| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 3991309 = | 78 (1.200) | 5 (0.080) | 5/248 | NT | 7.6% | coding (318/894 nt) | PP_3517 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 3991355 = | 48 (0.790) | coding (272/894 nt) | PP_3517 | hypothetical protein | |||||
GGGTCGCGTAGTCCATTTGCGCATCGTGATAGGCCAACAGCGACTGCAGAACACCCAGCTCGTTGCGCCCGATACGACGGGCGCGGATTTCGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGTTGCACACCACCGCGCGGTATGTAGGTG > NC_002947/3991161‑3991447 | gccaggaaaaacctgatgaagcccgcctggcccagttgctgggcgatgactggcgcacctacataccgcgcggtggtgtgcaacgcagcgatgtggatacctttctcgagcagtatcgcgcacagcacagcatcgacatgtcaggcgag > 7:313909‑M1/149‑149 (MQ=255) ggTCGCGTAGTCCATTTGCGCATCGTGATAGGCCAACAGCGACTGCAGAACACCCAGCTCGTTGCGCCCGATACGACGGGCGCGGATTTCGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATgg < 4:305175/149‑1 (MQ=255) ggTCGCGTAGTCCATTTGCGCATCGTGATAGGCCAACAGCGACTGCAGAACACCCAGCTCGTTGCGCCCGATACGACGGGCGCGGATTTCGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATgg < 6:264934/149‑1 (MQ=255) ccaggaaaaacctgatgaagcccgcctggcccagttgctgggcgatgactggcgcacctacataccgcgcggtggtgtgcaacgcagcgatgtggatacctttctcgagcagtatcgcgcacagcacagcatcgacatgtcaggcgagg > 4:212574‑M1/148‑149 (MQ=255) ccaggaaaaacctgatgaagcccgcctggcccagttgctgggcgatgactggcgcacctacataccgcgcggtggtgtgcaacgcagcgatgtggatacctttctcgagcagtatcgcgcacagcacagcatcgacatgtcaggcgagg > 7:170222‑M1/148‑149 (MQ=255) tCGCGTAGTCCATTTGCGCATCGTGATAGGCCAACAGCGACTGCAGAACACCCAGCTCGTTGCGCCCGATACGACGGGCGCGGATTTCGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGc < 7:16895/149‑1 (MQ=255) gaaaaacctgatgaagcccgcctggcccagttgctgggcgatgactggcgcacctacataccgcgcggtggtgtgcaacgcagcgatgtggatacctttctcgagcagtatcgcgcacagcacagcatcgacatgtcaggcgaGGGc < 4:121691‑M1/4‑1 (MQ=255) cgTAGTCCATTTGCGCATCGTGATAGGCCAACAGCGACTGCAGAACACCCAGCTCGTTGCGCCCGATACGACGGGCGCGGATTTCGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAg < 8:342979/149‑1 (MQ=255) aaaaacctgatgaagcccgcctggcccagttgctgggcgatgactggcgcacctacataccgcgcggtggtgtgcaacgcagcgatgtggatacctttctcgagcagtatcgcgcacagcacagcatcgacatgtcaggcgaGGGCaa > 5:234375‑M1/143‑148 (MQ=255) aaaaacctgatgaagcccgcctggcccagttgctgggcgatgactggcgcacctacataccgcgcggtggtgtgcaacgcagcgatgtggatacctttctcgagcagtatcgcgcacagcacagcatcgacatgtcaggcgaGGGCAAg < 7:277158‑M1/7‑1 (MQ=255) gTAGTCCATTTGCGCATCGTGATAGGCCAACAGCGACTGCAGAACACCCAGCTCGTTGCGCCCGATACGACGGGCGCGGATTTCGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAgg > 5:373786/1‑149 (MQ=255) gTCCATTTGCGCATCGTGATAGGCCAACAGCGACTGCAGAACACCCAGCTCGTTGCGCCCGATACGACGGGCGCGGATTTCGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCa < 6:96681/143‑1 (MQ=255) gTCCATTTGCGCATCGTGATAGGCCAACAGCGACTGCAGAACACCCAGCTCGTTGCGCCCGATACGACGGGCGCGGATTTCGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCa > 5:96681/1‑143 (MQ=255) gTCCATTTGCGCATCGTGATAGGCCAACAGCGACTGCAGAACACCCAGCTCGTTGCGCCCGATACGACGGGCGCGGATTTCGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTc > 5:308785/1‑148 (MQ=255) 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cGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATgg > 4:131849/1‑96 (MQ=255) gCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGaaa < 8:6851/149‑1 (MQ=255) cACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGGTGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAg < 3:211557/149‑1 (MQ=255) cACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAg < 7:285062/149‑1 (MQ=255) cACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAg > 7:128132/1‑149 (MQ=255) cTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGt < 4:183960/149‑1 (MQ=255) cTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACAt < 1:213289/149‑1 (MQ=255) ttGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATc > 3:69945/1‑149 (MQ=255) ggTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTg < 8:128132/149‑1 (MQ=255) gTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGc > 7:206148/1‑149 (MQ=255) cGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGt > 2:219641/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGAGGTCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGt < 6:24087/148‑1 (MQ=255) aaGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGTTg < 1:219641/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGTTGcac < 2:184562/149‑1 (MQ=255) cccTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGTTGCACaccacc < 4:51621/149‑1 (MQ=255) gctggTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGTTGCACACCACcgcgc < 5:205397/148‑1 (MQ=255) tggTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGTTCCACACCACCGCGCgg > 8:277158/1‑148 (MQ=255) gTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGTTGCACACCACCGCGCGGTATGTAGGt > 3:121691/1‑149 (MQ=255) tCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGTTGCACACCACCGCGCGGTATGTAGGTg > 5:324013/1‑149 (MQ=255) | GGGTCGCGTAGTCCATTTGCGCATCGTGATAGGCCAACAGCGACTGCAGAACACCCAGCTCGTTGCGCCCGATACGACGGGCGCGGATTTCGGCACTGCCCGCCTTGAGGTCGAAGCGCCAGCCCTGGCTGGTTCTGGTCAGCGGTATGGGCAAGGTCCAGTGACCGGCGCCCACCGCCAGGATGGCCTTGCCCTCGCCTGACATGTCGATGCTGTGCTGTGCGCGATACTGCTCGAGAAAGGTATCCACATCGCTGCGTTGCACACCACCGCGCGGTATGTAGGTG > NC_002947/3991161‑3991447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |