| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1294685 = | 98 (1.510) | 8 (0.130) | 8/250 | NT | 8.2% | coding (166/465 nt) | slyB | outer membrane lipoprotein |
| ? | NC_002947 | 1294721 = | 87 (1.410) | coding (202/465 nt) | slyB | outer membrane lipoprotein | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CTGGTGGCGACCTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAG > NC_002947/1294538‑1294829 | acgaacggtaatttcgacaccttgggtacgggtcaagccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatg > 8:122488‑M1/148‑148 (MQ=255) gaacggtaatttcgacaccttgggtacgggtcaagccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatGGCa < 6:78170‑M1/4‑1 (MQ=255) gtggCGACCTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCa < 4:174856/148‑1 (MQ=255) aacggtaatttcgacaccttgggtacgggtcaagccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatGGCAc > 5:329026‑M1/145‑149 (MQ=255) acggtaatttcgacaccttgggtacgggtcaagccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcaccgcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatGGCAcc > 1:121826‑M1/144‑149 (MQ=255) ggtaatttcgacaccttgggtacgggtcaagccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatGGCACCaa < 3:190993‑M1/8‑1 (MQ=255) gACCTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGa > 6:231587/1‑149 (MQ=255) aCCTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGAc < 8:43839/149‑1 (MQ=255) cTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGTCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGAccc < 3:64603/149‑1 (MQ=255) cTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCGCCaatcggg > 5:395931/1‑144 (MQ=255) accaccATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGAt > 2:314728/1‑149 (MQ=255) ccaccaTGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGAtt > 4:302330/1‑149 (MQ=255) caccaTGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTg > 4:207329/1‑149 (MQ=255) caccaTGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTg > 7:162961/1‑149 (MQ=255) accaTGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTgg < 1:391850/149‑1 (MQ=255) ccttgggtacgggtcaagccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatGGCACCAAGACCCCGATTggc < 1:268932‑M1/21‑1 (MQ=255) gTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGgcggcg > 6:278552/1‑149 (MQ=255) gtacgggtcaagccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggttacaccgcccacgatGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGt < 6:408275‑M1/27‑1 (MQ=255) 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tgCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCg < 5:278552/149‑1 (MQ=255) gCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCg‑g > 7:137094/1‑149 (MQ=255) cTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGgtg‑gtg > 8:140967/1‑149 (MQ=255) tCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑gtg > 1:89245/1‑148 (MQ=255) tCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑gtg > 4:139808/1‑148 (MQ=255) gCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGcc > 8:35732/1‑149 (MQ=255) gCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GGGTAGcc < 7:280848/149‑1 (MQ=255) ccTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGt < 8:152001/127‑1 (MQ=255) ccTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGATGGt > 7:152001/1‑127 (MQ=255) tGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCgg > 7:307363/1‑148 (MQ=255) aCCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCa < 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(MQ=255) aCCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGAG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGAt < 6:364343/149‑1 (MQ=255) ccGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGCGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGAt < 1:314728/149‑1 (MQ=255) ccGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATc > 3:322649/1‑149 (MQ=255) tGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGt > 4:182270/1‑149 (MQ=255) tATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCg < 3:207329/149‑1 (MQ=255) aCCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCgg > 6:179977/1‑149 (MQ=255) aCCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCgg < 3:182270/149‑1 (MQ=255) ccATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGt < 1:85695/149‑1 (MQ=255) cATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGt < 4:119307/64‑1 (MQ=255) cATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGt > 3:119307/1‑64 (MQ=255) cGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCt > 5:270016/1‑149 (MQ=255) aaTCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTg > 5:78170/1‑149 (MQ=255) cccTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCgg < 2:372368/127‑1 (MQ=255) cccTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCgg > 1:372368/1‑127 (MQ=255) cccTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCg > 2:212809/1‑149 (MQ=255) ccTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCgg > 4:260772/1‑149 (MQ=255) ccTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCgg < 7:156348/149‑1 (MQ=255) cTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCggg > 6:99392/1‑149 (MQ=255) cTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCggg > 4:74446/1‑149 (MQ=255) tGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGt > 8:196909/1‑149 (MQ=255) cGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCTTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCgca < 6:406491/149‑1 (MQ=255) cGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCgca < 3:40062/149‑1 (MQ=255) cGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCgca < 3:248416/149‑1 (MQ=255) tCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCgcagca < 5:99392/149‑1 (MQ=255) aaGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGcagcag > 6:163714/1‑148 (MQ=255) aaGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGcagcag > 3:139734/1‑148 (MQ=255) aGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCagaa < 3:74446/149‑1 (MQ=255) gATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCagaag > 1:144204/1‑149 (MQ=255) tCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCagaag > 2:196983/1‑147 (MQ=255) | CTGGTGGCGACCTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAG > NC_002947/1294538‑1294829 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |