| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4979191 = | 57 (0.880) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.2% | coding (231/786 nt) | flgG | flagellar basal‑body rod protein FlgG |
| ? | NC_002947 | 4979266 = | 56 (0.920) | coding (156/786 nt) | flgG | flagellar basal‑body rod protein FlgG | |||||
ACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAGCGGACAGGCCGGTTTTAGCGACCCAAAGAG > NC_002947/4979119‑4979411 | gtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAg > 4:2596‑M1/73‑149 (MQ=255)aCCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAg > 8:186916/1‑149 (MQ=255)aCCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAg < 7:186916/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAgg < 3:91786/149‑1 (MQ=255) cgcgGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCACGc > 6:337744/1‑149 (MQ=255) tcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCt < 3:271759‑M1/80‑1 (MQ=255) gaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTg > 4:271759‑M1/68‑148 (MQ=255) gACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTg < 4:170672/148‑1 (MQ=255) cTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATc < 4:390849/149‑1 (MQ=255) cTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATc < 3:384398/149‑1 (MQ=255) cTGCCAGGTCCAGCGGGTTGGCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACTAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATc < 8:62153/149‑1 (MQ=255) aTGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACGGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTa < 7:10728/149‑1 (MQ=255) gggTGGTCGGTGTGTTGCAGGCTGCCGGCAAGGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATCCGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTc < 6:332574/149‑1 (MQ=255) ggTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCt > 4:21910/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGaa > 2:339957/1‑149 (MQ=255) cGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGACCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGATGGCGCATGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGaa > 3:61476/1‑148 (MQ=255) tggtTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCg > 5:47800/1‑149 (MQ=255) ggtTTGCAGGCTGCCGGCAACGGAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGa > 7:257166/1‑143 (MQ=255) ggtTTGCAGGCTGCCGGAAACGATGCTTTTCTTGGTGCCCACTATACTCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCTAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGa < 8:257166/143‑1 (MQ=255) tttGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGGGCTGGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGgcg > 3:247818/1‑149 (MQ=255) tttGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGgcg < 1:12027/149‑1 (MQ=255) tGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGgcgc < 1:339957/148‑1 (MQ=255) aGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGAt > 6:182030/1‑148 (MQ=255) tGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAg < 7:375740/124‑1 (MQ=255) tGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAg > 8:375740/1‑124 (MQ=255) cGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCtt > 2:245785/1‑148 (MQ=255) cGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCg < 3:21910/149‑1 (MQ=255) gAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCgg > 7:247587/1‑149 (MQ=255) gAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCgg > 6:318624/1‑149 (MQ=255) gAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCgg > 4:388877/1‑149 (MQ=255) gAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGCACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGACgg > 7:297731/1‑149 (MQ=255) gAAGATTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCgg > 3:71320/1‑149 (MQ=255) cagcctggtgcccagtcgacccaggacagcgagctgccctcgggcctgcaggtcggtaccggtgtgcgtatcgtgggcaccAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTc > 4:271759‑M2/82‑148 (MQ=255) ttCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCCTGAAGCCGGTGGTc < 3:29694/147‑1 (MQ=255) agcctggtgcccagtcgacccaggacagcgagctgccctcgggcctgcaggtcggtaccggtgtgcgtatcgtgggcaccAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCga < 3:271759‑M2/69‑1 (MQ=255) tCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCga < 5:318624/148‑1 (MQ=255) tGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATGTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGAc > 4:213514/1‑149 (MQ=255) ctggtgcccagtcgacccaggacagcgagctgccctcgggcctgcaggtcggtaccggtgtgcgtatcgtgggcaccAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGAc > 4:2596‑M2/78‑149 (MQ=255) CCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCgaga > 6:234544‑M1/1‑141 (MQ=255) CCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCgaga < 5:234544‑M1/141‑1 (MQ=255) CCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGc < 4:389816‑M1/148‑1 (MQ=255) CACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTagag < 8:313198‑M1/93‑1 (MQ=255) CACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTagag > 7:313198‑M1/1‑93 (MQ=255) ACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAg < 3:153812‑M1/149‑1 (MQ=255) aTACGCTCACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTGCTGGTGCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGgtt < 5:337744/149‑1 (MQ=255) gCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGttgttg < 5:182030/149‑1 (MQ=255) acCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGTAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGaaa > 1:197689/1‑149 (MQ=255) cgctACCGACCTCCAGGCCCGACGGCAGATCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGAACCAGGCTCGCGCTTGATCTGGTAGAGCATGTCTTCGAAAACGGCACGATCACGCTTGAAGCAGGAGGTCGACACGTAGTCCAGGTTGTTGGAAAt > 4:360961/4‑148 (MQ=255) tACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCCGTCGACGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGAcc > 6:189048/1‑149 (MQ=255) cGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTc < 8:247587/149‑1 (MQ=255) gACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCGTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCa < 6:34006/149‑1 (MQ=255) gACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCggtgg < 2:197347/113‑1 (MQ=255) gACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCggtgg > 1:197347/1‑113 (MQ=255) aCCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAgg < 4:76535/129‑1 (MQ=255) aCCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAgg > 3:76535/1‑129 (MQ=255) aCCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGAAGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAg > 8:173883/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGt > 5:338399/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGGCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGt > 7:148109/1‑149 (MQ=255) tGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAgggt > 5:358141/1‑147 (MQ=255) ggCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACAAGGCTGGCGCTTTCTCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTc < 1:310403/107‑1 (MQ=255) ccGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCGGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGgttgtt < 3:166190/124‑1 (MQ=255) ccGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCAGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGgttgtt > 4:166190/1‑124 (MQ=255) gggCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCgaga < 3:312927/104‑1 (MQ=255) gggCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCgaga > 4:312927/1‑104 (MQ=255) gggCAGATCGCTGTCCTGGTTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTGGGCGCGATCAGTCTTGATGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAg < 5:189048/149‑1 (MQ=255) ggCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAGc < 1:245785/149‑1 (MQ=255) gCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAGCg < 3:360961/149‑1 (MQ=255) gCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAGCGGAc < 4:71320/149‑1 (MQ=255) tCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGgt < 7:35826/134‑1 (MQ=255) tCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGgt > 8:35826/1‑134 (MQ=255) cTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAGCGGACAGGcc < 6:338399/149‑1 (MQ=255) tGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGTAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAGCGGACAGGCCg < 2:197689/149‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAGCGGACAGGCCGGTTTTAGCg < 4:153812/149‑1 (MQ=255) ggcaccAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAGCGGACAGGCCGGTTTTAGCGACCCaaa < 3:389816‑M2/143‑1 (MQ=255) accAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAGCGGACAGGCCGGTTTTAGCGACCCAAagag > 1:163174‑M2/4‑149 (MQ=255) | ACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGACGTTGGCCAGGTTGTTGGAAATGACCGTCAGGTTGGTGTCCTGAGCGGACAGGCCGGTTTTAGCGACCCAAAGAG > NC_002947/4979119‑4979411 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |