New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 230851 | 75 (1.230) | coding (512/1419 nt) | PP_0179 | putative efflux transporter |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CTTCAACGGTGGCGTCAAACTCGGCGCTCAGCGCTTGCAGGAGTCGGGCGAAGCCTTCCTGCAGCCCGAGAAGGTGCCGGTAGCCAACATCGGTGAGGCCATCATCAGTGCTTCGTACCAGTTCGACCTGTGGGGCACCTTCAAGCGTGGTACCGAGGCTGCCAAGGCAAATGCCGACGCGGTGCAGGCCGCTGCCGACACTGCCCGCATCACGCTTGTGGCGGACGTGGTCAAGGCTTATACCCAGGTGTGCTCGGCCAACGAGGAATACCACATTGCCCGTGAGTCCCTCG > NC_002947/230642‑230934 | cTTCAACGGTGGCGTCAAACTCGGCGCTCAGCGCTTGCAGGAGTCGGGCGAAGCCTTCCTGCAGCCCGAGAAGGTGCCGGTAGCCAACATCGGTGAGGCCATCATCAGTGCTTCGTACCAGTTCGACCTGTGGGGCACCTTCAAGCGTG > 5:231071‑M1/1‑149 (MQ=255) ttCAACGGTGGCGTCAAACTCGGCGCTCAGCGCTTGCAGGAGTCGGGCGAAGCCTTCCTGCAGCCCGAGAAGGTGCCGGTAGCCAACATCGGTGAGGCCATCATCAGTGCTTCGTACCAGTTCGACCTGTGGGGCACCTTCAAGCGTgg > 7:185070/1‑149 (MQ=255) ttCAACGGTGGCGTCAAACTCGGCGCTCAGCGCTTGCAGGAGTCGGGCGAAGCCTTCCTGCAGCCCGAGAAGGTGCCGGTAGCCAACATCGGTGAGGCCATCATCAGTGCTTCGTACCAGTTCGACCTGTGGGGCACCTTCAAGCGTgg > 7:311149/1‑149 (MQ=255) 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tCAAACTCGGCGCTCAGCGCTTGCAGGAGTCGGGCGAAGCCTTCCTGCAGCCCGAGAAGGTGCCGGTAGCCAACATCGGTGAGGCCATCATCAGTGCTTCGTACCAGTTCGACCTGTGGGGCACCTTCAAGCGTGGTACCGAGGCTGcc < 6:231071/149‑1 (MQ=255) aaaCTCGGCGCTCAGCGCTTGCAGGAGTCGGGCGAAGCCTTCCTGCAGCCCGAGAAGGTGCCGGTAGCCAACATCGGTGAGGCCATCATCAGTGCTTCGTACCAGTTCGACCTGTGGGGCACCTTCAAGCGTGatgcgggcagtgtcgg > 2:33245‑M1/1‑133 (MQ=255) aaaCTCGGCGCTCAGCGCTTGCAGGAGTCGGGCGAAGCCTTCCTGCAGCCCGAGAAGGTGCCGGTAGCCAACATCGGTGAGGCCATCATCAGTGCTTCGTACCAGTTCGACCTGTGGGGCACCTTCAAGCGTGGTACCGAGGCTGcc > 7:245095/1‑147 (MQ=255) aaCTCGGCGCTCAGCGCTTGCAGGAGTCGGGCGAAGCCTTCCTGCAGCCCGAGAAGGTGCCGGTAGCCAACATCGGTGAGGCCATCGTCAGTGCTTCGTACCAGTTCGACCTGTGGGGCACCTTCAAGCGTGGTACCGAGGCTGCCAAg > 7:213767/1‑149 (MQ=255) aCTCGGCGCTCAGCGCTTGCAGGAGTCGGGCGAAGCCTTCCTGCAGCCCGAGAAGGTGCCGGTAGCCAACATCGGTGAGGCCATCATCAGTGCTTCGTACCAGTTCGACCTGTGGGGCACCTTCAAGCGTGGTACCGAGGCTGCCAAgg < 7:25548/149‑1 (MQ=255) 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ttCAAGCGTGGTACCGAGGCTGCCAAGGCAAATGCCGACGCGGTGCAGGCCGCTGCCGACACTGCCCGCATCACGCTTGTGGCGGACGTGGTCAAGGCTTATACCCAGGTGTGCTCGGCCAACGAGGAATACCACATTGccc > 3:270698/1‑142 (MQ=255) cAAGCGTGGTACCGAGGCTGCCAAGGCAAATGCCGACGCGGTGCAGGCCGCTGCCGACACTGCCCGCATCACGCTTGTGGCGGACGTGGTCAAGGCTTATACCCAGGTGTGCTCGGCCAACGAGGAATACCACATTGCCCGTGAGTccc > 8:30674/1‑149 (MQ=255) aaGCGTGatgcgggcagtgtcggcagcggcctgcaccgcgtcggcatttgccttggcagcctcggtaccacgcttgaaggtgccccacaggtcgaactggtacgaagcactgatgatggcctcaccgatgttggctaccggcaccttct > 8:213767‑M1/1‑7 (MQ=255) aaGCGTGatgcgggcagtgtcggcagcggcctgcaccgcgtcggcatttgccttggcagcctcggtaccacgcttgaaggtgccccacaggtcgaactggtacgaagcactgatgatggcctcaccgatgttggctaccggcaccttct > 7:77530‑M1/1‑7 (MQ=255) aaGCGTGatgcgggcagtgtcggcagcggcctgcaccgcgtcggcatttgccttggcagcctcggtaccacgcttgaaggtgccccacaggtcgaactggtacgaagcactgatgatggcctcaccgatgttggc > 6:185652‑M1/1‑7 (MQ=255) aaGCGTGatgcgggcagtgtcggcagcggcctgcaccgcgtcggcatttgccttggcagcctcggtaccacgcttgaaggtgccccacaggtcgaactggtacgaagcactgatgatggcctcaccgatgttggc < 5:185652‑M1/135‑129 (MQ=255) aaGCGTGatgcgggcagtgtcggcagcggcctgcaccgcgtcggcatttgccttggcagcctcggtaccacgcttgaaggtgccccac < 8:179602‑M1/88‑82 (MQ=255) aaGCGTGatgcgggcagtgtcggcagcggcctgcaccgcgtcggcatttgccttggcagcctcggtaccacgcttgaaggtgccccac > 7:179602‑M1/1‑7 (MQ=255) gCGTGatgcgggcagtgtcggcagcggcctgcaccgcgtcggcatttgccttggcagcctcggtaccacgcttgaaggtgccccacaggtcgaactggtacgaagcactgatgatggcctcaccgatgttggctaccggcaccttctcg < 4:243043‑M1/149‑145 (MQ=255) tGatgcgggcagtgtcggcagcggcctgcaccgcgtcggcatttgccttggcagcctcg < 5:150243‑M1/59‑58 (MQ=255) tGatgcgggcagtgtcggcagcggcctgcaccgcgtcggcatttgccttggcagcctcg > 6:150243‑M1/1‑2 (MQ=255) | CTTCAACGGTGGCGTCAAACTCGGCGCTCAGCGCTTGCAGGAGTCGGGCGAAGCCTTCCTGCAGCCCGAGAAGGTGCCGGTAGCCAACATCGGTGAGGCCATCATCAGTGCTTCGTACCAGTTCGACCTGTGGGGCACCTTCAAGCGTGGTACCGAGGCTGCCAAGGCAAATGCCGACGCGGTGCAGGCCGCTGCCGACACTGCCCGCATCACGCTTGTGGCGGACGTGGTCAAGGCTTATACCCAGGTGTGCTCGGCCAACGAGGAATACCACATTGCCCGTGAGTCCCTCG > NC_002947/230642‑230934 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |