New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2412070 | 47 (0.720) | 4 (0.070) | 3/246 | NT | 7.3% | coding (399/1065 nt) | rlmM | 23S rRNA (cytidine(2498)‑2'‑O)‑methyltransferase RlmM |
? | NC_002947 | = 2412116 | 58 (0.960) | coding (445/1065 nt) | rlmM | 23S rRNA (cytidine(2498)‑2'‑O)‑methyltransferase RlmM |
GTACTGCTGGCGCAGTTGGCTGACTTCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAGTTCCCTCGCGAGGCACCTAGCCGTT > NC_002947/2411927‑2412218 | gTACTGCTGGCGCAGTTGGCTGACTTCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGt < 6:189774/149‑1 (MQ=255) tACTGCTGGCGCAGTTGGCTGACTTCCCGGTGTTCGGTATCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACGTTCTGCCT‑‑AAAGTTCGATGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGTCCGCCTGGTc < 5:151369/149‑1 (MQ=255) gcAGTTGGCTGACTTCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCg < 2:46769/149‑1 (MQ=255) cAGTTGGCTGACTTCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCgg < 3:286141/149‑1 (MQ=255) gTTGGCTGACTTCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTc < 3:331366/149‑1 (MQ=255) ttGGCTGACTTCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTACACCTTATGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTAGACGACCCCGGTCg > 1:110317/1‑149 (MQ=255) gACTTCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCGCTCTAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCa < 1:125439/149‑1 (MQ=255) aCTTCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGc > 1:96077/1‑149 (MQ=255) cTTCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCt > 5:277968/1‑149 (MQ=255) ttCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCtt > 6:258920/1‑149 (MQ=255) cccGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTtg < 6:197986/148‑1 (MQ=255) tgtTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGctgctg < 6:277968/149‑1 (MQ=255) ggTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCt > 8:192338/1‑148 (MQ=255) cTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGGAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCtgatgaaggtcagcagcaagcgtgggcgaccggggtcgtcgaccagg > 1:230070‑M1/1‑102 (MQ=255) tttGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAgc < 3:274793‑M2/149‑3 (MQ=255) cTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCtgatgaaggtcagcagcaagcgtgggcgaccggggtcgtcgaccaggcggccg < 2:230070‑M1/149‑54 (MQ=255) tGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAgcggc < 1:254587‑M2/146‑6 (MQ=255) tGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAgcggc > 2:254587‑M2/1‑141 (MQ=255) gCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGAccc > 3:188359/1‑102 (MQ=255) gCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGAccc < 4:188359/102‑1 (MQ=255) gCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAgc < 2:45072‑M2/136‑3 (MQ=255) gCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAgc > 1:45072‑M2/1‑134 (MQ=255) tGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCtgatgaaggtcagcagcaagcgtgggcgaccggggtcgtcgaccaggcggccg < 5:249179‑M1/139‑54 (MQ=255) tGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCtgatgaaggtcagcagcaagcgtgggcgaccggggtcgtcgaccaggcggccg > 6:249179‑M1/1‑86 (MQ=255) tGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTAttt > 8:303730/1‑149 (MQ=255) aCAGCAACGAAGGCAAGGAATTCTCCACCTTCTGCAG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGCTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTc > 4:117996/1‑149 (MQ=255) cAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCg < 4:274793/149‑1 (MQ=255) aGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCgg < 2:340795/149‑1 (MQ=255) gCAACGCAGGCAAGGATTTGGCACCCTTCTGCCT‑‑CAAGTTCGAAGTGCCGGTGTGAAAGGCCCTGGCGAAGTCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCTGCCGGCGGGTATTTGTCGGc < 5:414390/149‑1 (MQ=255) cGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTg > 3:146553/1‑149 (MQ=255) gAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTg > 1:237/1‑148 (MQ=255) gCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATc > 3:301003/1‑148 (MQ=255) gCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATc < 4:301003/148‑1 (MQ=255) aaGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGt > 8:130917/1‑74 (MQ=255) aaGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGt < 7:130917/74‑1 (MQ=255) aGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGc > 5:101899/1‑137 (MQ=255) aGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGc < 6:101899/137‑1 (MQ=255) aaTTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGc < 7:192338/149‑1 (MQ=255) ttCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCtt > 5:7572/1‑149 (MQ=255) ccG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTgg < 5:258920/148‑1 (MQ=255) g‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGcc > 7:140700/1‑148 (MQ=255) aaaGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGcc > 3:349100/1‑139 (MQ=255) aaaGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGcc < 4:349100/139‑1 (MQ=255) aGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCTTCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATg < 1:33885/149‑1 (MQ=255) gTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATgg < 3:279804/149‑1 (MQ=255) gTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATgg < 2:237/149‑1 (MQ=255) gAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCAt > 5:413545/1‑149 (MQ=255) aaGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATc > 2:186876/1‑149 (MQ=255) cGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGc > 2:38936/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTAGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGcc < 2:110317/149‑1 (MQ=255) gcAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAg > 5:167187/1‑149 (MQ=255) gcAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAg > 6:259922/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAGTTcc > 6:123808/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAGTTcc < 4:146553/149‑1 (MQ=255) ccTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAGTTCCCTc < 6:413545/149‑1 (MQ=255) ccTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAGTTCCCTc > 4:171133/1‑149 (MQ=255) tGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCACCAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAGTTCCCTcgc > 7:193655/1‑149 (MQ=255) aaGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAGTTCCCTCGCGAGGc < 8:140700/149‑1 (MQ=255) ggccggccGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAGTTCCCTCGCGAGGCAc > 3:67937/1‑149 (MQ=255) cggccgCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAgcggccggccttctccagggccttgcgcaacggcacttcgaactttcggcagaaggtggacaattccttgccttcgttgctgtccagcacctccag < 2:230070‑M2/149‑97 (MQ=255) cggccgCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAgcggccggccttctccagggccttgcgcaacggcacttcgaactttcggcagaaggtggacaattccttgccttcgttgctgtcca < 5:249179‑M2/139‑87 (MQ=255) cggccgCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAgcggccggccttctccagggccttgcgcaacggcacttcgaactttcggcagaaggtggacaattccttgccttcgttgctgtcca > 6:249179‑M2/1‑53 (MQ=255) gccgCtgatgaaggtcagcagcaagcgtgggcgaccggggtcgtcgaccaggcggccggccttctccagggccttgcgcaacggcacttcgaactttcggcagaaggtggacaattccttgccttcgttgctgtccagcacctcca < 1:254587‑M1/146‑142 (MQ=255) gccgCtgatgaaggtcagcagcaagcgtgggcgaccggggtcgtcgaccaggcggccggccttctccagggccttgcgcaacggcacttcgaactttcggcagaaggtggacaattccttgccttcgttgctgtccagcacctcca > 2:254587‑M1/1‑5 (MQ=255) gCtgatgaaggtcagcagcaagcgtgggcgaccggggtcgtcgaccaggcggccggccttctccagggccttgcgcaacggcacttcgaactttcggcagaaggtggacaattccttgccttcgttgctgtccagcacctccagccaaa < 3:274793‑M1/149‑148 (MQ=255) gCtgatgaaggtcagcagcaagcgtgggcgaccggggtcgtcgaccaggcggccggccttctccagggccttgcgcaacggcacttcgaactttcggcagaaggtggacaattccttgccttcgttgctgtccagc > 1:45072‑M1/1‑2 (MQ=255) gCtgatgaaggtcagcagcaagcgtgggcgaccggggtcgtcgaccaggcggccggccttctccagggccttgcgcaacggcacttcgaactttcggcagaaggtggacaattccttgccttcgttgctgtccagc < 2:45072‑M1/136‑135 (MQ=255) ccTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAgcggccggccttctccagggccttgcgcaacggcacttcgaactttcggcagaaggtggacaattccttgcctccgttgctgtccagcacctccagccaaag > 1:230070‑M2/1‑47 (MQ=255) ccTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATc < 8:227424/112‑1 (MQ=255) ccTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTCTGGCCCATGGGCATc > 7:227424/1‑112 (MQ=255) | GTACTGCTGGCGCAGTTGGCTGACTTCCCGGTGTTCGGTAGCCTTTGGCTGGAGGTGCTGGACAGCAACGAAGGCAAGGAATTGTCCACCTTCTGCCG‑‑AAAGTTCGAAGTGCCGTTGCGCAAGGCCCTGGAGAAGGCCGGCCGCCTGGTCGACGACCCCGGTCGCCCACGCTTGCTGCTGACCTTCATCAGCGGCCGGCGGGTATTTGTCGGCGTTGCATCGGCCAGCAACAGCGCCTTGTGGCCCATGGGCATCCCACGCCTGAAGTTCCCTCGCGAGGCACCTAGCCGTT > NC_002947/2411927‑2412218 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |