New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4575531 | 43 (0.660) | 8 (0.130) | 8/244 | NT | 17.3% | intergenic (+49/‑73) | glgX/ybhP‑II | glycogen debranching enzyme/phosphohydrolase |
? | NC_002947 | = 4575558 | 37 (0.620) | intergenic (+76/‑46) | glgX/ybhP‑II | glycogen debranching enzyme/phosphohydrolase |
CCGGAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACT > NC_002947/4575384‑4575677 | ccggAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCg < 2:379751/149‑1 (MQ=255) gAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTg < 5:59614/149‑1 (MQ=255) aGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTgg < 1:328890/149‑1 (MQ=255) cgcAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACg < 2:304243/149‑1 (MQ=255) gcAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGTTAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACgg > 1:333556/1‑149 (MQ=255) cAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGgt < 7:56535/149‑1 (MQ=255) ggggCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTa < 1:370242/149‑1 (MQ=255) gggCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCtgtgggggccggtaca > 5:190027‑M1/1‑133 (MQ=255) agcaCCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGTTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGc > 5:368007/1‑149 (MQ=255) caCCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGccc < 8:337594/149‑1 (MQ=255) ccTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGcccc > 7:31139/1‑148 (MQ=255) gCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCca > 5:270532/1‑147 (MQ=255) aTTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAggg < 6:317469‑M2/149‑4 (MQ=255) ttCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggt < 3:274260‑M1/149‑32 (MQ=255) gATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggttt > 1:328470‑M2/1‑142 (MQ=255) gATAGTACGATCGAGGTGAAGGGGCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGACCGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttg < 5:390076‑M1/149‑35 (MQ=255) tAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggtttggc > 7:179984‑M2/1‑140 (MQ=255) gTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgt < 6:190027‑M1/149‑39 (MQ=255) gTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggtttggcg > 6:42984‑M2/1‑138 (MQ=255) gTTCGAGGTGACGGGTCGGTGGAGGCTGCTGTTGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTCAACGTTCATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCAAAACCGGGTGGTAACGGTGTACCGGCCCCAACAGGGTTTGGCGGCGAc < 4:186798/149‑1 (MQ=255) gTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggc > 8:153169‑M1/1‑107 (MQ=255) gTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggc < 7:153169‑M1/143‑37 (MQ=255) gTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGgcggcgc > 8:96126/1‑147 (MQ=255) aGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGt > 1:402220/1‑147 (MQ=255) tGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCC‑AACCCCGTGGGAACCGTGTACCGGCCCCCACAAGGTTTGGCGGCCACAGTGaag > 7:53661/1‑145 (MQ=255) ggtcggtcGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGt > 5:118498/1‑149 (MQ=255) gtcgATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACt > 8:141791/1‑149 (MQ=255) tcgATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCACGGTTAACtt > 6:157015/1‑149 (MQ=255) gttgctgcTGATGGTGTTGCATTACGACGAGGAGTTAACGGTGATCGCCCAGGCTGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACTGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTc < 6:118498/146‑1 (MQ=255) ctgctgATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGAAGGCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCag > 1:120339/1‑148 (MQ=255) tgctgATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCaggag > 1:308720/1‑148 (MQ=255) ctgATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCTCCACGCCAAACCCGGTTGCAACGGTGTACCGGACCCCACTGGGTTTGGAGGCGAAAGTGAGGCAGGGGTAAATTCAGGAGGaa > 7:289044/1‑149 (MQ=255) ttagggTGTTCCTGTTCGACGTGGTTTTAAGGGTTATAGCCCTGGCTGGTCCTAGGTTGTTA‑‑TCCCCACGCC‑AACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACTGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATc < 8:53661/145‑1 (MQ=255) gtttGCAGTTCCACGCGCTGTCACCGGTTATCGCCCCGGCCGGCCGTACGTTGTGC‑‑CCCCCACCCCAAACCGGGTGGCACGGTTGTCCGGGCCCCCACTGGTTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAg < 4:153591/147‑1 (MQ=255) gCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTc > 5:108954/1‑149 (MQ=255) cAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggttt < 4:196192‑M2/100‑7 (MQ=255) cAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggttt > 3:196192‑M2/1‑94 (MQ=255) gaggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccggg < 5:136853‑M1/88‑31 (MQ=255) gaggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccggg > 6:136853‑M1/1‑58 (MQ=255) gaggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCa < 5:317469/149‑1 (MQ=255) ggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAg > 3:230803/1‑148 (MQ=255) agTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCGCGCAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTGAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTaa > 8:66848/1‑149 (MQ=255) gATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTAAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGc > 7:111003/1‑148 (MQ=255) aTAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACCGTGTACCGGCCACCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGc > 7:38007/1‑147 (MQ=255) ccAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGt > 6:129300/1‑148 (MQ=255) caggTCCTAGGTTGTTA‑‑TCGCCCCGCCAAACCCGGTGGTAAGGGTTTACGGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCa < 8:31139/149‑1 (MQ=255) cTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGcccc > 3:30601/1‑149 (MQ=255) cTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGcccc > 7:241184/1‑149 (MQ=255) tACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGCCAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCg > 2:376320/1‑149 (MQ=255) tACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACACGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCg > 2:381825/1‑149 (MQ=255) gTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGcc > 6:102978/1‑149 (MQ=255) tgtgA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGt > 1:372681/1‑149 (MQ=255) cccacgccaACCCGGGGGGGAACGGTGTACCGCCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGc < 4:30601/148‑1 (MQ=255) acgccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtac < 6:190027‑M2/149‑112 (MQ=255) acgccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTg > 7:66707/1‑149 (MQ=255) cgccaAAGCGGGTGGTAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGc < 8:66707/149‑1 (MQ=255) cgccaAACCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtac > 6:42984‑M1/1‑10 (MQ=255) gccaAACCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtacta > 7:179984‑M1/1‑9 (MQ=255) gccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaac > 8:153169‑M2/1‑36 (MQ=255) gccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaac < 7:153169‑M2/143‑108 (MQ=255) ccaACCCCGGGGGTAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCgg < 1:244891/149‑1 (MQ=255) ccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCgg > 5:46853/1‑149 (MQ=255) ccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCgg < 5:102978/149‑1 (MQ=255) caAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccggtcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgccccttcacctcgatcgtactatc < 5:390076‑M2/149‑116 (MQ=255) caAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGc < 6:182479/97‑1 (MQ=255) caAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGc > 5:182479/1‑97 (MQ=255) aaaCCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtactatc > 1:328470‑M1/1‑6 (MQ=255) aaaCCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactg < 4:196192‑M1/100‑95 (MQ=255) aaaCCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactg > 3:196192‑M1/1‑6 (MQ=255) aCCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtactatcgaa < 3:274260‑M2/149‑119 (MQ=255) ccctgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtactatcgaat < 6:317469‑M1/149‑147 (MQ=255) cccGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctc > 6:136853‑M2/1‑30 (MQ=255) cccGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctc < 5:136853‑M2/88‑59 (MQ=255) | CCGGAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGA‑‑TCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACT > NC_002947/4575384‑4575677 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |