| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4670169 = | 74 (1.140) | 5 (0.080) | 5/258 | NT | 6.4% | coding (501/1470 nt) | nuoN | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
| ? | NC_002947 | 4670231 = | 75 (1.180) | coding (563/1470 nt) | nuoN | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N | |||||
TCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGTTCCATCTGTGGACCCCGGACGTGTACGAAGG > NC_002947/4670086‑4670378 | cagcatcatgcccaggcccagctgggccaccaggcttggcatgctggtggtagccagggccttgccgatctggtcgaagctcaGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAg > 7:96185‑M1/84‑149 (MQ=255) agcatcatgcccaggcccagctgggccaccaggcttggcatgctggtggtagccagggccttgccgatctgggcgaagctcaGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGc > 5:18394‑M1/83‑149 (MQ=255) gTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTTGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCtt < 5:362884/149‑1 (MQ=255) caaccagcatcatgcccaggcccagctgggccaccaggcttggcatgctggtggtagccagggccttgccgatctgg‑‑CCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGAcc > 1:273122‑M1/78‑149 (MQ=255) cGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGAc > 3:230628/1‑149 (MQ=255) gTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGAc > 5:296366/1‑147 (MQ=255) gCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCgg > 2:121824/1‑148 (MQ=255) gCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGc < 2:69020/149‑1 (MQ=255) tATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACGTGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGc < 5:323383/149‑1 (MQ=255) tGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTa < 1:121824/149‑1 (MQ=255) ccatcttcAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTacc < 2:333173/146‑1 (MQ=255) ccTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTac < 5:348255/148‑1 (MQ=255) cttcttCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGAc < 8:293878/124‑1 (MQ=255) cttcttCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGAc > 7:293878/1‑124 (MQ=255) cttcttCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTacca > 8:177545/1‑149 (MQ=255) cttcttCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTacca > 5:235541/1‑149 (MQ=255) cttcAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCCGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTaccac > 8:308494/1‑147 (MQ=255) cttcAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTaccac < 1:311260/147‑1 (MQ=255) cttcAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTaccac < 2:69987/147‑1 (MQ=255) cttcAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCATGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTAccacca > 8:308499/1‑149 (MQ=255) aacaaGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCAt > 4:199833/1‑149 (MQ=255) aacaaGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATAGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCAt < 1:11506/149‑1 (MQ=255) acaaGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGAt > 7:301341/1‑121 (MQ=255) acaaGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGAt < 8:301341/121‑1 (MQ=255) caaGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGc > 2:304114/1‑149 (MQ=255) caaGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGc < 1:304114/149‑1 (MQ=255) aaGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCg < 3:403543/121‑1 (MQ=255) aaGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCg > 4:403543/1‑121 (MQ=255) gATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGc < 8:372077/149‑1 (MQ=255) aTCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGATGTTCGGAATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCTGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGcc > 7:65735/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCtggt > 2:308255/1‑149 (MQ=255) 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gacgccgGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGctgggcctgg > 1:147378/1‑85 (MQ=255) gacgccgGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGctgggcctgg < 2:147378/85‑1 (MQ=255) cgccgGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGTTCCATCTGTGGACCCCGGACg > 3:110476/1‑149 (MQ=255) gccgGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGTTCCATCTGTGGACCCCGGACgt < 1:171098/149‑1 (MQ=255) cctgCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGTTCCATCTGTGGACCCCGGACgtg < 8:65735/146‑1 (MQ=255) cgGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGt < 5:168398/125‑1 (MQ=255) cgGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGt > 6:168398/1‑125 (MQ=255) ggCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGTTCCATCTGTGGAccc > 5:140033/1‑139 (MQ=255) ggCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGTTCCATCTGTGGAccc < 6:140033/139‑1 (MQ=255) cAGCCTGTGGTTCGACCAGTTCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAACCCTGGTGGCCCAGCGGGGCCTGGGCATGTTCGCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGTTCCATCTGTGGACCCCGGACGTGTAc < 1:324658/149‑1 (MQ=255) ccTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCtggtg > 1:169507‑M2/3‑58 (MQ=255) ccTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCtggtg < 2:169507‑M2/56‑1 (MQ=255) ccTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGAATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGTTCCATCTGTGGACCCCGGACGTGTACGAAg > 1:96460‑M2/3‑149 (MQ=255) cTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGTTTGGCCTGGCCTGCAAGCTGTCGCTGGTACCGTTCCATGTGTGGCCCCCGGACGTgtacgtcgg > 8:289285‑M2/2‑145 (MQ=255) | TCGGTACCGGTCTACGGCCTGGTGGCGTATGCCTTCTTCAACAAGCGATCGCTGGAAGCTGGCATCAAGTACATGGTGCTGTCGGCCGCAGGCTCGGCTTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTGTACGCCGACGCCGGCAGCCTGAGCTTCGACCAGATCGGCAAGGCCCTGGCTACCACCAGCATGCCAAGCCTGGTGGCCCAGCTGGGCCTGGGCATGAT‑GCTGGTTGGCCTGGCCTTCAAGCTGTCGCTGGTACCGTTCCATCTGTGGACCCCGGACGTGTACGAAGG > NC_002947/4670086‑4670378 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |