New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 317963 = | 59 (0.910) | 5 (0.080) | 5/258 | NT | 7.1% | coding (1779/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 318058 = | 73 (1.150) | coding (1684/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
GCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGTGCGGGTCTTGGTGGTGA > NC_002947/317815‑318111 | gcgACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGGCGAGGGGTCATCCGAATTGGGCAATGTAgcg > 6:36164/1‑149 (MQ=255) ccgagcagcgtgatgactgcgtctacctgtacatccgtgacaacggcccccggcttcagccgccaggccctggagcacgccaaggagccgttcttcaccaccaagacccgcacccagggcctgggcctggggctggccatctgtgaaag < 1:100835‑M1/1‑1 (MQ=255) ccgagcagcgtgatgactgcgtctacctgtacatccgtgacaacggccccggcttcagccgccaggccctggagcacgccaaggagccgttcttcaccaccaagacccgcacccagggcctgggcctggggctggccatctgtgaaaGc < 6:265369‑M1/2‑1 (MQ=255) ccgagcagcgtgatgactgcgtctacctgtacatccgtgacaacggccccggcttcagccgccaggccctggagcacgccaaggagccgttcttcaccaccaagacccgcacccagggcctgggcctggggctggccatctgtgaaaGc > 1:382547‑M1/148‑149 (MQ=255) gACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAgcgc > 1:350301/1‑148 (MQ=255) cgagcagcgtgatgactgcgtctacctgtacatccgtgacaacggccccggcttcagccgccaggccctggagcacgccaaggagccgttcttcaccaccaagacccgcacccagggcctgggcctggggctggccatctgtgaaaGcc < 7:159538‑M1/3‑1 (MQ=255) aCTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCa < 4:79655/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGc > 7:206331/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGCTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGc > 1:286393/1‑149 (MQ=255) gAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCgg < 1:346114/148‑1 (MQ=255) gAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCgg < 2:193507/148‑1 (MQ=255) gCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCa > 1:23513/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGAGCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCa > 7:340445/1‑149 (MQ=255) cccGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCAc < 3:255819/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGAGCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCg > 1:404791/1‑149 (MQ=255) cAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑Gga < 5:36164/148‑1 (MQ=255) tGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGACTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCGTGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAg > 7:231789/1‑148 (MQ=255) tCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTg > 8:123963/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTg > 8:285764/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCAGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTg > 6:248033/1‑149 (MQ=255) ggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTgcgc > 4:196237/1‑148 (MQ=255) gTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGggtg < 2:23513/149‑1 (MQ=255) gggTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTg < 2:350301/149‑1 (MQ=255) ggTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTgg > 5:377057/1‑149 (MQ=255) gTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCAc > 3:138025/1‑104 (MQ=255) gTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCAc > 3:132067/1‑104 (MQ=255) gTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCAc < 4:132067/104‑1 (MQ=255) gTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCAc < 4:138025/104‑1 (MQ=255) tCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTg < 7:78473/140‑1 (MQ=255) tCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTg > 8:78473/1‑140 (MQ=255) cagcaGGTTGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGGCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTTCCGCCAGATGCGGCCACGCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGTTTGGCcagcagca < 1:126843/145‑1 (MQ=255) ccaGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGtt > 5:97187/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCTCGGCTGGCGATCAGTGGCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCa < 4:329968/149‑1 (MQ=255) caaggagccgttcttcaccaccaagacccgcacccagggcctgggcctggggctggccatctgtgaaaGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAg < 5:32450‑M1/81‑1 (MQ=255) cTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGgcgc < 6:97187/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGgcgcg > 5:165990/1‑149 (MQ=255) ggCTGTCGATCAGTGTCTCTGTGGTGATTCCGAGGGGTCCTCCGAATTGTTCAAAGTAGCGCCAGATGCGGGCACCCGCATCT‑TTAGAGTCATCATTTCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCATCAGCAGTTCACCGACCAGGGCGCTCa < 4:391374/149‑1 (MQ=255) ggCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCa > 2:366563/1‑149 (MQ=255) cTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATc < 8:114292/149‑1 (MQ=255) tGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGgc > 8:286004/1‑141 (MQ=255) tGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGgc < 7:286004/141‑1 (MQ=255) tCGATCCGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCa < 8:340445/147‑1 (MQ=255) tCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAgg > 7:125259/1‑149 (MQ=255) caccaccaagacccgcacccagggcctgggcctggggctggccatctgtgaaaGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCCCACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAgg > 1:105617‑M1/54‑148 (MQ=255) aTCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCtt < 1:366563/149‑1 (MQ=255) tCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCttt < 1:207465/149‑1 (MQ=255) tCAGTGTCTCGGTGGTCATGCAGAGGGTTACTCAGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCGGCT‑GGAGAGGCAGCATTGCGCC‑ACGGTCCGGGGGGGTGGGCAGCAGCAGTTGCCCGGCGAGGGGGCGGATCAGGCttt > 6:316950/1‑149 (MQ=255) cAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCttt > 7:318854/1‑148 (MQ=255) accaagacccgcacccagggcctgggcctggggctggccatctgtgaaaGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTca > 6:32450‑M1/50‑149 (MQ=255) aGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTca < 3:330847/149‑1 (MQ=255) aGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTca < 3:196237/149‑1 (MQ=255) caagacccgcacccagggcctgggcctggggctggccatctgtgaaaGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTca < 5:414478‑M1/100‑1 (MQ=255) gacccgcacccagggcctgggcctggggctggccatctgtgaaaGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGAt > 6:414478‑M1/45‑149 (MQ=255) gtGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGccc < 8:231789/147‑1 (MQ=255) aGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCcccaggccc > 6:76008/1‑149 (MQ=255) aGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCcccaggcc > 5:311407/1‑148 (MQ=255) ggTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAACcccaggcccagg > 5:165096/1‑149 (MQ=255) ctccGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCt < 8:33756/149‑1 (MQ=255) tccGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCCGGTGCTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCATg > 5:126575/1‑149 (MQ=255) ccGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCACTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTgg < 6:125650/149‑1 (MQ=255) cGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTgg < 8:318854/148‑1 (MQ=255) cGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTgg < 5:76008/148‑1 (MQ=255) cGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTg < 7:123963/147‑1 (MQ=255) gAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGt > 7:209532/1‑149 (MQ=255) ttGGGCTAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGGAGCT‑GGTGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCAATGATGGCCAGCCCCAGTCCCAGGCCCTGGGTGc < 6:126575/148‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGTGc > 1:276388/1‑149 (MQ=255) tGGGCAACGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGTGCgg < 7:5320/149‑1 (MQ=255) ggCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGTGCggg < 1:207048/148‑1 (MQ=255) ggCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGTGCGGGt > 2:74001/1‑149 (MQ=255) aaaGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGTGCGGGTCtt < 1:74001/149‑1 (MQ=255) aaGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGGGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCCTCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGTGCGGGTCTtg < 8:206331/149‑1 (MQ=255) cgcCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGGcctgggcctggggctg < 2:36756/136‑5 (MQ=255) cgcCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGTGCGGGTCTTGgtggtg < 2:404791/149‑1 (MQ=255) cgcCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGACAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGGcctgggcctggggctg > 1:36756/1‑132 (MQ=255) GCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGTGCGGGTCTTGGTGGTGa > 7:285764‑M1/1‑149 (MQ=255) | GCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCT‑GGAGAGTCAGCATTGCGCC‑ACCTTCCGGGTGGTTGGCCAGCAGCAGTTCACCGCCCAGGGCGCGCATCAGGCTTTCACAGATGGCCAGCCCCAGGCCCAGGCCCTGGGTGCGGGTCTTGGTGGTGA > NC_002947/317815‑318111 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |