New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2921662 | 39 (0.600) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 7.7% | coding (10682/10827 nt) | PP_2561 | hemolysin‑type calcium‑binding bacteriocin |
? | NC_002947 | = 2921684 | 34 (0.540) | coding (10704/10827 nt) | PP_2561 | hemolysin‑type calcium‑binding bacteriocin |
GTGGGGCCGGTAACGACACCATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAGATGCAACCACGGTGACCGCCGCAGACTTCATCCTGGCC > NC_002947/2921515‑2921801 | gtgggGCCGGTAACGACACCATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACGTGATCATCAATTTCGAAAACATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCAcc > 1:130128/1‑149 (MQ=255) gggCCGGTAACGACACCATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCa < 2:103416/149‑1 (MQ=255) gCCGGTAACGACACCATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGc > 6:14803/1‑149 (MQ=255) gTAACGACACCATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCAcc > 1:5537/1‑149 (MQ=255) aCGACACCATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCttt < 3:364728/149‑1 (MQ=255) acCATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGc > 3:357611/1‑149 (MQ=255) cATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGc > 7:48913/1‑147 (MQ=255) cATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGc > 6:7030/1‑147 (MQ=255) cATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGc > 6:1247/1‑147 (MQ=255) cGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACactggcaccaaaggtggctgcggtgatgttga < 3:223363‑M1/149‑33 (MQ=255) tGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCAAGGACCGGCTGGATATAACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGTTGCCAGTGTTACCATCGcc > 5:26213/1‑148 (MQ=255) cGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTg < 1:372087/149‑1 (MQ=255) tgtgTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTg > 5:357133/1‑149 (MQ=255) ttCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCtt < 1:192924/149‑1 (MQ=255) cGCTGCAGGCTTTGTCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGTCCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTg < 1:189903/148‑1 (MQ=255) gCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGtgct > 4:261235/1‑149 (MQ=255) gCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGtgc < 2:130128/148‑1 (MQ=255) cGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCg < 2:5537/149‑1 (MQ=255) atcatcAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACCTCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTcc < 5:1247/147‑1 (MQ=255) atcatcAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTcc < 5:7030/147‑1 (MQ=255) catcaATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACactggcaccaaaggtggctgcggtg < 8:160200‑M1/91‑26 (MQ=255) catcaATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACactggcaccaaaggtggctgcggtg > 7:160200‑M1/1‑66 (MQ=255) catcaATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGtgct < 8:25600/136‑1 (MQ=255) catcaATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGtgct > 7:25600/1‑136 (MQ=255) atcaATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACg > 4:384048/1‑149 (MQ=255) aaTTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGttt > 7:213052/1‑149 (MQ=255) aTGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTgggg < 8:48913/149‑1 (MQ=255) tGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTggggg < 3:25880/149‑1 (MQ=255) ccATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCCCCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCATTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTg > 7:257022/1‑149 (MQ=255) ccATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGt < 3:384048/148‑1 (MQ=255) ttGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCa < 3:261235/149‑1 (MQ=255) gcggcgGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACAACTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTgg > 2:117148/1‑145 (MQ=255) gggTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAGATGCaa > 5:61366/1‑149 (MQ=255) cAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAGATGCAACCACGGt > 7:124123/1‑149 (MQ=255) aGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAGATGCAACCACGGTg < 5:14803/149‑1 (MQ=255) gCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAGATGCAACCACGGTGAccgccg > 2:29373/1‑149 (MQ=255) tatCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAGATGCAACCACGGTGACCGCCGCAGACt < 6:357133/149‑1 (MQ=255) cACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAg > 3:220919/1‑119 (MQ=255) cACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAg < 4:220919/119‑1 (MQ=255) ccGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGt < 2:29817/73‑1 (MQ=255) ccGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGt > 1:29817/1‑73 (MQ=255) cccTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAGATGCAACCACGGTGACCGCCGCAGACTTCATCCTg > 8:175457/1‑149 (MQ=255) ccTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAGATGCAACCACGGTGACCGCCGCAGACTTCATCCTgg < 7:175457/149‑1 (MQ=255) cTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAGATGCAACCACGGTGACCGCCGCAGACTTCATCCTGGc < 8:124123/149‑1 (MQ=255) tCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTgtgatgttgagggcggtgatatccagccggtcctggccacccgccgcaatggcatcgaaattgatgatcaggtcgttgccaaagcctgcagcgaactggaacacatcgtttccatcg < 3:223363‑M2/149‑118 (MQ=255) cACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTgtgatgttgagggcggtgatatccagccggtcctggccacccgccgcaatggcatcgaaattgatg > 7:160200‑M2/1‑25 (MQ=255) cACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTgtgatgttgagggcggtgatatccagccggtcctggccacccgccgcaatggcatcgaaattgatg < 8:160200‑M2/91‑67 (MQ=255) | GTGGGGCCGGTAACGACACCATGATCGCCACCGATGGAAACGATGTGTTCCAGTTCGCTGCAGGCTTTGGCAACGACCTGATCATCAATTTCGATGCCATTGCGGCGGGTGGCCAGGACCGGCTGGATATCACCGCCCTCAACATCACCGCAGCCACCTTTGGTGCCAGTGTGACCATCGCCGATGTTGGTGCGGACACCTTGGTAAGCATCGGTGCTGCCGACTCCATACGTTTGGTGGGGGTGGCAGATGCAACCACGGTGACCGCCGCAGACTTCATCCTGGCC > NC_002947/2921515‑2921801 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |