New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4837742 | 54 (0.830) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.4% | coding (311/609 nt) | ccoO‑I | cbb3‑type cytochrome c oxidase subunit |
? | NC_002947 | = 4837792 | 54 (0.870) | coding (361/609 nt) | ccoO‑I | cbb3‑type cytochrome c oxidase subunit |
GATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTACACCGACGA > NC_002947/4837644‑4837937 | gatCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCAcc > 6:166843/1‑149 (MQ=255) tCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgt < 2:153133‑M2/149‑3 (MQ=255) cGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgtg > 1:68095‑M2/1‑145 (MQ=255) cccGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgtgcgc < 7:219476‑M2/149‑7 (MQ=255) cgcgCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCTTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGt < 7:275597/148‑1 (MQ=255) cgcgCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTa < 1:153133/149‑1 (MQ=255) cGAGCGTTTCGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCgcgc > 3:379259/1‑148 (MQ=255) gCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACg < 1:11217/149‑1 (MQ=255) gTTACGGCCACTACTCCGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACgtg < 7:300807/149‑1 (MQ=255) ggCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGcc < 4:148143/149‑1 (MQ=255) actaatCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAg > 5:134740/1‑149 (MQ=255) ctactCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGt < 7:154547/149‑1 (MQ=255) ctCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGa < 6:401491/144‑1 (MQ=255) ctCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGa > 5:401491/1‑144 (MQ=255) gTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑At > 4:385873/1‑149 (MQ=255) gTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑At > 4:392056/1‑149 (MQ=255) cGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGt > 2:115826/1‑149 (MQ=255) ggTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTc < 8:345496/149‑1 (MQ=255) tGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTACGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTcc > 1:166838/1‑148 (MQ=255) aaGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTAcc < 6:66560/149‑1 (MQ=255) cGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGt > 4:94367/1‑149 (MQ=255) accaccCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGtt < 7:25084/149‑1 (MQ=255) accCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGCGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGcc > 5:176855/1‑149 (MQ=255) ttCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGcc < 4:20046/149‑1 (MQ=255) tgGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGa < 6:145244/149‑1 (MQ=255) ggggCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGc < 6:133592/141‑1 (MQ=255) ggggCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGc > 5:133592/1‑141 (MQ=255) gggCTCCAAGCGCACTGGGCCGTACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGac < 3:79944/148‑1 (MQ=255) gCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCgg < 4:394298/141‑1 (MQ=255) gCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCgg > 3:394298/1‑141 (MQ=255) cTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGc < 1:223350/125‑1 (MQ=255) cTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGc > 2:223350/1‑125 (MQ=255) cTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGacaaca < 5:149900/149‑1 (MQ=255) tCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTAACCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAg > 4:251481/1‑149 (MQ=255) cAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgtgcgcttggagccccacaggaacgggtggtcccacacgctttcaccggccaccgagtagtggccgtaacgctcggtttcggcgcggaac < 2:106663‑M2/149‑91 (MQ=255) cAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGc < 8:155791/148‑1 (MQ=255) aaGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgtgcgcttggagccccacaggaacgggtggtcccacacgctttcaccggccaccgagtagtggccgtaacgctcggtttcggcgcggaacg < 1:160997‑M2/149‑92 (MQ=255) aaGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTgg > 4:118267/1‑124 (MQ=255) aaGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTgg < 3:118267/124‑1 (MQ=255) gcgcACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGt > 3:246100/1‑116 (MQ=255) gcgcACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGt < 4:246100/116‑1 (MQ=255) cgcACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCacac < 5:166843/149‑1 (MQ=255) gcACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACAcc > 2:280499/1‑149 (MQ=255) aCTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACACCCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGc < 8:51079/141‑1 (MQ=255) aCTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACACCCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGc > 7:51079/1‑141 (MQ=255) cGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAg < 8:219476/149‑1 (MQ=255) ggACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTc > 1:40404/1‑145 (MQ=255) ggACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTc > 6:8177/1‑145 (MQ=255) gACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAGCCATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAg < 1:115826/149‑1 (MQ=255) cTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGAtgcg > 8:89056/1‑149 (MQ=255) gCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCgtgcgcttggagccccacaggaacgggtggtcccacacgctttcaccggccaccgagtagtggccgtaacgctcggtttcggcgcggaacgggcggatcatctgcgagtga > 1:106663‑M2/1‑37 (MQ=255) cccGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGAtgcgcacc < 7:280478/149‑1 (MQ=255) ccGAGTCGGTGGACGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGAtgcgcaccc < 6:134740/149‑1 (MQ=255) ggCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATgcgcaccctgcgcaccct > 8:175118/1‑149 (MQ=255) cTCGGACGACTGGCACCGTACGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGt < 2:166838/147‑1 (MQ=255) ggACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCg > 5:81273/1‑148 (MQ=255) ggACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCg < 4:379259/148‑1 (MQ=255) cgacTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTaca < 3:251481/149‑1 (MQ=255) gacTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTacac > 6:408517/1‑149 (MQ=255) tGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTACACcga > 3:202788/1‑149 (MQ=255) tGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTACACcga > 8:82840/1‑149 (MQ=255) gCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACGGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTACACcgac < 5:43480/148‑1 (MQ=255) gCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTgg < 5:237071/131‑1 (MQ=255) gCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTACACcga < 2:40404/147‑1 (MQ=255) gCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCAACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTgg > 6:237071/1‑131 (MQ=255) gCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGAGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTACACcgacg > 1:48744/1‑149 (MQ=255) cACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCAGACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTACACcgacga > 8:227320/1‑149 (MQ=255) cACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTACACcgacga < 5:8177/149‑1 (MQ=255) | GATCCGCCCGTTCCGCGCCGAAACCGAGCGTTACGGCCACTACTCGGTGGCCGGTGAAAGCGTGTGGGACCACCCGTTCCTGTGGGGCTCCAAGCGCACTGGGCCGGACCTGGCCCGAGTCGGTGGCCGCTACTCGGACGACTGGCACCGTGCGCACCTGTACAACCCGCGCAACGTGGTGCCGGAGTCGAAG‑‑ATGCCGTCCTACCCGTGGCTGGTTGCCCAGCCGGTCGACAACAGCCACACCGACGTCAAGATGCGCACCCTGCGCACCCTGGGCGTGCCGTACACCGACGA > NC_002947/4837644‑4837937 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |