New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 116151 | 79 (1.210) | 4 (0.060) | 4/252 | NT | 5.1% | coding (454/894 nt) | PP_0110 | CyoE‑like protoheme IX farnesyltransferase |
? | NC_002947 | = 116188 | 72 (1.160) | coding (491/894 nt) | PP_0110 | CyoE‑like protoheme IX farnesyltransferase |
GCGCTGCTGGGCATGGTCCTGCTGCTGGTGTTCACCAACGCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCG > NC_002947/116004‑116298 | gcgcTGCTGGGCATGGTCCTGCTGCTGGTGTTCACCAACGCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCgg > 7:212007/1‑149 (MQ=255) ggCATGGTCCTGCTGCTGGTGTTCACCAACGCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTCCTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTcc < 6:403194/149‑1 (MQ=255) ggCATGGTCCTGCTGCTGGTGTTCACCAACGCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTcc > 7:151593/1‑149 (MQ=255) 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aGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCATTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCAAc > 3:324499/1‑149 (MQ=255) aaCATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAAcc < 5:172025/83‑1 (MQ=255) aaCATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAAcc > 6:172025/1‑83 (MQ=255) aTCGTCATCGGTGGGCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCaa < 6:30390/149‑1 (MQ=255) aTCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCaa < 5:99718/149‑1 (MQ=255) cGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAag > 2:164498/1‑148 (MQ=255) 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ctggccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCaa < 1:380531/149‑1 (MQ=255) ctggccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCGTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGCCCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCaa > 6:219272/1‑149 (MQ=255) ggccGcttaccgccacccagccgagcaacggcggagcggcaccggccaggccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcaccgcataaccgagtaatgaggccagggtcagccaggcggtgagg > 2:208505‑M1/1‑5 (MQ=255) ggccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcggccaggccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcacc < 8:273869‑M2/107‑66 (MQ=255) ggccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcggccaggccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcacc > 7:273869‑M2/1‑42 (MQ=255) gccGcttaccgccacccagccgagcaacggcggagcggcaccggcgagaccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcaccgcataaccgagtaatgaggccagggtcagccaggcggtgagg < 2:328427‑M1/148‑145 (MQ=255) gccGcttaccgccacccagccgagcaacggcggagcggcaccggccaggccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcaccgcataaccgagtaatgaggccagggtcagccaggcggtgagg < 3:128217‑M1/148‑145 (MQ=255) gccGcttaccgccacccagccgagcaacggcggagcggcaccggccaggccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcaccgcataaccgagtaatgaggccagggtcagccaggcggtgagg < 6:290904‑M1/148‑145 (MQ=255) gccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcggccaggccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcaccgcataaccgagtaatgaggccagggtcagccaggcggtgaggg < 6:27664‑M2/149‑109 (MQ=255) gccGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGc > 5:65980/1‑149 (MQ=255) cGcttaccgccacccagccgagcaacggcggagcggcaccggccaggccaccgatgacgatgttctgtggcgtggcgcgcttgagaaagccggtgtagagcaccgcataaccgagtaatgaggccagggtcagccaggcggtgagggcg > 6:202297‑M1/1‑2 (MQ=255) | GCGCTGCTGGGCATGGTCCTGCTGCTGGTGTTCACCAACGCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGAATACGCCAAGGCCG > NC_002947/116004‑116298 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |