New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5083008 | 64 (0.980) | 4 (0.060) | 4/252 | NT | 6.6% | coding (1258/2625 nt) | alaS | alanine‑‑tRNA ligase |
? | NC_002947 | = 5083059 | 53 (0.850) | coding (1207/2625 nt) | alaS | alanine‑‑tRNA ligase |
TCTTGCCCTGGCCCTCGGTGGCGTCGTAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTG > NC_002947/5082864‑5083155 | tCTTGCCCTGGCCCTCGGTGGCGTCGTAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTtcgtc > 4:26458/1‑148 (MQ=255) gCCCTGGCCCTCGGTGGCGTCGTAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTtcgagc < 1:168849/145‑4 (MQ=255) gCCCTGGCCCTCGGTGGCGTCGTAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATg < 5:342781/148‑1 (MQ=255) gCCCTGGCCCTCGGTGGCGTCGTAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATg < 6:15437/148‑1 (MQ=255) ccTGGCCCTCGGTGGCGTCGTAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCccgatggacc > 7:101858‑M1/1‑139 (MQ=255) ccTGGCCCTCGGTGGCGTCGTAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGt > 8:138634/1‑148 (MQ=255) cTGGCCCTCGGTGGCGTCGTAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGt > 6:172539/1‑147 (MQ=255) ccTCGGTTACGACGCCACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAgctca > 6:278227/1‑149 (MQ=255) cTCGGTGGCGTCGTAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAgctcac < 2:5902/149‑1 (MQ=255) gtAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCg < 6:404330/148‑1 (MQ=255) aaCCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATg > 8:330223/1‑149 (MQ=255) aCCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATg < 3:149232/148‑1 (MQ=255) ccGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTc < 7:330223/149‑1 (MQ=255) cGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCg < 7:5910/149‑1 (MQ=255) cGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCg > 8:5910/1‑149 (MQ=255) cGAGGAACTCGGTGGCGCTGGCGACCTTGACCTGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGGGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCg < 7:369790/149‑1 (MQ=255) gAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCgg < 3:26458/149‑1 (MQ=255) ggAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCa < 5:205197/149‑1 (MQ=255) aCTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTc < 5:278227/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGt < 2:369041/149‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCccgatggacctgactgccgacatcgctcgtgagcgtgagctgac > 8:385425‑M1/1‑104 (MQ=255) gTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTc > 5:358866/1‑149 (MQ=255) cgcTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAg > 8:20241/1‑126 (MQ=255) cgcTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAg < 7:20241/126‑1 (MQ=255) gcTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCg < 1:114690/149‑1 (MQ=255) tGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCgg > 2:147072/1‑148 (MQ=255) tGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGg > 7:26330‑M2/1‑148 (MQ=255) tGTCGACCTTGACAAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCAATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCgg > 1:258592/1‑148 (MQ=255) tCGAGCTTGACCAGGATTTGGTCCTCCATTCCGACGGCGCTGGCGGCGCGGGCGCGCTGACGCTGGGCGTCCATTTCCCGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATCGTCAGCGCTC‑TCTCACGTGCGATGTCGGCAGGGAGGTCCATCTGGac < 4:276581/149‑2 (MQ=255) gACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCg > 6:177066/1‑143 (MQ=255) gACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCg < 5:177066/143‑1 (MQ=255) gACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGgaag > 5:172539‑M2/1‑144 (MQ=255) aCCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCccgatggacctgactgccgacatcgctcgtgagcgtgagctgaccatcgacgaagcc < 8:101858‑M1/149‑58 (MQ=255) cTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCccgatggacctgactgccgacatcgctcgtgagcgtgagctgaccatcgacgaagccg < 7:385425‑M1/148‑59 (MQ=255) cTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCAt < 2:309495/149‑1 (MQ=255) gACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAg < 6:372776/148‑1 (MQ=255) gACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAg < 7:138634/148‑1 (MQ=255) ggCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATa > 2:396290/1‑142 (MQ=255) ggCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATa < 1:396290/142‑1 (MQ=255) ttgtAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAg < 7:112857/149‑1 (MQ=255) tCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGaa > 3:205818/1‑149 (MQ=255) aTGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGTGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAacac > 2:45246/1‑149 (MQ=255) ccGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAAcaccac > 6:48726/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACg > 2:138868/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCgg < 1:138868/149‑1 (MQ=255) tGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCgg > 3:177633/1‑148 (MQ=255) gCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTa < 1:18027/148‑1 (MQ=255) aGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACg > 5:4851/1‑149 (MQ=255) aGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTAACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTAAGCTCAC‑GCTAACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGAGTCGTAGACGTTGAACACAACGGCGCCCGGAACCAct > 4:24428/1‑148 (MQ=255) cgcgcTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCt < 5:48726/149‑1 (MQ=255) gcTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCttt > 7:281380/1‑148 (MQ=255) cTCACGCTGGGGGTTCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGGCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCATGGCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCa < 2:258592/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTCCAGCTgg > 5:19973/1‑149 (MQ=255) tGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCttt > 3:350122/1‑140 (MQ=255) tGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCttt < 4:350122/140‑1 (MQ=255) tGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGc < 4:177633/149‑1 (MQ=255) tGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGc > 6:65664/1‑149 (MQ=255) gTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCACGGCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAgg > 1:288577/1‑149 (MQ=255) cATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCtt > 5:384165/1‑149 (MQ=255) aTTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTg > 5:306118/1‑149 (MQ=255) aTTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTg > 1:253086/1‑149 (MQ=255) tttCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTCCAGCTGGGCCAGGTCTTGc < 6:19973/149‑1 (MQ=255) cACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTc > 5:121439/1‑148 (MQ=255) cACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTc > 8:189423/1‑148 (MQ=255) aCGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACGACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGa < 7:189423/149‑1 (MQ=255) aCGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGa < 4:205818/149‑1 (MQ=255) cGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAg < 2:288577/149‑1 (MQ=255) tCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGGCAGGTCCATCGGGAATCCATAGGTGTCGTACAGCTTGACCACAACGTCGCCCGGTACCACGTAGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGAt > 3:239231/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATg < 6:306118/148‑1 (MQ=255) gAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATg < 2:253086/148‑1 (MQ=255) cGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGgaagccggcttcgagcgtgaaatggacgcccagcgtgagcgcgcccgctccgccagcgccttcggcatggattacaacagcctggtcaag < 7:385425‑M2/148‑91 (MQ=255) cGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTc < 3:373930/109‑1 (MQ=255) cGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTc > 4:373930/1‑109 (MQ=255) ggCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGgaagccggcttcgagcgtgaaatggacgcccagcgtgagcgcgcccgctccgccagcgccttcggcatggattacaacagcctggtcaaggt < 8:101858‑M2/149‑93 (MQ=255) cTTCccgatggacctgactgccgacatcgctcgtgagcgtgagctgaccatcgacgaagccggcttcgagcgtgaaatggacgcccagcgtgagcgcgcccgctccgccagcgccttcggcatggattacaacagcctggtcaaggtc > 5:172539‑M1/1‑4 (MQ=255) cccgatggacctgactgccgacatcgctcgtgagcgtgagctgaccatcgacgaagccggcttcgagcgtgaaatggacgcccagcgtgagcgcgcccgctccgccagcgccttcggcatggattacaacagcctggtcaaggtcgaca > 7:26330‑M1/1‑1 (MQ=255) | TCTTGCCCTGGCCCTCGGTGGCGTCGTAACCGAGGAACTCGGTGGCGCTGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTG > NC_002947/5082864‑5083155 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |