New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4670169 = | 74 (1.140) | 5 (0.080) | 5/258 | NT | 6.4% | coding (501/1470 nt) | nuoN | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
? | NC_002947 | 4670231 = | 75 (1.180) | coding (563/1470 nt) | nuoN | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
TCGGTGGCCTGGTGCTGGTCAGCGCCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGATGCTGGTTG > NC_002947/4670021‑4670317 | ccgacgtacacgtccgggggccacacatggaacggtaccagcgacagcttgcaggccaggccaaacagcatcatgcccaggcccagctgggccaccaggcttggcatgctggtggtagccagggccttgccgatctggtcgaagctcag > 8:289285‑M1/149‑149 (MQ=255) cttcgtacacgtccggggtccacagatggaacggtaccagcgacagcttgaaggccaggccaaccagcatcatgcccaggcccagctgggccaccaggcttggcattctggtggtagccagggccttgccgatctggtcgaagctcagg > 1:96460‑M1/148‑149 (MQ=255) cGGTGGCCTGGTGCTGGTCAGCGCCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCgg > 3:168264/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGTGCTGGTCAGCGCCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCg > 3:7024/1‑148 (MQ=255) ccTGGTGCTGGTCAGCGCCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACGTGGTGCTGTCGGCCGCAg > 6:323383/1‑149 (MQ=255) tGGTGCTGGTCAGCGCCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGc > 6:59938/1‑149 (MQ=255) cTGGTCAGCGCCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCgg < 7:287141/148‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTc < 3:23372/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTc < 4:7024/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTc > 6:240495/1‑149 (MQ=255) aGCGCCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCct > 1:33487/1‑149 (MQ=255) gcgcCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCctg < 7:330813/149‑1 (MQ=255) cgcCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCctgc > 1:69987/1‑149 (MQ=255) cgcCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCctgc > 2:399281/1‑149 (MQ=255) gcCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCa < 8:244071/132‑1 (MQ=255) gcCAACCACCTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCa > 7:244071/1‑132 (MQ=255) ccaccTAGCCGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCg < 1:399281/149‑1 (MQ=255) ccggccggTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTATGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGcc < 4:354584/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTGTTCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGcc > 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ggtaccagcgacagcttgaaggccaggccaaccagcatcatgcccaggcccagctgggccaccaggcttggcatgctggtggtagccagggccttgccgatctgg‑‑CCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTac < 2:273122‑M1/44‑1 (MQ=255) ttCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCctgctg < 2:33487/147‑1 (MQ=255) ttCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGt < 5:59938/148‑1 (MQ=255) ttCATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTa > 5:341244/1‑149 (MQ=255) cATCGGCCTGGAGCTGTTGTCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCTTGCTGTacg > 7:292847/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |