New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 116151 | 79 (1.210) | 4 (0.060) | 4/252 | NT | 5.1% | coding (454/894 nt) | PP_0110 | CyoE‑like protoheme IX farnesyltransferase |
? | NC_002947 | = 116188 | 72 (1.160) | coding (491/894 nt) | PP_0110 | CyoE‑like protoheme IX farnesyltransferase |
CGCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGACCCACGGCGAGCGC > NC_002947/116042‑116333 | cGCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcg > 6:202297‑M2/1‑147 (MQ=255) ccTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGTCTCGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcggc < 2:328427‑M2/148‑5 (MQ=255) ccTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGcggcc > 2:208505‑M2/1‑144 (MQ=255) 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aCCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCAt < 1:371761/147‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAg > 7:222445/1‑149 (MQ=255) gCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGcc > 2:282718/1‑148 (MQ=255) aCCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAAcc < 1:349398/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCt > 7:214728/1‑149 (MQ=255) 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ccgTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACGCCAAGGCCGATATCCCGa > 5:197752/1‑145 (MQ=255) gTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGc < 2:201769/149‑1 (MQ=255) cTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGt > 1:316742/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACg > 5:66464/1‑119 (MQ=255) cGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACg < 6:66464/119‑1 (MQ=255) ggCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGa < 1:164498/148‑1 (MQ=255) ggggCGGGAATCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTTCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGGCAATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGACCCACg < 1:282718/147‑1 (MQ=255) ggTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGACCCACGGCGAgc > 4:341920/1‑149 (MQ=255) ggTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGACCCACGGCGAgc > 7:235272/1‑149 (MQ=255) gTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGACCCACGGCGAgcg < 7:126275/149‑1 (MQ=255) tAAGCGGCCATGTGAGCGACGAACGCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCGGGCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACGCCAAGGCCGATATCCGGATGTTGCCGGTGACCCACGGCGAgcgc < 8:309491/149‑1 (MQ=255) | CGCCCTCACCGCCTGGCTGACCCTGGCCTCATTACTCGGTTATGCGGTGCTCTACACCGGCTTTCTCAAGCGCGCCACGCCACAGAACATCGTCATCGGTGGCCTGGCCGGTGCCGCTCCGCCGTTGCTCGGCTGGGTGGCGGTAAGCGGCCATGTCAGCGCCGAACCCTTGCTGCTTGTGTTGATCATTTTCGCCTGGACCCCGCCGCATTTCTGGGCGCTGGCCATCCACCGCAAGGAGG‑AATACGCCAAGGCCGATATCCCGATGTTGCCGGTGACCCACGGCGAGCGC > NC_002947/116042‑116333 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |