New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5083008 | 64 (0.980) | 4 (0.060) | 4/252 | NT | 6.6% | coding (1258/2625 nt) | alaS | alanine‑‑tRNA ligase |
? | NC_002947 | = 5083059 | 53 (0.850) | coding (1207/2625 nt) | alaS | alanine‑‑tRNA ligase |
TGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCTTGAGCACGCGC > NC_002947/5082912‑5083201 | tGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCgg > 2:147072/1‑148 (MQ=255) tGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGg > 7:26330‑M2/1‑148 (MQ=255) tGTCGACCTTGACAAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCAATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCgg > 1:258592/1‑148 (MQ=255) tCGAGCTTGACCAGGATTTGGTCCTCCATTCCGACGGCGCTGGCGGCGCGGGCGCGCTGACGCTGGGCGTCCATTTCCCGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATCGTCAGCGCTC‑TCTCACGTGCGATGTCGGCAGGGAGGTCCATCTGGac < 4:276581/149‑2 (MQ=255) gACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGgaag > 5:172539‑M2/1‑144 (MQ=255) cTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCAt < 2:309495/149‑1 (MQ=255) gACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAg < 6:372776/148‑1 (MQ=255) gACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAg < 7:138634/148‑1 (MQ=255) ggCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATa > 2:396290/1‑142 (MQ=255) ggCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATa < 1:396290/142‑1 (MQ=255) ttgtAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAg < 7:112857/149‑1 (MQ=255) tCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGaa > 3:205818/1‑149 (MQ=255) aTGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGTGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAacac > 2:45246/1‑149 (MQ=255) ccGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAAcaccac > 6:48726/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACg > 2:138868/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCgg < 1:138868/149‑1 (MQ=255) tGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCgg > 3:177633/1‑148 (MQ=255) gCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTa < 1:18027/148‑1 (MQ=255) aGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACg > 5:4851/1‑149 (MQ=255) aGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTAACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTAAGCTCAC‑GCTAACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGAGTCGTAGACGTTGAACACAACGGCGCCCGGAACCAct > 4:24428/1‑148 (MQ=255) cgcgcTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCt < 5:48726/149‑1 (MQ=255) gcTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCttt > 7:281380/1‑148 (MQ=255) cTCACGCTGGGGGTTCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGGCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCATGGCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCa < 2:258592/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTCCAGCTgg > 5:19973/1‑149 (MQ=255) tGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCttt < 4:350122/140‑1 (MQ=255) tGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCttt > 3:350122/1‑140 (MQ=255) tGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGc < 4:177633/149‑1 (MQ=255) tGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGc > 6:65664/1‑149 (MQ=255) gTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCACGGCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAgg > 1:288577/1‑149 (MQ=255) cATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCtt > 5:384165/1‑149 (MQ=255) aTTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTg > 1:253086/1‑149 (MQ=255) aTTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTg > 5:306118/1‑149 (MQ=255) tttCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTCCAGCTGGGCCAGGTCTTGc < 6:19973/149‑1 (MQ=255) cACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTc > 5:121439/1‑148 (MQ=255) cACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTc > 8:189423/1‑148 (MQ=255) aCGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACGACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGa < 7:189423/149‑1 (MQ=255) aCGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGa < 4:205818/149‑1 (MQ=255) cGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAg < 2:288577/149‑1 (MQ=255) tCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGGCAGGTCCATCGGGAATCCATAGGTGTCGTACAGCTTGACCACAACGTCGCCCGGTACCACGTAGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGAt > 3:239231/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATg < 2:253086/148‑1 (MQ=255) gAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATg < 6:306118/148‑1 (MQ=255) cGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGgaagccggcttcgagcgtgaaatggacgcccagcgtgagcgcgcccgctccgccagcgccttcggcatggattacaacagcctggtcaag < 7:385425‑M2/148‑91 (MQ=255) cGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTc > 4:373930/1‑109 (MQ=255) cGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTc < 3:373930/109‑1 (MQ=255) ggCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGgaagccggcttcgagcgtgaaatggacgcccagcgtgagcgcgcccgctccgccagcgccttcggcatggattacaacagcctggtcaaggt < 8:101858‑M2/149‑93 (MQ=255) tcgATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTc > 5:166048/1‑149 (MQ=255) gTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGgaagccggcttcgagcgtgaaatggacgcccagcgtgagcgcgcccgctccgccagcgccttcggcatggattacaacagcctggtcaaggtcgacagcgccac > 8:385425‑M2/1‑44 (MQ=255) gTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAggg < 6:4851/148‑1 (MQ=255) ctcac‑gctcacgAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTgg > 6:134157/1‑149 (MQ=255) ac‑gctcacgAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCg > 5:163113/1‑148 (MQ=255) gctcacgAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAAc > 6:138283/1‑149 (MQ=255) tcacgAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGa > 8:214470/1‑112 (MQ=255) tcacgAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGa < 7:214470/112‑1 (MQ=255) cacgAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGc > 1:64909/1‑149 (MQ=255) cgAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGctc < 6:163113/149‑1 (MQ=255) gATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACAACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTcttctt > 2:148762/1‑149 (MQ=255) tGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCg < 5:138283/149‑1 (MQ=255) cAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCtt > 6:96088/1‑148 (MQ=255) aGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCTTGa < 6:166048/149‑1 (MQ=255) aGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCTTGa < 5:134157/149‑1 (MQ=255) aGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCTTGa < 3:24428/149‑1 (MQ=255) tCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACAACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCTTGAg > 1:123517/1‑148 (MQ=255) ggTCCATCGGgaagccggcttcgagcgtgaaatggacgcccagcgtgagcgcgcccgctccgccagcgccttcggcatggattacaacagcctggtcaaggtcgacagcgccaccgagttcctcggttacgacgccaccgagggccagg > 7:101858‑M2/1‑10 (MQ=255) ggTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCTTGAGCAcg < 6:358866/149‑1 (MQ=255) gTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCTTGAGCAcgc > 1:162780/1‑149 (MQ=255) ccATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCTTGAGCACgcgc > 2:392138/1‑149 (MQ=255) cATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCTTGAGCACgcgc < 5:65664/148‑1 (MQ=255) | TGTCGACCTTGACCAGGCTGTTGTAATCCATGCCGAAGGCGCTGGCGGAGCGGGCGCGCTCACGCTGGGCGTCCATTTCACGCTCGAAGCCGGCTTCGTCGATGGTCAGCTCAC‑GCTCACGAGCGATGTCGGCAGTCAGGTCCATCGGGAAGCCATAGGTGTCGTACAGCTTGAACACCACGTCGCCCGGTACCACGTCGCCTTTCAGCTGGGCCAGGTCTTGCTCGAGGATGCGCAGGCCCTGCTCCAGGGTCTTGGCGAACTGCTCTTCTTCGGCCTTGAGCACGCGC > NC_002947/5082912‑5083201 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |