| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1932033 | 69 (1.060) | 4 (0.060) | 4/254 | NT | 5.5% | coding (501/636 nt) | rluA | bifunctional tRNA pseudouridine(32) synthase TrmQ/ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluA |
| ? | NC_002947 | = 1932067 | 72 (1.150) | coding (467/636 nt) | rluA | bifunctional tRNA pseudouridine(32) synthase TrmQ/ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluA | |||||
AACCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCC‑GACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGCCAGAAGGTCAGGGCGTGCTTGCCCTGCTCGTGGTCCACCACATGCCGTGGTTTGGTCGGTGGGTCGTAGCGCA > NC_002947/1931926‑1932211 | aaCCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGt < 8:96381/148‑1 (MQ=255)aaCCGCCGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTg < 6:286618/149‑1 (MQ=255) aCCGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCGTGTGCACGCGCAGCTGGTGc > 7:192456/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAgct < 1:72147‑M2/142‑4 (MQ=255) cGCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAgct > 2:72147‑M2/1‑139 (MQ=255) gCTGCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGaa > 7:325599/1‑149 (MQ=255) gCCCGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGc < 8:325599/149‑1 (MQ=255) cccGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCATCCGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGc > 1:248211/1‑149 (MQ=255) cccGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGcc > 3:236144/1‑149 (MQ=255) cGGACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCg > 2:307402/1‑149 (MQ=255) ggACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCGTGGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCg < 1:293251/149‑1 (MQ=255) ggACACCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCgg > 3:157855/1‑149 (MQ=255) acacCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTa < 6:242267/149‑1 (MQ=255) acacCGGGTGGGTAAAGCTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTa < 6:258319/149‑1 (MQ=255) ccGGGTGGGTAAAGCTTAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATc < 4:71509/149‑1 (MQ=255) cTCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCAc > 5:328920/1‑149 (MQ=255) tCAGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCAcc > 4:281211/1‑149 (MQ=255) aGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCAccc < 2:115012/148‑1 (MQ=255) aGCAT‑CGAGGCATGCAGGCACAGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCAcc < 5:405442/147‑1 (MQ=255) 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aGCCGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCC‑GACAGTGATCGCCGCAGCGTTc > 6:22054/1‑149 (MQ=255) ccGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCTATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCC‑GACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCa < 4:12828/149‑1 (MQ=255) ccGCTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCC‑GACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCa < 4:236144/149‑1 (MQ=255) cTCATGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCC‑GACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGa > 8:307140/1‑149 (MQ=255) aTGGGCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCC‑GACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATa < 1:33230/148‑1 (MQ=255) tGGGCCGCCATGGCTTGCGGTTTGGCGTACAGGCGATCACCAAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGAGAAAGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTACACAC‑GACAGTGATCGCCGCAGAGTTCCACGATAct > 4:282988/1‑148 (MQ=255) gggCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCC‑GACAGTGATCGCCGCAg > 6:364065/1‑134 (MQ=255) gggCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCC‑GACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGc > 8:152908/1‑149 (MQ=255) gggCCGCCAGGGCTTGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCC‑GACAGTGATCGCCGCAGCGTTCCACGATACGc > 2:33625/1‑149 (MQ=255) gggCCGCCAGGGCTCGCGGGTTGGCGTACAGGCGATCACCCAGCAGCG‑GGTGCCCGATCGACAGCATGTGCACGCGCAGCTGGTGCGAACGCCCGGTAATCGGCGTCAGCTCCACCC‑GACAGTGATCGCCGCAg < 5:364065/134‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |