New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAGGTGTCGAAATTACCGTTCGTGA > NC_002947/1294573‑1294869 | agccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCa > 3:390906‑M1/113‑149 (MQ=255) gccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCAt > 2:268932‑M1/112‑149 (MQ=255) gggCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCg > 5:44799/1‑149 (MQ=255) 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tgCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCg < 5:231587/149‑1 (MQ=255) cTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGgtg‑gtg > 8:140967/1‑149 (MQ=255) tCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑gtg > 4:139808/1‑148 (MQ=255) gCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGcc > 8:35732/1‑149 (MQ=255) gCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GGGTAGcc < 7:280848/149‑1 (MQ=255) 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aGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCagaa < 3:74446/149‑1 (MQ=255) gATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCagaag > 1:144204/1‑149 (MQ=255) cacgatggcaccagcaccgccgccaatcggngtcttggtgccCTCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCagaag > 1:38125‑M2/43‑148 (MQ=255) tCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCagaag > 2:196983/1‑147 (MQ=255) gAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGaagaag < 4:13280/148‑1 (MQ=255) tggcaccagcaccgccgccaatcggggtcttggtgccATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCt > 3:390906‑M2/38‑149 (MQ=255) caccagcaccgccgccaatcggggtcttggtgccATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTTGCTGCCGTGATAGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGGTCCGCAGCCGAATAAAGCTtgg > 2:381649‑M2/35‑148 (MQ=255) accagcaccgccgccaatcggggtcttggtgccATCGTGGGCG‑GTGTAACCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGAc > 5:408275‑M2/34‑149 (MQ=255) ACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGAc > 7:87479‑M1/1‑149 (MQ=255) CAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGAccc < 1:31335‑M1/149‑1 (MQ=255) accgccgccaatcggggtcttggtgccATCGTGGGCG‑GTGTAACCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTAc < 6:408275‑M2/122‑1 (MQ=255) aCCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTAc < 1:212809/149‑1 (MQ=255) aCCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTAc < 2:144204/149‑1 (MQ=255) aCCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGAGCGGTGCCGTGGCCGGTGGGTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTAc < 3:363986/149‑1 (MQ=255) cccGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCggg < 1:208208/117‑1 (MQ=255) cccGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCggg > 2:208208/1‑117 (MQ=255) cccGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTAcc > 6:294035/1‑148 (MQ=255) gATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGTTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAg < 5:179977/149‑1 (MQ=255) gATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAg < 5:294035/149‑1 (MQ=255) gATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAg < 1:196983/149‑1 (MQ=255) gATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAg < 7:196909/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAATGCTTGACCCGTACCCAAGGTGTCGAAAt > 3:98870/1‑149 (MQ=255) tGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAGgtgt > 8:368966/1‑141 (MQ=255) ttggtgccATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAGGTGTCGAAATTAcc < 3:190993‑M2/141‑1 (MQ=255) cTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAGGTGTCGAAATTAcc < 7:32559/149‑1 (MQ=255) ggtgccATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCGGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAGGTGTCGAAATTACCGt > 1:121826‑M2/7‑149 (MQ=255) gtgccATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAGGTGTCGAAATTACCGtt > 5:329026‑M2/6‑149 (MQ=255) tgccATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAGGTGTCGAAATTACCGTTc < 6:78170‑M2/145‑1 (MQ=255) cATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAGGTGTCGAAATTACCGTTCGt > 8:122488‑M2/2‑148 (MQ=255) aTCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAGGTGTCGAAATTACCGTTCGTGa < 3:115327/149‑1 (MQ=255) | GGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCG‑GTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCTTGACCCGTACCCAAGGTGTCGAAATTACCGTTCGTGA > NC_002947/1294573‑1294869 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |