New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4837742 | 54 (0.830) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.4% | coding (311/609 nt) | ccoO‑I | cbb3‑type cytochrome c oxidase subunit |
? | NC_002947 | = 4837792 | 54 (0.870) | coding (361/609 nt) | ccoO‑I | cbb3‑type cytochrome c oxidase subunit |
CGCGATGTCTACATCCGCGAAGGTTGCGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGA > NC_002947/4837597‑4837889 | cgcgATGTCTACATCCGCGAAGGTTGCGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTgg > 2:11217/1‑149 (MQ=255) cgcgATGTCTACATCCGCGAAGGTTGCGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCAAAGAGCACTgg > 8:280478/1‑149 (MQ=255) tCTACATCCGCGAAGGTTGCGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGAc > 7:140092/1‑149 (MQ=255) tACATCCGCGAAGGTTGCGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCt > 6:149900/1‑149 (MQ=255) aTCCGCGAAGGTTGCGTGGGCTGTCACTCGCCGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGc > 4:79944/1‑149 (MQ=255) cgcgAAGGTTGCGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGccc < 8:140092/148‑1 (MQ=255) ttGCGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTg < 4:255020/149‑1 (MQ=255) gCGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGAc < 5:56675/131‑1 (MQ=255) gCGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGAc > 6:56675/1‑131 (MQ=255) cGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGcc > 8:300807/1‑149 (MQ=255) cGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGc < 8:206589/148‑1 (MQ=255) gTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGcca < 8:147756/149‑2 (MQ=255) gggCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGc > 8:25084/1‑148 (MQ=255) tCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACggtgccagtcgtccgagtagcggccaccgactcgggc > 1:106663‑M1/1‑111 (MQ=255) tCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCg < 5:378291/148‑1 (MQ=255) cACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGga > 3:20046/1‑149 (MQ=255) gCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACAACt > 6:43480/1‑149 (MQ=255) gatgatCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTgg > 7:155791/1‑148 (MQ=255) gatgatCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGc < 5:83666/149‑1 (MQ=255) gatCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCAcc > 6:166843/1‑149 (MQ=255) tCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgt < 2:153133‑M2/149‑3 (MQ=255) cGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgtg > 1:68095‑M2/1‑145 (MQ=255) cccGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgtgcgc < 7:219476‑M2/149‑7 (MQ=255) cGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACggtgccagtcgtccgagtagcggccaccgactcgggccaggtccggcccagtgcgctt < 1:160997‑M1/149‑59 (MQ=255) gTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACggtgccagtcgtccgagtagcggccaccgactcgggccaggtccggcccagtgcgcttg < 2:106663‑M1/149‑60 (MQ=255) cgcgCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCTTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGt < 7:275597/148‑1 (MQ=255) cgcgCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTa < 1:153133/149‑1 (MQ=255) cGAGCGTTTCGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCgcgc > 3:379259/1‑148 (MQ=255) aGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTAc > 4:20290/1‑107 (MQ=255) aGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTAc < 3:20290/107‑1 (MQ=255) gCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACg < 1:11217/149‑1 (MQ=255) gTTACGGCCACTACTCCGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACgtg < 7:300807/149‑1 (MQ=255) ggCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGcc < 4:148143/149‑1 (MQ=255) actaatCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAg > 5:134740/1‑149 (MQ=255) ctactCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGt < 7:154547/149‑1 (MQ=255) ctCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGa < 6:401491/144‑1 (MQ=255) ctCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGa > 5:401491/1‑144 (MQ=255) gTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGAt > 4:392056/1‑149 (MQ=255) gTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGAt > 4:385873/1‑149 (MQ=255) cGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGt > 2:115826/1‑149 (MQ=255) ggTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTc < 8:345496/149‑1 (MQ=255) tGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTACGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTcc > 1:166838/1‑148 (MQ=255) aaGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTAcc < 6:66560/149‑1 (MQ=255) cGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGt > 4:94367/1‑149 (MQ=255) accaccCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGtt < 7:25084/149‑1 (MQ=255) accCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGCGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGcc > 5:176855/1‑149 (MQ=255) ttCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGcc < 4:20046/149‑1 (MQ=255) tgGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGa < 6:145244/149‑1 (MQ=255) ggggCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGc < 6:133592/141‑1 (MQ=255) ggggCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGc > 5:133592/1‑141 (MQ=255) gggCTCCAAGCGCACTGGGCCGTACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGac < 3:79944/148‑1 (MQ=255) gCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCgg > 3:394298/1‑141 (MQ=255) gCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCgg < 4:394298/141‑1 (MQ=255) cTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGc < 1:223350/125‑1 (MQ=255) cTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGc > 2:223350/1‑125 (MQ=255) cTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGacaaca < 5:149900/149‑1 (MQ=255) tCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTAACCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAg > 4:251481/1‑149 (MQ=255) cAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgtgcgcttggagccccacaggaacgggtggtcccacacgctttcaccggccaccgagtagtggccgtaacgctcggtttcggcgcggaac < 2:106663‑M2/149‑91 (MQ=255) cAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGc < 8:155791/148‑1 (MQ=255) aaGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgtgcgcttggagccccacaggaacgggtggtcccacacgctttcaccggccaccgagtagtggccgtaacgctcggtttcggcgcggaacg < 1:160997‑M2/149‑92 (MQ=255) aaGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTgg < 3:118267/124‑1 (MQ=255) aaGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTgg > 4:118267/1‑124 (MQ=255) gcgcACggtgccagtcgtccgagtagcggccaccgactcgggccaggtccggcccagtgcgcttggagccccacaggaacgggtggtcccacacgctttcaccggccaccgagtagtggccgtaacgctcggtttcggcgcggaacggg < 7:219476‑M1/149‑144 (MQ=255) gcgcACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGt < 4:246100/116‑1 (MQ=255) gcgcACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGt > 3:246100/1‑116 (MQ=255) cgcACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCacac < 5:166843/149‑1 (MQ=255) gcACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACAcc > 2:280499/1‑149 (MQ=255) cACggtgccagtcgtccgagtagcggccaccgactcgggccaggtccggcccagtgcgcttggagccccacaggaacgggtggtcccacacgctttcaccggccaccgagtagtggccgtaacgctcggtttcggcgcggaacgggcg > 1:68095‑M1/1‑3 (MQ=255) aCggtgccagtcgtccgagtagcggccaccgactcgggccaggtccggcccagtgcgcttggagccccacaggaacgggtggtcccacacgctttcaccggccaccgagtagtggccgtaacgctcggtttcggcgcggaacgggcgga < 2:153133‑M1/149‑148 (MQ=255) aCTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACACCCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGc < 8:51079/141‑1 (MQ=255) aCTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACACCCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGc > 7:51079/1‑141 (MQ=255) | CGCGATGTCTACATCCGCGAAGGTTGCGTGGGCTGTCACTCGCAGATGATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGA > NC_002947/4837597‑4837889 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |