| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_002947 | 2,837,076 | (CATGGTGG)13→1 | 24.5% | intergenic (‑28/+60) | sad‑I ← / ← PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/xenobiotic reductase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2837075 | 14 (0.220) | 4 (0.070) | 4/240 | NT | 24.5% | intergenic (‑27/+156) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/xenobiotic reductase |
| ? | NC_002947 | 2837172 = | 12 (0.200) | intergenic (‑124/+59) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/xenobiotic reductase | |||||
AGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGA > NC_002947/2836934‑2837222 | aGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtg > 3:193688/1‑149 (MQ=255) tCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggca < 1:400957/142‑1 (MQ=255) tCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggca > 2:400957/1‑142 (MQ=255) gAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTAGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGaatggtggca > 1:304818‑M1/1‑139 (MQ=255) gAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggt < 4:193688/149‑1 (MQ=255) cgcTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGAACTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtgccag > 1:35123/1‑148 (MQ=255) ggtATGTGGGTCGTGCAGCGCCTGATTGACCTGTGCGTCGGT‑GGTTGCTGGGAAGGTCTTGAGGAATTCCCCGTTATTGGGGTTTATTGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatg < 7:97149/147‑1 (MQ=255) gcTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGATGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgttgcatggtggcatggtggcatggtgtcatg > 1:327786/1‑149 (MQ=255) gcTATGTGCGTCGTCCAGCGACTGATTGAGCTGGTCGTCTGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatg < 7:153714/149‑1 (MQ=255) tgtgCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggt < 8:240239/147‑1 (MQ=255) tgtgCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggt < 2:239364/147‑1 (MQ=255) tcgtcCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggt < 2:399483/149‑1 (MQ=255) gtcCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GTTTTCTTGGAATGTCTTGAGGAATTACGCGTTATAGGTGTTGATAGTGGCTTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtgtcatggtggcatggtggcatggtggcatggtg < 4:216957/148‑1 (MQ=38) ccTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggca > 1:148769/1‑134 (MQ=255) ccTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggca < 2:148769/134‑1 (MQ=255) ggAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGaatggtggcatgaaaagctgcggtatttccgtacgtggtgacaggggctgaaactcggattactacacag > 1:279056‑M1/1‑79 (MQ=255) gAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGaatggtggcatgaaaacatccggtctttccgtacgtggtgacaggggatga > 6:172584‑M1/1‑78 (MQ=255) ttGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtgtcatggggtcatggtgtaatggtggaatggggggaaggtgcgaatgtggcatgag > 8:53364/1‑147 (MQ=25) ccGTTTTAGTGTTTGATAGCTTCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGaatggtggcatgaaaagctccggtctttccgtacgtggtgacaggggctgaaactcggattactccaccggcgtataccgttcgagccag < 2:279056‑M1/149‑91 (MQ=255) gCATGGTGGaatggtggcatgaaaagctccggtctttccgtacgtggtgacaggggctgaaactcggattactccaccggcgtataccgttcgagccagtgggcgtaaggggggggcagtacccatgcggggcgctcgacgccaagggt > 2:108126‑M1/1‑9 (MQ=255) gCATGGTGGaatggtggcatgaaaagctccgggctttccgtacgtggggacaggggctgaaactcggattactccaccggcgtataccgttcgagccagtgggcgtaaggggggggcagtacccatgcggggcgctcgacgccaagggt < 3:50990‑M1/149‑141 (MQ=255) atggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggaatgctggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTATCCGTACGTGGTGACAgcg > 4:201720/1‑147 (MQ=255) gtggaatggtggcatgaaaagctccggtctttccgtacgtggtgacaggggctgaaactcggattactccaccggcgtataccgttcgagccagtgggcgtaaggggggggcagtacccatgcggggcgctcgacgccaagggtgcgag > 8:269711‑M1/1‑4 (MQ=255) ggaatggtggcatgaaaagctccggtctttccgtacgtggtgacaggggctgaaactcggattactccaccggcgtataccgttcgagacagtgggcgtaaggggggggaagtacccatgcggggcgctcgacgccaagggtgcgagct > 5:7658‑M1/1‑2 (MQ=255) | AGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGT‑GGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGA > NC_002947/2836934‑2837222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |