New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1932033 | 69 (1.060) | 4 (0.060) | 4/254 | NT | 5.5% | coding (501/636 nt) | rluA | bifunctional tRNA pseudouridine(32) synthase TrmQ/ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluA |
? | NC_002947 | = 1932067 | 72 (1.150) | coding (467/636 nt) | rluA | bifunctional tRNA pseudouridine(32) synthase TrmQ/ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluA |
CCCTGCAAAATCAGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTCGTGGTCCACCA > NC_002947/1931888‑1932178 | cccTGCAAAATCAGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCagcagc < 6:293322/149‑1 (MQ=255) tGCAAAATAAGAACGCCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGT‑GGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGCCATGCAGGCACAGCCGCTCAAGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGt > 2:33230/1‑149 (MQ=255) cAAAATCAGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGt < 4:92016/148‑1 (MQ=255) aaaaTCAGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCAAGCAGCG‑GGTGc > 4:102866/1‑149 (MQ=255) aaaTCAGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCTGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCTCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGcc < 6:312260/149‑1 (MQ=255) aaaTCAGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTg < 5:170821/147‑1 (MQ=255) aaaTCAGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTg > 6:170821/1‑147 (MQ=255) aaTCAGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGccc < 6:56694/149‑1 (MQ=255) aGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGAt < 4:281966/148‑1 (MQ=255) aGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGAt < 6:38964/148‑1 (MQ=255) aGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATc < 5:351637/149‑1 (MQ=255) gAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATc > 7:96381/1‑148 (MQ=255) aCGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCgc > 7:83592/1‑147 (MQ=255) gcAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCAt < 2:224513/149‑1 (MQ=255) gcAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCAt > 1:224513/1‑149 (MQ=255) aGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCGCCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCAtgt < 5:14940/149‑1 (MQ=255) aGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCAtgt < 2:299215/149‑1 (MQ=255) tCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCAcgcg > 5:258319/1‑149 (MQ=255) cGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCAcgcg > 5:242267/1‑148 (MQ=255) gAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCAcgcg > 1:149695/1‑147 (MQ=255) cAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCtgcgcgtgcacatgctgtcgatcgggcacccgctgctgg < 4:110548‑M1/148‑40 (MQ=255) aaCCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGt < 8:96381/148‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTg < 6:286618/149‑1 (MQ=255) aCCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCGTGTGCACGCGCAGCTGGTGc > 7:192456/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAgct < 1:72147‑M2/142‑4 (MQ=255) cGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAgct > 2:72147‑M2/1‑139 (MQ=255) gCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGaa > 7:325599/1‑149 (MQ=255) gCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGc < 8:325599/149‑1 (MQ=255) cccGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCATCCGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGc > 1:248211/1‑149 (MQ=255) cccGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGcc > 3:236144/1‑149 (MQ=255) cGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCg > 2:307402/1‑149 (MQ=255) ggACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCGTGGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCg < 1:293251/149‑1 (MQ=255) ggACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCgg > 3:157855/1‑149 (MQ=255) acacCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGTGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGT‑‑‑‑TCG‑‑CA‑CCAGCtgcgcgtgcacatgctgtcgatcgggcacccgctgctgggtgatcgcctgtacgccaaccc < 2:251898‑M1/149‑62 (MQ=255) acacCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTa < 6:242267/149‑1 (MQ=255) acacCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTa < 6:258319/149‑1 (MQ=255) ccGGGTGGGTAAAGCTTAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATc < 4:71509/149‑1 (MQ=255) gtgggtAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGc < 1:211238/97‑1 (MQ=255) gtgggtAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGc > 2:211238/1‑97 (MQ=255) cTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGa < 4:211773/95‑1 (MQ=255) cTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCAc > 5:328920/1‑149 (MQ=255) tCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCAcc > 4:281211/1‑149 (MQ=255) aGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCAccc < 2:115012/148‑1 (MQ=255) aGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCAcc < 5:405442/147‑1 (MQ=255) aGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCAcc < 6:328920/147‑1 (MQ=255) gAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGt < 4:157855/148‑1 (MQ=255) aGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGa < 3:281211/149‑1 (MQ=255) ggCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCAtg < 4:288378/91‑1 (MQ=255) ggCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCAtg > 3:288378/1‑91 (MQ=255) aTGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCtgcgcgtgcacatgctgtcgatcgggcacccgctgctgggtgatc < 4:195087‑M1/109‑46 (MQ=255) aTGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCtgcgcgtgcacatgctgtcgatcgggcacccgctgctgggtgatc > 3:195087‑M1/1‑64 (MQ=255) gCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGACCGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGc > 2:377214/1‑149 (MQ=255) acaGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGt > 4:51880/1‑149 (MQ=255) aGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTc > 6:22054/1‑149 (MQ=255) ccGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCTATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCa < 4:12828/149‑1 (MQ=255) ccGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCa < 4:236144/149‑1 (MQ=255) cTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGa > 8:307140/1‑149 (MQ=255) aTGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATa < 1:33230/148‑1 (MQ=255) tGGGCCGCCATGGCTTGCGGTTTGGCGTACAGGCGATCACCAAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGAGAAAGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTACACACGACAGTGATCGCCGCAGAGTTCCACGATAct > 4:282988/1‑148 (MQ=255) gggCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAg > 6:364065/1‑134 (MQ=255) gggCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGc > 8:152908/1‑149 (MQ=255) gggCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGc > 2:33625/1‑149 (MQ=255) gggCCGCCAGGGCTCGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAg < 5:364065/134‑1 (MQ=255) ccgccAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGc > 4:367321/1‑146 (MQ=255) gccAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGaa < 2:248211/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGt > 1:260696/1‑147 (MQ=255) gggTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAgctggtgcgaacgccaacccgcaagccctggcggcacatgagcggctgtgcctgcatgcctcgatgctgagctttacccacccggtgt < 2:251898‑M2/149‑89 (MQ=255) gTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCGTGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCt < 8:192456/149‑1 (MQ=255) gTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCgg < 4:196169/78‑1 (MQ=255) gTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCgg > 3:196169/1‑78 (MQ=255) tACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTg > 5:171586/1‑149 (MQ=255) tACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTg > 8:154097/1‑149 (MQ=255) cAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGc < 7:307140/148‑1 (MQ=255) aGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTc < 1:307402/149‑1 (MQ=255) gCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTCGt > 2:254701/1‑149 (MQ=255) gATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAgctgggtgatcgcctgtacgccaacccgcaagccctggcggcccatgagcggctgtgcctgcat < 4:195087‑M2/109‑65 (MQ=255) gATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAgctgggtgatcgcctgtacgccaacccgcaagccctggcggcccatgagcggctgtgcctgcat > 3:195087‑M2/1‑45 (MQ=255) aTCACCCAGCAGCG‑GGTGCACGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTCGTGGt > 4:302885/1‑149 (MQ=255) cccAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTCGTGGTccac > 8:18979/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAgctgggtgatcgcctgtacgccaacccgcaagccctggcggcccatgagcggctgtgcctgcatgcctcgatgctgagctttacccacccggtgtccgggcagcggttg < 4:110548‑M2/148‑110 (MQ=255) ccAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTCGTGGTccgc > 1:350176/1‑146 (MQ=255) ccAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTCGTGGTccac > 2:395073/1‑148 (MQ=255) cagcagCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTCGTGGTccacca < 7:18979/149‑1 (MQ=255) cagcagCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTCGTGGTccacca > 5:94089/1‑149 (MQ=255) aGCtgcgcgtgcacatgctgtcgatcgggcacccgctgctgggtgatcgcctgtacgccaacccgcaagccctggcggcccatgagcggctgtgcctgcatgcctcgatgctgagctttacccacccggtgtccgggcagcg < 1:72147‑M1/142‑140 (MQ=255) aGCtgcgcgtgcacatgctgtcgatcgggcacccgctgctgggtgatcgcctgtacgccaacccgcaagccctggcggcccatgagcggctgtgcctgcatgcctcgatgctgagctttacccacccggtgtccgggcagcg > 2:72147‑M1/1‑3 (MQ=255) cagcG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGcac < 4:308214/130‑3 (MQ=255) cagcG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGcac > 3:308214/1‑128 (MQ=255) | CCCTGCAAAATCAGAACGGCGCAGGGCACTCGAACTTCAACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCCGACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTCGTGGTCCACCA > NC_002947/1931888‑1932178 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |