New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2881022 = | 46 (0.710) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 8.7% | coding (864/1176 nt) | PP_2535 | transport protein |
? | NC_002947 | 2881070 = | 41 (0.670) | coding (912/1176 nt) | PP_2535 | transport protein |
GGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGGCGGCGCAGTGATCAATGCGGGG > NC_002947/2880925‑2881214 | ggggTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCACACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCttt > 8:89408/1‑149 (MQ=255) caggttgaacgcgccaatgttcaccgcagaggccaggttgggggcatccttggccgcttccatgacccgcatttgcagcggcggcactagggcaaagCTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCttt > 4:399053‑M1/98‑149 (MQ=255) gggTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCttt < 7:45327/148‑1 (MQ=255) aGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTg > 7:43311/1‑149 (MQ=255) gcggcgGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTgcc > 2:175515/1‑149 (MQ=255) gcggcgGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTgcc > 2:169457/1‑149 (MQ=255) aCCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCGGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTg < 8:27270/149‑1 (MQ=255) ccGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGc < 8:120474/149‑1 (MQ=255) gatcgatgGCACTCTGATCCTGTCACTGACTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGc < 5:298069/149‑1 (MQ=255) tcgatcaCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCgg < 7:89408/149‑1 (MQ=255) aCTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATgg > 3:402075/1‑148 (MQ=255) aCTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGccgccg < 2:233801/115‑1 (MQ=255) aCTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGccgccg > 1:233801/1‑115 (MQ=255) gctgggctgATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGc < 4:80802/137‑1 (MQ=255) gctgggctgATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGc > 3:80802/1‑137 (MQ=255) tgctgcTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCg < 4:402075/149‑1 (MQ=255) tgctgcTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCg > 6:243363/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGt < 7:100634/149‑1 (MQ=255) tgctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTg < 1:175515/149‑1 (MQ=255) gctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGa < 8:43311/149‑1 (MQ=255) ctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTg < 4:315968/147‑1 (MQ=255) ctgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTg < 1:169457/147‑1 (MQ=255) tgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGcc < 6:51744/77‑1 (MQ=255) tgGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGcc > 5:51744/1‑77 (MQ=255) gtgtTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACAt > 4:184890/1‑149 (MQ=255) gtgtTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGGGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAAc < 3:254868/147‑1 (MQ=255) tttCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGACCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTgg > 2:379149/1‑149 (MQ=255) tCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGGGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGGCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGgc < 4:188988/148‑1 (MQ=255) gCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGt > 7:26227/1‑149 (MQ=255) cTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGACCCTTGGCGCGtt > 4:83861/1‑149 (MQ=255) aaagctggccgcaccccagaccaggatcgccaaggcggtcggcagcggccagCTTTGCCCTAGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTg > 4:399053‑M2/53‑149 (MQ=255) ggactggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTgg > 3:25112/1‑149 (MQ=255) gactggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGt < 7:90552/62‑1 (MQ=255) gactggCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGt > 8:90552/1‑62 (MQ=255) tggccgcaccccagaccaggatcgccaaggcggtcggcagcggccagCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCaa > 7:145808‑M2/48‑149 (MQ=255) TGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCaa < 7:387012‑M1/149‑1 (MQ=255) GCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTTAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATg > 2:313613‑M1/1‑149 (MQ=255) ccccagaccaggatcgccaaggcggtcggcagcggccagCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCg < 8:145808‑M2/110‑1 (MQ=255) gACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATcactg > 6:386787/1‑145 (MQ=255) gACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTg > 6:22659/1‑149 (MQ=255) cGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGACCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTgcgg < 1:379149/149‑1 (MQ=255) ttGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCt > 5:228012/1‑149 (MQ=255) ggCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTgg > 4:336995/1‑149 (MQ=255) gATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGggcg > 6:133748/1‑149 (MQ=255) ccTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGgcggcg > 7:137082/1‑149 (MQ=255) ccTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGgcggcg > 6:9568/1‑149 (MQ=255) aaggcggtcggcagcggccagCTTTGCCCTAGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGgcggcg < 3:399053‑M2/128‑1 (MQ=255) tGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGgcggcg > 4:93578/1‑147 (MQ=255) ggTCGGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGGCGGCGCAg < 1:152520/149‑1 (MQ=255) gTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGGCGGCGCAGt < 4:25112/149‑1 (MQ=255) gTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTgg < 2:169433/132‑1 (MQ=255) gTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTgg > 1:169433/1‑132 (MQ=255) gccagCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGAGAACATTGGCGCGTTAAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGGCGGCGCAGTGATGAATGCggg > 7:28403‑M2/6‑149 (MQ=255) gccagCTTTGCCCTGGTGCCGCCACTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGGTGGCGCAGTGATCAATGCggg > 4:23377‑M2/6‑149 (MQ=255) ccagCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGGCGGCGCAGTGATCAATGCgggg > 8:203941‑M2/5‑149 (MQ=255) | GGGGTGGCAAGGCGGCGGACCGCTCGATCGATCGCACTCTGATCCTGTCACTGGCTGGGCTGATTGCCGTGCTGCTGGTGTTTCCGCTGGTACTGGACTGGCCGCTGCCGACCGCCTTGGCGATCCTGGTCTGGGGTGCGGCCAGCTTTGCCCTGGTGCCGCCGCTGCAAATGCGGGTCATGGAAGCGGCCAAGGATGCCCCCAACCTGGCCTCTGCGGTGAACATTGGCGCGTTCAACCTGGGCAATGCGATCGGTGCGGCGCTGGGCGGCGCAGTGATCAATGCGGGG > NC_002947/2880925‑2881214 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |