New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1661709 = | 82 (1.260) | 5 (0.080) | 4/250 | NT | 6.4% | coding (381/468 nt) | PP_1456 | membrane protein |
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ATTTCCGAGCTGATCGACTGGCTGGTGTTCAGCATCACCCGTCGGCCGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGAGCATCCCGGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATG > NC_002947/1661563‑1661856 | aTTTCCGAGCTGATCGACTGGCTGGTGTTCAGCATCACCCGTCGGCCGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGAGCATCCCGGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCAc > 2:306171/1‑149 (MQ=255) tggggttccgatacgggtcatttcaggtcctcgaaggcatccggggccgcgccaggctaggcgccacccgctgaaaaaggaccgctattctacaccatcaaccggccacggcggcccgccgggcgcgaaatgccatggccagccaCAcc < 6:193654‑M1/4‑1 (MQ=255) ttCCGAGCTGATCGACTGGCTGGTGTTCAGCATCACCCGTCGGCCGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGAGCATCCCGGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACcg > 5:302723/1‑149 (MQ=255) ggttccgatacgggtcatttcaggtcctcgaaggcatccggggccgcgccaggctaggcgccacccgctgaaaaaggaccgctattctacaccatcaaccggccacggcggcccgccgggcgcgaaatgccatggccagccaCACcgcg < 4:360785‑M1/7‑1 (MQ=255) aGCTGATCGACTGGCTGGTGTTCAGCATCACCCGTCGGCCGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGAGCATCCCGGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATg < 3:236449/149‑1 (MQ=255) cgatacgggtcatttcaggtcctcgaaggcatccggggccgcgccaggctaggcgccacccgctgaaaaaggaccgctattctacaccatcaaccggccacggcggcccgccgggcgcgaaatgccatggccagccaCAcc < 1:274071‑M1/4‑1 (MQ=255) cgatacgggtcatttcaggtcctcgaaggcatccggggccgcgccaggctaggcgccacccgctgaaaaaggaccgctattctacaccatcaaccggccacggcggcccgccgggcgcgaaatgccatggccagccaCAcc > 2:274071‑M1/138‑141 (MQ=255) cTGATCGACTGGCTGGTGTTCAGCATCACCCGTCGGCCGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGAGCATCCCGGTGGTTACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATgg < 1:120113/148‑1 (MQ=255) aTCGACTGGCTGGTGTTCAGCATCACCCGTCGGCCGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGAGCATCCCGGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTc > 5:418991/1‑149 (MQ=255) aTCGACTGGCTGGTGTTCAGCATCACCCGTCGGCCGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGAGCATCCCGGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTc > 5:326440/1‑149 (MQ=255) gACTGGCTGGTGTTCAGCATCACCCGGCGGCCGCGGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGAGCATCCCGGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGa < 7:199159/148‑1 (MQ=255) actcggtggTGTTCAGCTTCACCCGTCGTCGGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGATAGGCGCTGAGCATCCCAGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCTCTGACCCGGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGaat < 8:177557/143‑2 (MQ=255) gctggTGTTCAGCATCACCCGTCGGCCGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGCGCATCCCGGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCg > 8:7355/1‑149 (MQ=255) 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tcttcGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCt < 6:92102/148‑1 (MQ=255) tcttcGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCt < 6:369752/148‑1 (MQ=255) tcttcGGCAAGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCt < 8:370543/148‑1 (MQ=255) cGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCttt < 5:273261/146‑1 (MQ=255) gCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAg > 2:357543/1‑149 (MQ=255) cATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGc > 4:331613/1‑149 (MQ=255) cATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGc < 5:167439/149‑1 (MQ=255) aTGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCg < 8:378498/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGt < 5:83457/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGt > 1:76249/1‑149 (MQ=255) gcTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTa < 3:400329/149‑1 (MQ=255) gactgCAGTGTTCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGAGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTg < 6:236972/144‑1 (MQ=255) cccGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTTGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTgg > 4:194223/1‑149 (MQ=255) cccGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTgg > 5:193654/1‑149 (MQ=255) cccGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTgg < 3:52753/149‑1 (MQ=255) cccGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCGTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTgg > 1:163189/1‑149 (MQ=255) ggCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGCCTCGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGgc < 1:120478/149‑1 (MQ=255) ggCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGgcgc < 4:8557/149‑1 (MQ=255) aTCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCg > 2:361359/1‑149 (MQ=255) aTCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCg < 5:1924/149‑1 (MQ=255) aTCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCg < 8:6256/149‑1 (MQ=255) ggCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGAt < 2:263479/149‑1 (MQ=255) gCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATg > 4:37663/1‑149 (MQ=255) | ATTTCCGAGCTGATCGACTGGCTGGTGTTCAGCATCACCCGTCGGCCGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGAGCATCCCGGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATG > NC_002947/1661563‑1661856 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |