New junction evidence | |||||||||||
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ccTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCATGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCttttt > 8:228721/1‑101 (MQ=255) ccTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCATGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCttttt < 7:228721/101‑1 (MQ=255) cGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTg > 4:109481/1‑148 (MQ=255) gAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGaa < 2:184645/149‑1 (MQ=255) gAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGa > 7:109415/1‑148 (MQ=255) aaaTTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGaaa < 3:331613/149‑1 (MQ=255) aaTTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAAt > 7:154022/1‑149 (MQ=255) gtgtAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGTAt > 8:195041/1‑149 (MQ=255) gtAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGTATCg > 6:285751/1‑149 (MQ=255) tAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGTATCg > 1:172485/1‑148 (MQ=255) aCCGCTGTGTGACTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGt < 7:317677/142‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGTATCGGa < 1:357543/148‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGTGACTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGt > 8:317677/1‑142 (MQ=255) ccGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGTATCGGAAc < 2:172485/149‑1 (MQ=255) cgcggtgTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGTATCGGAAcc < 4:360785‑M2/142‑1 (MQ=255) ggtgTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGTATCg < 1:274071‑M2/137‑1 (MQ=255) ggtgTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGTATCg > 2:274071‑M2/5‑141 (MQ=255) ggtgTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGTATCGGAACCCCa < 6:193654‑M2/145‑1 (MQ=255) | CCGTCGGCCGCTGCGCGACCGCCTGTGGCTCAGTTCGGCGCTGAGCATCCCGGTGGATACCTTCATTTTCTTCGGCATGATCGGCGCGCTGACCCCGGCAGTGATCGGCACCGCGATGGCCTCGAAATTCGCCGGTGTAACCGCGGTGTGGCTGGCCATGGCATTTCGCGCCCGGC‑‑GGGCCGCCGTGGCCGGTTGATGGTGTAGAATAGCGGTCCTTTTTCAGCGGGTGGCGCCTAGCCTGGCGCGGCCCCGGATGCCTTCGAGGACCTGAAATGACCCGTATCGGAACCCCA > NC_002947/1661601‑1661893 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |