New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4979191 = | 57 (0.880) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.2% | coding (231/786 nt) | flgG | flagellar basal‑body rod protein FlgG |
? | NC_002947 | 4979266 = | 56 (0.920) | coding (156/786 nt) | flgG | flagellar basal‑body rod protein FlgG |
GCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGAC > NC_002947/4979044‑4979337 | gCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTgg < 1:369170/148‑1 (MQ=255) gCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTgg < 3:346821/148‑1 (MQ=255) ctctttgggtcgctaaaaccggcctgtccgctcaggacaccaacctgacggtcatttccaacaacctggccaacgtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGt > 1:163174‑M1/147‑149 (MQ=255) ccGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGt < 2:19997/149‑1 (MQ=255) cGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTg > 4:198421/1‑149 (MQ=255) tttgggtcgctaaaaccggcctgtccgctcaggacaccaacctgacggtcatttccaacaacctggccaacgtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGcc < 3:389816‑M1/6‑1 (MQ=255) gTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGa < 3:297921/149‑1 (MQ=255) ggTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACg > 6:407762/1‑148 (MQ=255) tGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGca > 3:170672/1‑148 (MQ=255) ccGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTAcc > 5:188775/1‑149 (MQ=255) ccGTCACGGGTATACGACACGGTGCCATCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTAc < 6:403871/148‑1 (MQ=255) cGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCGACGATACGCACACCGGTAcc > 5:34006/1‑148 (MQ=255) aCGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCt < 3:198421/149‑1 (MQ=255) gggTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTg > 8:10728/1‑148 (MQ=255) ataCGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGc > 4:167792/1‑149 (MQ=255) gACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGccc > 5:332574/1‑147 (MQ=255) acacGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAg < 6:348112/149‑1 (MQ=255) acGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAggg > 3:390849/1‑149 (MQ=255) tGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGc > 4:29694/1‑149 (MQ=255) cGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAg > 4:283373/1‑133 (MQ=255) cGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAg < 3:283373/133‑1 (MQ=255) gTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCCAGGACAGcgagc > 6:413927/1‑145 (MQ=255) tGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTgg < 5:150638/90‑1 (MQ=255) tGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTgg > 6:150638/1‑90 (MQ=255) cAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGa > 3:402422/1‑129 (MQ=255) cAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGa < 4:402422/129‑1 (MQ=255) cAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTgg < 5:407762/148‑1 (MQ=255) gATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTc > 2:12027/1‑148 (MQ=255) gaagaaACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGGTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCGCACGATACGCACAGCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTggg < 5:114908/149‑1 (MQ=255) gaagaaACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTggg > 4:145635/1‑149 (MQ=255) gaagaaACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTg < 6:188775/147‑1 (MQ=255) gaaACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCAc < 3:167792/149‑1 (MQ=255) gtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAg > 4:2596‑M1/73‑149 (MQ=255) aCCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAg < 7:186916/149‑1 (MQ=255) aCCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAg > 8:186916/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAgg < 3:91786/149‑1 (MQ=255) cgcgGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCACGc > 6:337744/1‑149 (MQ=255) tcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCt < 3:271759‑M1/80‑1 (MQ=255) gaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTg > 4:271759‑M1/68‑148 (MQ=255) cGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCg < 1:392099/116‑1 (MQ=255) cGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCg > 2:392099/1‑116 (MQ=255) gACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTg < 4:170672/148‑1 (MQ=255) cTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATc < 4:390849/149‑1 (MQ=255) cTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATc < 3:384398/149‑1 (MQ=255) cTGCCAGGTCCAGCGGGTTGGCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACTAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATc < 8:62153/149‑1 (MQ=255) aTGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACGGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTa < 7:10728/149‑1 (MQ=255) gggTGGTCGGTGTGTTGCAGGCTGCCGGCAAGGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATCCGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTc < 6:332574/149‑1 (MQ=255) ggTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCt > 4:21910/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGaa > 2:339957/1‑149 (MQ=255) cGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGACCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGATGGCGCATGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGaa > 3:61476/1‑148 (MQ=255) tggtTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCg > 5:47800/1‑149 (MQ=255) ggtTTGCAGGCTGCCGGCAACGGAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGa > 7:257166/1‑143 (MQ=255) ggtTTGCAGGCTGCCGGAAACGATGCTTTTCTTGGTGCCCACTATACTCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCTAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGa < 8:257166/143‑1 (MQ=255) tttGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGGGCTGGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGgcg > 3:247818/1‑149 (MQ=255) tttGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGgcg < 1:12027/149‑1 (MQ=255) tGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGgcgc < 1:339957/148‑1 (MQ=255) aGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGAt > 6:182030/1‑148 (MQ=255) tGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAg < 7:375740/124‑1 (MQ=255) tGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAg > 8:375740/1‑124 (MQ=255) cGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCtt > 2:245785/1‑148 (MQ=255) cGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCg < 3:21910/149‑1 (MQ=255) gAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCgg > 6:318624/1‑149 (MQ=255) gAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCgg > 7:247587/1‑149 (MQ=255) gAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCgg > 4:388877/1‑149 (MQ=255) gAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGCACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGACgg > 7:297731/1‑149 (MQ=255) gAAGATTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCgg > 3:71320/1‑149 (MQ=255) gCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCt < 3:24081/68‑1 (MQ=255) gCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCt > 4:24081/1‑68 (MQ=255) ttCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCCTGAAGCCGGTGGTc < 3:29694/147‑1 (MQ=255) tCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCga < 5:318624/148‑1 (MQ=255) tGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATGTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGAc > 4:213514/1‑149 (MQ=255) | GCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGAC > NC_002947/4979044‑4979337 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |