New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4433225 = | 94 (1.440) | 5 (0.080) | 5/252 | NT | 5.6% | coding (220/351 nt) | PP_5648 | hypothetical protein |
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CCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCAGCATCAGCACCGCAGCCAA > NC_002947/4433132‑4433426 | ccACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGaa > 7:65959/1‑148 (MQ=255) ggcggcaagccgactgcgcagctcgactcgcacaaggcgccagagctggttgcccagtgcatccagttcagctggcaggaagagaaggttttCGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGaaaa > 3:281632‑M1/93‑149 (MQ=255) cACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGaaaa > 8:292127/1‑149 (MQ=255) aCGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGACCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCTCTGGCGTCATCACCGAAAAc > 1:290737/1‑149 (MQ=255) gCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCt < 6:233588/149‑1 (MQ=255) gCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCt > 4:70920/1‑149 (MQ=255) gcaagccgactgcgcagctcgactcgcacaaggcgccagagctggttgcccagtgcatccagttcagctggcaggaagagaaggttttCGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCtt < 7:215563‑M1/61‑1 (MQ=255) cgtcgtTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTtc < 6:357721/149‑1 (MQ=255) gtcgtTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTtct < 2:296875/149‑1 (MQ=255) tcgtTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTtctc < 7:292127/149‑1 (MQ=255) agccgactgcgcagctcgactcgcacaaggcgccagagctggttgcccagtgcatccagttcagctggcaggaagagaaggttttCGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTtctc > 8:215563‑M1/86‑149 (MQ=255) ttCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTc > 6:120017/1‑149 (MQ=255) ttCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTc > 3:169999/1‑149 (MQ=255) 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agtaATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTGAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAAc > 6:119457/1‑149 (MQ=255) taATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTc > 4:30612/1‑134 (MQ=255) taATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTc < 3:30612/134‑1 (MQ=255) taATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTg > 2:74977/1‑149 (MQ=255) aTCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACttg < 5:384692/148‑3 (MQ=255) aTCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTgg < 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gcgcGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGc < 3:70920/147‑1 (MQ=255) gcgGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAg > 7:258222/1‑147 (MQ=255) gcgGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAg > 2:277616/1‑147 (MQ=255) cgGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAg < 4:169999/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTggg < 1:183218/65‑1 (MQ=255) cAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTggg > 2:183218/1‑65 (MQ=255) aGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAAcc < 8:202516/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCa < 2:390953/149‑1 (MQ=255) cGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGATCTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTg < 1:300571/91‑1 (MQ=255) cGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTg > 2:300571/1‑91 (MQ=255) cGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCAg > 7:88394/1‑148 (MQ=255) cGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCAGc < 1:277616/149‑1 (MQ=255) ggCGTCATCACCGACAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCAGCATCa < 6:241448/149‑1 (MQ=255) gCGTCATCCACGAAAAACTTGTCCTCCCTGCATCTGAACTGGATGCAATTGGCAACCATCTCTGGCGGCTTGGGCGTGGCCATCTGCTGCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCAGCATc < 1:319323/148‑1 (MQ=255) cGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGTACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCAGCATCAGc < 1:64974/149‑1 (MQ=255) accgAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCAGCATCAGCACCGCAg > 7:110781‑M2/5‑149 (MQ=255) ccgAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCAGCATCAGCACCGCAGc > 4:297886‑M2/4‑149 (MQ=255) aaaaCCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCAGCATCAGCACCGCAGCCaa > 7:353216/1‑149 (MQ=255) | CCACGCCGTCGTTCTGCTTCGCGTAGTAATCCACACGCGTCCCGCCCGACTGCGGGTAAACGTCCACGAACGCTTCGGCCTCACGGGTAAACACGGTGAATCCGCCCTGCTTGCGCGGCTCCAGGTAGCCGCTGGCGTCATCACCGAAAACCTTCTCTTCCTGCCAGCTGAACTGGATGCACTGGGCAACCAGCTCTGGCGCCTTGTGCGAGTCGAGCTGC‑GCAGTCGGCTTGCCGCCACGCGCCGTTTCCATGGTCGCAGAAGCACAACCGGCCAGCATCAGCACCGCAGCCAA > NC_002947/4433132‑4433426 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |