGATGTTC > NC_002947/3787792‑3788086 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |