New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4433225 = | 94 (1.440) | 5 (0.080) | 5/252 | NT | 5.6% | coding (220/351 nt) | PP_5648 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4433278 = | 78 (1.260) | coding (167/351 nt) | PP_5648 | hypothetical protein |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GCGATAGCGCCAGCCGTTACAGGCAGGTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGCGCAGTCGGCTTGCC > NC_002947/4433078‑4433366 | gcgATAGCGCCAGCCGTTACAGGCAGGTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACg > 6:415527/1‑149 (MQ=255) gctgcggtgctgatgctggccggttgtgcttctgcgaccatggaaacggcgcgtggcggcaagccgactgcgcagctcgactcgcacaaggcgccagagctggttgcccagtgcatccagttcagctggcaggaagagaaggttttCgg > 4:297886‑M1/147‑149 (MQ=255) gATAGCGCCAGCCGTTACAGGCAGGTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGt < 7:4504/149‑1 (MQ=255) ctgcggtgctgatgctggccggttgtgcttctgcgaccatggaaacggcgcgtggcggcaagccgactgcgcagctcgactcgcacaaggcgccagagctggttgcccagtgcatccagttcagctggcaggaagagaaggttttCGGt > 7:110781‑M1/146‑149 (MQ=255) aTAGCGCCAGCCGTTACAGGCAGGTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGt > 6:288794/1‑148 (MQ=255) gcCAGCCGTTACAGGCAGGTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATcc > 1:104208/1‑149 (MQ=255) gTTACAGGCAGGTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGcc > 1:70770/1‑145 (MQ=255) gTTACAGGCAGGTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGcc < 2:70770/145‑1 (MQ=255) aCAGGCAGGTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTg > 6:399509/1‑149 (MQ=255) ggcaggTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTgcgc < 2:104208/149‑1 (MQ=255) ggcaggTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTgcgc > 5:63814/1‑149 (MQ=255) gcaggTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCGACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGcgcg > 5:241448/1‑149 (MQ=255) gcaggTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGcgcg > 8:1322/1‑149 (MQ=255) aggTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTGACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGc > 1:268702/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTc > 5:357721/1‑149 (MQ=255) ttGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTc > 3:98043/1‑148 (MQ=255) gcagcaGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTCAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAg > 8:165889/1‑149 (MQ=255) cagcagCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAg < 6:203026/148‑1 (MQ=255) agcagcCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAgg > 5:233588/1‑148 (MQ=255) 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ggTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGa < 6:365448/93‑1 (MQ=255) gTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGTACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCt > 2:64974/1‑149 (MQ=255) aaaCGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTtg > 2:319323/1‑149 (MQ=255) aCGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTcc > 1:135663/1‑63 (MQ=255) aCGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTcc < 2:135663/63‑1 (MQ=255) cGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGc < 7:230492/149‑1 (MQ=255) gTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTcc > 5:157328/1‑61 (MQ=255) gTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTcc < 6:157328/61‑1 (MQ=255) cGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTc > 7:202516/1‑148 (MQ=255) gAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTc > 2:330486/1‑147 (MQ=255) gAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGa < 4:178114/149‑1 (MQ=255) aCGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGc < 8:307614/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTgc > 7:202217/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTgcg > 6:98718/1‑148 (MQ=255) cTCACGGGTGAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGCGCAGTCg < 5:119457/149‑1 (MQ=255) cTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTACCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGCGCAGTCg > 1:247470/1‑149 (MQ=255) tCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGCGCAGTCgg > 5:294730/1‑149 (MQ=255) cACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGCGCAGTCGGc > 6:406822/1‑149 (MQ=255) cGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAGCCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGCGCAGTCGGCtt < 7:165889/149‑1 (MQ=255) cGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGCGCAGTCGGCtt > 8:301891/1‑149 (MQ=255) ggTAAACACCGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAACACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGCGCAGTCGGCTTgc < 6:19153/149‑1 (MQ=255) gTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGCGCAGTCGGCTTgcc > 2:387318/1‑149 (MQ=255) acacGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCt > 2:68870/1‑129 (MQ=255) acacGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCt < 1:68870/129‑1 (MQ=255) | GCGATAGCGCCAGCCGTTACAGGCAGGTTGCAGCAGCCGCTCGGCGCTGCAGAGCCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGCGCAGTCGGCTTGCC > NC_002947/4433078‑4433366 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |