New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2881022 = | 46 (0.710) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 8.7% | coding (864/1176 nt) | PP_2535 | transport protein |
? | NC_002947 | 2881070 = | 41 (0.670) | coding (912/1176 nt) | PP_2535 | transport protein |
CGGCCATGCTGGTGCTGTTCGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGG > NC_002947/2880877‑2881167 | ccccgcattgatcactgcgccgcccagcgccgcaccgatcgcattgcccaggttgaacgcgccaatgttcaccgcagaggccaggttgggggcatccttggccgcttccatgacccgcatttgcagcggcggcaccagggcaaagCTgg > 8:203941‑M1/146‑149 (MQ=255) cccgcattgatcactgcgccacccagcgccgcaccgatcgcattgcccaggttgaacgcgccaatgttcaccgcagaggccaggttgggggcatccttggccgcttccatgacccgcatttgcagtggcggcaccagggcaaagCTGGc > 4:23377‑M1/145‑149 (MQ=255) cccgcattcatcactgcgccgcccagcgccgcaccgatcgcattgcccaggtttaacgcgccaatgttctccgcagaggccaggttgggggcatccttggccgcttccatgacccgcatttgcagcggcggcaccagggcaaagCTGGc > 7:28403‑M1/145‑149 (MQ=255) cTGGTGCTGTTCGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGc < 6:154135/148‑1 (MQ=255) gCTGTTCGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCg > 3:188988/1‑149 (MQ=255) cgccgcccagcgccgcaccgatcgcattgcccaggttgaacgcgccaatgttcaccgcagaggccaggttgggggcatccttggccgcttccatgacccgcatttgcagcggcggcactagggcaaagCTGGCCGCTGCCGACCGCCtt < 3:399053‑M1/21‑1 (MQ=255) ggTGTCGGCCTGACCTTGGGCAAGGTGTGGGGGGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTgg < 6:312364/148‑1 (MQ=255) ggTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTgg < 2:385450/148‑1 (MQ=255) ggCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATcc < 2:41340/148‑1 (MQ=255) ggCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCt > 5:237265/1‑149 (MQ=255) ggCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCt > 1:313613/1‑149 (MQ=255) gCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTg < 6:237265/149‑1 (MQ=255) cTGCCCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAATGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGt > 7:120474/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTg > 4:254868/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTg > 5:405879/1‑149 (MQ=255) ccTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTgg > 3:315968/1‑149 (MQ=255) cTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTggg < 6:405879/149‑1 (MQ=255) ttGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATGCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTgggg > 2:152520/1‑149 (MQ=255) cgatcgcattgcccaggttgaacgcgccaatgttcaccgcagaggccaggttgggggcatccttggccgcttccatgacccgcatttgcagcggcggcaccagggcaaagCTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTgggg < 8:145808‑M1/39‑1 (MQ=255) tcAACGTGTGGGGTGGCATGGCGGCGGACCTCTCGATCGATCGCACTCTGTTCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGGCGTGCTGCTGGTGTATCCGCTGGTACTGGTCTGGCCGCTGCAGACCGACTTGGCGTTGCTGGTCTGTGGTGCg < 6:61019/148‑1 (MQ=255) ttgcccaggttgaacgcgccaatgttcaccgcagaggccaggttgggggcatccttggccgcttccatgacccgcatttgcagcggcggcaccagggcaaagCTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCa > 7:145808‑M1/103‑149 (MQ=255) ggggTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCACACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCttt > 8:89408/1‑149 (MQ=255) caggttgaacgcgccaatgttcaccgcagaggccaggttgggggcatccttggccgcttccatgacccgcatttgcagcggcggcactagggcaaagCTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCttt > 4:399053‑M1/98‑149 (MQ=255) gggTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCttt < 7:45327/148‑1 (MQ=255) cAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGt > 2:263830/1‑123 (MQ=255) cAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGt < 1:263830/123‑1 (MQ=255) aGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTg > 7:43311/1‑149 (MQ=255) gcggcgGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTgcc > 2:175515/1‑149 (MQ=255) gcggcgGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTgcc > 2:169457/1‑149 (MQ=255) aCCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCGGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTg < 8:27270/149‑1 (MQ=255) ccGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGc < 8:120474/149‑1 (MQ=255) gatcgatgGCACTCTGATCCTGTCACTGACTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGc < 5:298069/149‑1 (MQ=255) tcgatcaCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCgg < 7:89408/149‑1 (MQ=255) aCTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATgg > 3:402075/1‑148 (MQ=255) aCTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGccgccg < 2:233801/115‑1 (MQ=255) aCTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGccgccg > 1:233801/1‑115 (MQ=255) gctgggctgATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGc < 4:80802/137‑1 (MQ=255) gctgggctgATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGc > 3:80802/1‑137 (MQ=255) tgctgcTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCg < 4:402075/149‑1 (MQ=255) tgctgcTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCg > 6:243363/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGt < 7:100634/149‑1 (MQ=255) tgctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTg < 1:175515/149‑1 (MQ=255) gctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGa < 8:43311/149‑1 (MQ=255) ctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTg < 1:169457/147‑1 (MQ=255) ctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTg < 4:315968/147‑1 (MQ=255) tgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGcc < 6:51744/77‑1 (MQ=255) tgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGcc > 5:51744/1‑77 (MQ=255) gtgtTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACAt > 4:184890/1‑149 (MQ=255) gtgtTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGGGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAAc < 3:254868/147‑1 (MQ=255) tttCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGACCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTgg > 2:379149/1‑149 (MQ=255) tCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGGGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGGCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGgc < 4:188988/148‑1 (MQ=255) gCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGt > 7:26227/1‑149 (MQ=255) cTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGACCCTTGGCGCGtt > 4:83861/1‑149 (MQ=255) ggactggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTgg > 3:25112/1‑149 (MQ=255) gactggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGt < 7:90552/62‑1 (MQ=255) gactggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGt > 8:90552/1‑62 (MQ=255) | CGGCCATGCTGGTGCTGTTCGGTGTCGGCCTGACCTTGGGCAACGTGTGGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGG > NC_002947/2880877‑2881167 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |