New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1693906 = | 63 (0.970) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.8% | coding (375/507 nt) | PP_1489 | CheW domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 1693965 = | 51 (0.830) | coding (434/507 nt) | PP_1489 | CheW domain‑containing protein |
TGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGATGCCTACATGAAC > NC_002947/1693759‑1694040 | gaccatgggcgcgcccaccgactccacgtccaggccaatacgctcgcgcaagaagcggaagaaacgctgttcgttcatgtaggcatccctgtcgggtcttgcgtgtacagcaatgcgtgcacggtgtcgggcagctggtcattgacttc < 6:208492‑M1/1‑1 (MQ=255) accatgggcgcgcccaccgtctccacgtccaggccaatacgctcgcgcaagaagcggaagaaacgctgttcgttcatgtaggcatccctgtcgggtcttgcgtgtacagcaatgcgtgcacggtgtcgggcagcaggtcattgacttCg > 6:231803‑M1/148‑149 (MQ=255) gCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGCAGCCCTGCGTTGCCAACCGGCCGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGAt > 1:40714/1‑149 (MQ=255) ccatgggcgcgcccaccgactccacgtccaggccaatacgctcgcgcaagaagcggaagaaacgctgttcgttcatgtaggcatccctgtcgggtcttgcgtgtacagcaatgcgtgcacggtgtcgggcagcaggtcattgacttCGa < 1:149481‑M1/3‑1 (MQ=255) ccatgggcgcgcccaccgactccacgtccaggccaatacgctcgcgcaagaagcggaagaaacgctgttcgttcatgtaggcatccctgtcgggtcttgcgtgtacagcaatgcgtgcacggtgtcgggcagcaggtcattgacttCGa < 3:315783‑M1/3‑1 (MQ=255) cAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgc < 7:290120/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgcgc < 5:205809/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgcgc < 5:233196/149‑1 (MQ=255) ccGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGcc > 6:26642/1‑149 (MQ=255) tGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGT‑GACACAGGCGATGCGCCTTATCTgg > 5:390570/1‑149 (MQ=255) gcacccgcacccGCCTGGGTCGGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑TCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCg < 8:252120/149‑1 (MQ=255) gCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCg > 2:77614/1‑149 (MQ=255) gCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCg > 2:83323/1‑149 (MQ=255) cACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCgg > 5:209868/1‑149 (MQ=255) cACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGT‑GACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGt < 6:390570/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCAGGCGGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTg > 4:360643/1‑149 (MQ=255) cACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTgcgc > 3:30326/1‑148 (MQ=255) ccGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAg > 2:113514/1‑148 (MQ=255) ccGCCTGGTGCTGGAGCACTACCGAGGCGGCCTGCATCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGTGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAgg < 5:335392/149‑1 (MQ=255) ggtgctggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGcc > 3:128231/1‑148 (MQ=255) ctggtgcACTACCGAGGGGGCCTGCAGCTTGGCCTGAGCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAg < 5:310817/148‑1 (MQ=255) ctggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAg < 4:128231/148‑1 (MQ=255) tggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGc < 6:274660/149‑1 (MQ=255) ggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGcc > 3:244296/1‑149 (MQ=255) tgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCctg < 1:77614/149‑1 (MQ=255) tgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCctg < 1:273313/149‑1 (MQ=255) tgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCctg < 1:83323/149‑1 (MQ=255) gcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCctgc > 6:262766/1‑149 (MQ=255) gcaagaagcggaagaaacgctgttcgttcatgtaggcatccctgtcgggtcttgcgtgtacagcaatgcgtgcacggtgtcgggcagcaggtcattgacttCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCctgct < 2:234089‑M1/48‑1 (MQ=255) cTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCctgctg > 6:196110/1‑148 (MQ=255) gAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAgcgc < 6:258953/149‑1 (MQ=255) gcCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATTGaa < 7:382594/149‑1 (MQ=255) gcCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGaa < 2:90158/149‑1 (MQ=255) gcCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGaa < 5:262766/149‑1 (MQ=255) gaaacgctgttcgttcatgtaggcatccctgtcgggtcttgcgtgtacagcaatgcgtgcacggtgtcgggcagcaggtcattgacttCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGaa > 1:234089‑M1/89‑149 (MQ=255) cAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCaa < 6:209868/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTGAACCTGGAGCAGGCCACCGAACCACTCCGTTGCCAACCGGACCAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCATTAACTGGTCCAGGTGCGCCACGATGCACAAGGCCTGCTCCAGAGCATCCAAGTCAAAGAc > 2:205786/1‑149 (MQ=255) gttcatgtaggcatccctgtcgggtcttgcgtgtacagcaatgcgtgcacggtgtcgggcagcaggtcattgacttCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGa > 8:348878‑M1/77‑136 (MQ=255) gttcatgtaggcatccctgtcgggtcttgcgtgtacagcaatgcgtgcacggtgtcgggcagcaggtcattgacttCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGACTGCTGCAGCGCATCGa < 7:348878‑M1/60‑1 (MQ=255) cTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGACAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACctgct > 7:14310/1‑149 (MQ=255) tGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACctgctg > 1:147318/1‑149 (MQ=255) aTCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGcc > 5:410823/1‑149 (MQ=255) tCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGcc < 5:26642/148‑1 (MQ=255) ccTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGccc > 3:57365/1‑148 (MQ=255) tGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTCCCAAACGGACGAGTTCCAGGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGa > 1:89181/1‑149 (MQ=255) ggAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGc < 6:137661/102‑1 (MQ=255) ggCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTg > 1:218543/1‑148 (MQ=255) ccACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCAc < 1:113514/149‑1 (MQ=255) aCCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACg > 4:216686/1‑148 (MQ=255) cccTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAACGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTg > 1:151063/1‑149 (MQ=255) ccTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTg > 7:231265/1‑148 (MQ=255) ccTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTg > 4:300866/1‑148 (MQ=255) cTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGaa < 4:20406/108‑1 (MQ=255) cTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGaa > 3:20406/1‑108 (MQ=255) cGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTac < 2:147318/147‑1 (MQ=255) tGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGc > 6:33016/1‑148 (MQ=255) aCCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGAcc < 4:30326/149‑1 (MQ=255) ccGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAg < 3:294331/145‑1 (MQ=255) ccGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAg > 4:294331/1‑145 (MQ=255) ccGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGAccc > 6:279260/1‑149 (MQ=255) ggACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGa < 5:12529/149‑1 (MQ=255) ggACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGa < 5:33016/149‑1 (MQ=255) gAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAg < 3:216686/148‑1 (MQ=255) gTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCTCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGa < 2:30921/149‑1 (MQ=255) gTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCTCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGa > 1:30921/1‑149 (MQ=255) gTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGa > 6:62397/1‑149 (MQ=255) cA‑GACCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGATGc < 8:165052/148‑1 (MQ=255) gCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGATGCCTa < 3:360643/149‑1 (MQ=255) cccTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGATGCCTAc < 4:57365/149‑1 (MQ=255) cccTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGATGCCTAc < 8:14310/149‑1 (MQ=255) cTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGATGCCTACAt > 7:231182/1‑149 (MQ=255) tGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAA‑GCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGATGCCTACATgaac > 1:330826/1‑149 (MQ=255) | TGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCA‑GCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCAAGACCCGACAGGGATGCCTACATGAAC > NC_002947/1693759‑1694040 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |