| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_002947 | 2,837,076 | (CATGGTGG)13→1 | 24.5% | intergenic (‑28/+60) | sad‑I ← / ← PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/xenobiotic reductase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2837075 | 14 (0.220) | 4 (0.070) | 4/240 | NT | 24.5% | intergenic (‑27/+156) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/xenobiotic reductase |
| ? | NC_002947 | 2837172 = | 12 (0.200) | intergenic (‑124/+59) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/xenobiotic reductase | |||||
TAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAGGGGGGGGCAGTACCCATGCGGGGCGCTCGACGCCAAGGGTGCGAGCTGC > NC_002947/2837033‑2837320 | gaggaacgcgctatgtgcgtcgtccagcgcctgattgacctggtcgtcggtaggtttctgggaaggtcttgagcaattccccgttataggggttgatagtggcgtaagccatgtgattctcctactcgtggcatggtggAATGGTGGCa > 1:304818‑M2/140‑149 (MQ=255) atggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggaatgctggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTATCCGTACGTGGTGACAgcg > 4:201720/1‑147 (MQ=255) ggaaggtcttgagcaattccccgttataggggttgatagtggcgtaagccatgtgattctcctactcgtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTGCGGTATTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTActacacag > 1:279056‑M2/80‑147 (MQ=255) gaaggtcttgagcaattccccgttataggggttgatagtggcgtaagccatgtgattctcctactcgtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAACATCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGATGa > 6:172584‑M2/79‑129 (MQ=255) ggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCg > 5:143036/1‑149 (MQ=255) ccgttttagtgtttgatagcttcgtaagccatgtgattctcctactcgtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAg < 2:279056‑M2/90‑1 (MQ=255) gtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGAt > 1:224056/1‑104 (MQ=255) gtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGAt < 2:224056/104‑1 (MQ=255) gcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAgggggggg > 3:399677/1‑148 (MQ=255) gcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAgggggggg < 4:399677/148‑1 (MQ=255) tggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTc < 3:391070/64‑1 (MQ=255) tggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTc > 4:391070/1‑64 (MQ=255) gcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAGGGGGGGGCAGTAccaa > 7:304903/1‑147 (MQ=255) tggtggcatggtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAGGGGGGGGCAGTACCCAttc > 8:103275/1‑147 (MQ=255) gggcatggtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAAATCGGATTACTCCACCGGCGTATAACGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAGGGGGGGGCAGTACCCATCCggg > 1:37832/2‑149 (MQ=255) gtggcatggtggcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAGGGGGGGGCAGTACCCATGCGGGGCGCTc < 6:143036/148‑1 (MQ=255) gcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAGGGGGGGGCAGTACCCATGCGGGGCGCTCGACGCCAAGGGt > 2:108126‑M2/10‑149 (MQ=255) gcatggtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGGCTTTCCGTACGTGGGGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAGGGGGGGGCAGTACCCATGCGGGGCGCTCGACGCCAAGGGt < 3:50990‑M2/140‑1 (MQ=255) gtggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAGGGGGGGGCAGTACCCATGCGGGGCGCTCGACGCCAAGGGTGCGAg > 8:269711‑M2/5‑149 (MQ=255) ggAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGACAGTGGGCGTAAGGGGGGGGAAGTACCCATGCGGGGCGCTCGACGCCAAGGGTGCGAGCt > 5:7658‑M2/3‑149 (MQ=255) aaTGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAGGGGGGGGCAGTACCCATGCGGGGCGCTCGACGCCAAGGGTGCGAGCTGc < 1:108126/149‑1 (MQ=255) | TAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGACAGGGGCTGAAACTCGGATTACTCCACCGGCGTATACCGTTCGAGCCAGTGGGCGTAAGGGGGGGGCAGTACCCATGCGGGGCGCTCGACGCCAAGGGTGCGAGCTGC > NC_002947/2837033‑2837320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |