New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4389226 = | 76 (1.170) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 5.6% | coding (1515/1956 nt) | PP_3865 | tail protein |
? | NC_002947 | 4389271 = | 65 (1.080) | coding (1470/1956 nt) | PP_3865 | tail protein |
GCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAGCTCCCACAGGGCGCTGAAGAACGGCCCGACCTTCTCCCAGTTGGCGA > NC_002947/4389124‑4389419 | gcTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGc < 5:186624/149‑1 (MQ=255) gcTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGc < 8:226452/149‑1 (MQ=255) gcgccgccGGGCACCGCCGTACGGGCCTTCTGCCCGGCATCCCCGCGCTGCACCCGCCCCGGCACGCGCTCGCCGGCCCCCCCCCCAAACACCCTTATCATTGGTTCAACGGAAGGGCTGCCCCGCTCCCACAGCCCCTTGAACCAGcc < 4:349334/147‑1 (MQ=255) tGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGccc < 4:374907/149‑1 (MQ=255) ccgGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GAt < 3:274224/149‑1 (MQ=255) ggCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCg > 3:248518/1‑149 (MQ=255) cACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGtt > 4:302228/1‑149 (MQ=255) cTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTcc < 8:276083/149‑1 (MQ=255) tGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGCCCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTcc > 3:242526/1‑148 (MQ=255) tGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTcc > 4:141328/1‑148 (MQ=255) aGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCa < 2:317363/148‑1 (MQ=255) gTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGt > 7:254316/1‑149 (MQ=255) ttACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGtt > 5:220627/1‑149 (MQ=255) tACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGtt < 3:302228/148‑1 (MQ=255) cGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCtt < 8:254316/149‑1 (MQ=255) gggCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTtg < 8:76159/149‑1 (MQ=255) tttCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTtgatg > 8:317681/1‑148 (MQ=255) tttCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGCGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTtgatga > 8:330669/1‑149 (MQ=255) 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tCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCt < 8:102400/136‑1 (MQ=255) aGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCg > 5:248786/1‑149 (MQ=255) ggcAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTTTCAGTGGTTCAAGGTACGGGGTGACCCGATCCCACAGGCCCTTGAACCATCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCgg < 6:408576/147‑1 (MQ=255) ggCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGcc < 8:242382/149‑1 (MQ=255) cccgctggcattgatcatcaagaactgggaaccgatcgtgggcTGGTTCAAGGTATGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAg > 3:17124‑M1/44‑89 (MQ=255) cccgctggcattgatcatcaagaactgggaaccgatcgtgggcTGGTTCAAGGTAAGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAg < 4:17124‑M1/46‑1 (MQ=255) cGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGCATGACCCGATCCCAAAGCACCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGGTCCCAGTTCGTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCtat > 6:18027/1‑147 (MQ=255) gTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCtttt < 6:381817/149‑1 (MQ=255) aGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTaa < 7:330669/148‑1 (MQ=255) tctcGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAAt > 2:240095/1‑149 (MQ=255) gCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTcc < 4:347413/148‑1 (MQ=255) 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aGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGa < 4:64277/148‑1 (MQ=255) aGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGa < 3:59458/148‑1 (MQ=255) aGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAg < 2:262241/149‑1 (MQ=255) ctggttcaaggggctgtgggatcgggtcagcccttaccttgaaccaGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCggg < 4:17124‑M2/43‑1 (MQ=255) ctggttcaaggggctgtgggatcgggtcagcccataccttgaaccaGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCggg > 3:17124‑M2/47‑89 (MQ=255) gttcaaggggctgtgggatcgggtcagcccgtaccttgaaccaGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAGCTcc > 4:247361‑M2/44‑149 (MQ=255) 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cttgaaccaGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAACGGACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAGCTCCCACAGGGCGCTGAAGAACGGCCCGACCTtctc > 1:120654‑M2/10‑149 (MQ=255) aaccaGCCCAC‑GAACGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGAGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTCCAAGAACGGCGAGGTGTAGGCCTTGATCAGCTCCCACAGGGCGATGAAGAACTGCCCGACCTTCTCCcagat > 2:247405‑M2/6‑147 (MQ=255) ccaGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAGCTCCCACAGGGCGCTGAAGAACGGc > 6:84430‑M2/4‑130 (MQ=255) ccaGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAGCTCCCACAGGGCGCTGAAGAACGGc < 5:84430‑M2/127‑1 (MQ=255) gCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAGCTCCCACAGGGCGCTGAAGAACGGCCCGACCTTCTCCCAGTTGGcga < 3:66448/149‑1 (MQ=255) | GCTGCCGCCGGCCACTGAGTTACGGGCTTTCTGCTCGTCAGCCAGGCGCTGCACCCGCACCGTCAGGCTCTCGCCGTCACCGCCACCAAACAGCTTTAGCAGTGGTTCAAGGTACGGGCTGACCCGATCCCACAGCCCCTTGAACCAGCCCAC‑GATCGGTTCCCAGTTCTTGATGATCAATGCCAGCGGGGCCCAGCCAAAC‑‑ACGCTTTTAATGAATTCCATGAACGGCGTGGTGTAGGCCTTGATCAGCTCCCACAGGGCGCTGAAGAACGGCCCGACCTTCTCCCAGTTGGCGA > NC_002947/4389124‑4389419 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |