New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4389226 = | 76 (1.170) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 5.6% | coding (1515/1956 nt) | PP_3865 | tail protein |
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GACGCCCTGCGCGACCTGCACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAG > NC_002947/4389079‑4389372 | gACGCCCTGCGCGACCTGCACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTg < 1:175104/149‑1 (MQ=255) aCGCCCTGCGCGACCTGCACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTgg < 7:146650/149‑1 (MQ=255) atctgggagaaggtcgggcagttcttcatcgccctgtgggagctgatcaaggcctacacctcgccgttcttggaattcattaaaagcgtgtttggctgggcccctctggcattgatcatcaagaactgggaaccgttcgtgggcTGGtt > 2:247405‑M1/145‑149 (MQ=255) ccTGCGCGACCTGCACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTc > 1:262241/1‑148 (MQ=255) ccTGCGCGACCTGCACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTc > 3:374907/1‑148 (MQ=255) ccTGCGCGACCTGCACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTc > 5:381817/1‑148 (MQ=255) gagaaggtcgggccgttcttcagcgccctgtgggagctgatcaaggcctacaccacgccgttcatggaattcattaaaagcgtccgtttggctgggccccgctggcattgatcatcaagaactgggaaccgatcgtgggcTGGTTCAAg > 1:120654‑M1/141‑149 (MQ=255) gACCTGCACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACg < 7:39270/149‑1 (MQ=255) aCCTGCACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACgg < 2:212328/149‑1 (MQ=255) gCACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCt > 7:249197/1‑148 (MQ=255) cACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGa < 1:196919/149‑1 (MQ=255) cACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGa > 1:317363/1‑149 (MQ=255) gccgttcttcagcgccctgtgggagctgatcaaggcctacaccacgccgttcatggaattcattaaaagcgtgtttggctgggccccgctggcattgatcatcaagaactgggaaccgatcgtgggcTgg > 6:84430‑M1/128‑130 (MQ=255) gccgttcttcagcgccctgtgggagctgatcaaggcctacaccacgccgttcatggaattcattaaaagcgtgtttggctgggccccgctggcattgatcatcaagaactgggaaccgatcgtgggcTgg < 5:84430‑M1/3‑1 (MQ=255) ggCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCCCCGTCAGGCTCTCGCCGTCAACGCCACCACACAGCTTTAGCAGTGGTTCACGGTACGGGCTGAccc > 8:237775/1‑149 (MQ=255) gttcttcagcgccctgtgggagctgatcaaggcctacaccacgccgttcatggaattcattaaaagcgtgtttggctgggccccgctggcattgatcatcaagaactgggaaccgatcgtgggcTGGTTCAAGGTACGGGCtgacacg < 3:247361‑M1/24‑4 (MQ=255) cATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGAcc > 3:161241/1‑146 (MQ=255) cATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGAcc < 4:161241/146‑1 (MQ=255) cATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGa > 6:186624/1‑149 (MQ=255) 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gcgccgccGGGCACCGCCGTACGGGCCTTCTGCCCGGCATCCCCGCGCTGCACCCGCCCCGGCACGCGCTCGCCGGCCCCCCCCCCAAACACCCTTATCATTGGTTCAACGGAAGGGCTGCCCCGCTCCCACAGCCCCTTGAACCAGcc < 4:349334/147‑1 (MQ=255) tGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGccc < 4:374907/149‑1 (MQ=255) ccgGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGAt < 3:274224/149‑1 (MQ=255) ggCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCg > 3:248518/1‑149 (MQ=255) cACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGtt > 4:302228/1‑149 (MQ=255) 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cGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCAt > 3:184713/1‑148 (MQ=255) tCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGaa > 2:62903/1‑149 (MQ=255) cGCCACCAAACAGCTTTATCAGTGTTTCAATGTACGTGCTGACGCGATCCCACTGACCCTTGAACCAGCCCAAGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGc < 5:18027/149‑1 (MQ=255) cGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCgg > 6:39289/1‑109 (MQ=255) cGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCgg < 5:39289/109‑1 (MQ=255) ccaccaAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCAAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCgt > 4:34197/1‑149 (MQ=255) caAACTGCTTTAGGAGTGGTTGAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCGTTGAACCAGGCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATGAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCttt < 8:80678/123‑1 (MQ=255) caAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCgtggtg > 3:64277/1‑149 (MQ=255) caAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACACCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCttt > 7:80678/1‑123 (MQ=255) aCAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAg < 1:222448/149‑1 (MQ=255) aCAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTAAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAg < 1:228670/149‑1 (MQ=255) catcTTTAGCAGTGGTTCATGGTACGGTCTGACCCGATCCCACATCCCCTTGAAACAGTCCACTATCGGTTCCCAGTTCTTGATTATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTatg < 7:177664/146‑3 (MQ=255) tttAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCACTGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCtt > 3:366096/1‑149 (MQ=255) aGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGa < 4:64277/148‑1 (MQ=255) aGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGa < 3:59458/148‑1 (MQ=255) aGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAg < 2:262241/149‑1 (MQ=255) | GACGCCCTGCGCGACCTGCACGGCATTGGCCTGCACCAGGGCGCCGCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCACGATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAG > NC_002947/4389079‑4389372 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |