New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1975504 | 50 (0.770) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 6.0% | coding (436/1104 nt) | pheA | bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase |
? | NC_002947 | = 1975538 | 46 (0.750) | coding (470/1104 nt) | pheA | bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase |
AAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGACCGACAGCATCACCC > NC_002947/1975360‑1975651 | aaaaTCGCGTACCTCCGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCGATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTTGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCTGTGTGGTGc < 6:204500/148‑1 (MQ=255) aaaTCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCg > 3:338544/1‑149 (MQ=255) aaTCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCgg < 1:79050/149‑1 (MQ=255) tCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTg > 5:185604/1‑149 (MQ=255) aCCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAAc > 8:27291/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCTGTCATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCa < 1:175021/148‑1 (MQ=255) ggCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCa < 7:27291/148‑1 (MQ=255) ccTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTg > 8:113615/1‑148 (MQ=255) tGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAg > 7:359104/1‑149 (MQ=255) gAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCg < 3:273011/129‑1 (MQ=255) gAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCg > 4:273011/1‑129 (MQ=255) ccTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGt < 6:37776/148‑1 (MQ=255) cTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGctgaccgcaccttcagtggagttttccaccgg > 7:78111‑M1/1‑116 (MQ=255) ttCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAg > 3:201537/1‑149 (MQ=255) ttCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAg > 3:324556/1‑149 (MQ=255) cACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCATGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGc > 2:395501‑M2/1‑147 (MQ=255) cccAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGcca < 4:108615‑M2/148‑4 (MQ=255) ccAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCa > 7:2076/1‑128 (MQ=255) ccAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCa < 8:2076/128‑1 (MQ=255) cAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGccacac < 6:12012‑M2/149‑7 (MQ=255) aGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGccacacc < 8:143970‑M2/149‑8 (MQ=255) ggcggcggcCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGctgaccgcaccttcagtggagttttccaccggcaccacaccg < 3:293529‑M1/149‑43 (MQ=255) cggcggcCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGctgaccgcaccttcagtggagttttccaccggcaccacaccgaa < 8:78111‑M1/149‑45 (MQ=255) aaGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTcc < 6:185604/148‑1 (MQ=255) aCTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTACCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAg < 8:142497/149‑1 (MQ=255) cGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGt < 1:219303/117‑1 (MQ=255) cGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGt > 2:219303/1‑117 (MQ=255) gCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTgtggt > 6:317011/1‑85 (MQ=255) gCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTgtggt < 5:317011/85‑1 (MQ=255) aTCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGTGTACCGTCAATATGGGTGAGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGAttt < 1:130346/149‑1 (MQ=255) aGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCgg > 5:124801/1‑149 (MQ=255) aGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCg < 1:402468/148‑1 (MQ=255) ggCCGATGGCGGCCATCGACGTAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAg < 3:287312/149‑1 (MQ=255) ggCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAg > 5:137756/1‑149 (MQ=255) ccGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGt > 3:150163/1‑149 (MQ=255) cGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTc < 8:214313/149‑1 (MQ=255) aTGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGa < 4:201537/149‑1 (MQ=255) gcggcCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCt < 5:12012/149‑1 (MQ=255) ggcCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGc < 6:124801/149‑1 (MQ=255) ggcCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGc < 7:143970/149‑1 (MQ=255) aTCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTAt > 8:290009/1‑149 (MQ=255) tCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATc < 7:113615/149‑1 (MQ=255) acgaAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATccac < 6:291772/149‑1 (MQ=255) acgaAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATccac > 4:371684/1‑149 (MQ=255) gaAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAg > 5:6470/1‑129 (MQ=255) gaAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAg < 6:6470/129‑1 (MQ=255) aaGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATccaccac < 3:108615/149‑1 (MQ=255) aGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATccaccacc < 3:371684/149‑1 (MQ=255) ttCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTGAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTg > 1:218227/1‑116 (MQ=255) ttCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTg < 2:218227/116‑1 (MQ=255) aaGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCtggt < 4:150163/148‑1 (MQ=255) aaGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCtggt < 4:338544/148‑1 (MQ=255) ggcggcCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCAGCAGGtggtggtgg < 6:137756/149‑4 (MQ=255) gcggcCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCga < 5:171046/149‑1 (MQ=255) gTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGAc > 6:348049/1‑149 (MQ=255) gTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGAc > 2:64172/1‑149 (MQ=255) tCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTc < 7:12890/101‑1 (MQ=255) tCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTc > 8:12890/1‑101 (MQ=255) tCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGAcc > 8:105414/1‑149 (MQ=255) cAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGAcc > 2:314849/1‑148 (MQ=255) cTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGACCGACa < 7:290009/149‑1 (MQ=255) ttCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGccacaccgaagttgacggcaccggccgccacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccg < 8:78111‑M2/149‑106 (MQ=255) ttCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGACCGACAg > 7:205344/1‑149 (MQ=255) cGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGccacaccgaagttgacggcaccggccgccacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcc < 3:293529‑M2/149‑108 (MQ=255) ggTGTGGctgaccgcaccttcagtggagttttccaccggcaccacaccgaagttgacggcaccggccgccacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcct < 8:143970‑M1/149‑143 (MQ=255) gtgtGGctgaccgcaccttcagtggagttttccaccggcaccacaccgaagttgacggcaccggccgccacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcctg < 6:12012‑M1/149‑144 (MQ=255) gtgtGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGACCGACAGCATc > 3:270663/1‑149 (MQ=255) tgGctgaccgcaccttcagtggagttttccaccggcaccacaccgaagttgacggcaccggccgccacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcctggg < 4:108615‑M1/148‑146 (MQ=255) gctgaccgcaccttcagtggagttttccaccggcaccacaccgaagttgacggcaccggccgccacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcatggccgaagtgcttcatggccgccgcctgggtg > 2:395501‑M1/1‑1 (MQ=255) | AAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCG‑GTGCCGTCAACTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGACCGACAGCATCACCC > NC_002947/1975360‑1975651 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |