| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5441588 = | 74 (1.140) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 5.0% | coding (996/1653 nt) | PP_4780 | acyl‑CoA dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 5441618 = | 79 (1.240) | coding (966/1653 nt) | PP_4780 | acyl‑CoA dehydrogenase | |||||
CAGCCGGGCAAAATGCGCCTGTTGCGGGTC‑GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCA > NC_002947/5441441‑5441734 | cAGCCGGGCAAAATGCGCCTGTTGCGGGTC‑GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACccgcccgc > 5:411701/1‑149 (MQ=255) agcgaggtggagttccgcggtgcgctggcgtggatgatcggcgaagagggacgcggcgtgccgaccatcatcgagatggtcgccatgacccggttcgactgcatggtcggctccagcgcactgatgcgccaggcgttgacgcaggcggc > 3:136688‑M1/148‑149 (MQ=255) gCCGGGCAAAATGCGCCTGTTGCGGGTCGGTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGAACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCcgcccgcc > 1:230543/1‑149 (MQ=255) ggCAAAATGCGCCTGTTGCGGGTC‑GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑t > 3:94665/1‑149 (MQ=255) cAAAATGCGCCTGTTGCGGGTC‑GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTg < 1:50852/149‑1 (MQ=255) cgcCTGTTGCGGGTC‑GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCTTCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCGGCCGACC‑TTGCGATgc < 5:97301/148‑1 (MQ=255) gcCTGTTGCGGGTC‑GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCAcccgcccg > 4:77314/1‑132 (MQ=255) gcCTGTTGCGGGTC‑GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCAcccgcccg < 3:77314/132‑1 (MQ=255) gggTC‑GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAAtggtg < 1:212468/149‑1 (MQ=255) ggTC‑GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAAtggtgg < 8:293240/149‑1 (MQ=255) gtc‑gtcCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTggg < 5:18409/149‑1 (MQ=255) tc‑gtcCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGgc > 7:66780/1‑149 (MQ=255) gcgtggatgatcggcgaagagggacgcggcgtgccgaccatcatcgagatggtcgccatgacccggttcgactgcatggtcggctccagcgcactgatgcgccaggcgttgacgcaggcgGCCCACCATTGCGATGCGCGCAAtggtg > 3:283813‑M1/121‑148 (MQ=255) gtcCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGgccg > 5:184735/1‑149 (MQ=255) tcCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGgccgc > 8:173036/1‑149 (MQ=255) gTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGc < 5:108095/149‑1 (MQ=255) tcggcgaagagggacgcggcgtgccgaccatcatcgagatggtcgccatgacccggttcgactgcatggtcggctccagcgcactgatgcgccaggcgttgacgcaggcgGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGt > 3:69804‑M1/111‑149 (MQ=255) gCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGt > 6:251220/1‑148 (MQ=255) tCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCaa > 1:235696/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCaa > 1:52021/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAAc > 7:327232/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCaa < 5:221034/147‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGc < 7:173036/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGCCaggcg > 8:175424/1‑145 (MQ=255) gcgcCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGcc > 8:63234/1‑149 (MQ=255) cgcCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCt < 8:56975/149‑1 (MQ=255) ggacgcggcgtgccgaccatcatcgagatggtcgccatgacccggttcgactacatggtcggctccagcgcactgatgcgccaggcgttgacgcaggcgGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTg > 3:369831‑M1/100‑135 (MQ=255) ggacgcggcgtgccgaccatcatcgagatggtcgccatgacccggttcgactacatggtcggctccagcgcactgatgcgccaggcgttgacgcaggcgGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTg < 4:369831‑M1/36‑1 (MQ=255) ggCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGgcgc < 8:327232/149‑1 (MQ=255) gCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGgcgc < 8:301476/148‑1 (MQ=255) ccATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACTCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAAtggtgg > 7:35021/1‑122 (MQ=255) ccATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACTCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAAtggtgg < 8:35021/122‑1 (MQ=255) cATGCGCAAGCTCATGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGGCGGCCAGCCCGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCa < 4:205168/149‑1 (MQ=255) gCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTg > 3:39611/1‑148 (MQ=255) cTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGa < 4:94665/149‑1 (MQ=255) atCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCGCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGa < 7:222075/148‑1 (MQ=255) tCAGGGCGAGTGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAg > 2:155108/1‑149 (MQ=255) aGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAg < 4:39611/147‑1 (MQ=255) aGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGcc > 7:242013/1‑149 (MQ=255) ggCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGAGC‑TTGCGTTGCGCGCAATGGTGGGCCGCGTGCGTCATCGCCTGGCGCTCCAGCGCA‑CTgatgcgcc < 6:334001/149‑8 (MQ=255) cGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGAcc < 5:83173/149‑1 (MQ=255) gAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCa < 6:184735/149‑1 (MQ=255) aGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCAt < 8:66780/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATg < 2:230543/149‑1 (MQ=255) tCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGaa > 7:338510/1‑149 (MQ=255) tCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGaa > 4:90124/1‑149 (MQ=255) tttCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAg > 7:22905/1‑140 (MQ=255) tttCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAg < 8:22905/140‑1 (MQ=255) tttCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCgg > 4:1477/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGt > 5:135163/1‑115 (MQ=255) cAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGt < 6:135163/115‑1 (MQ=255) ccAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCg < 3:144961/149‑1 (MQ=255) aGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGAc < 7:63234/149‑1 (MQ=255) cAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCga > 3:134924/1‑149 (MQ=255) cAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCga < 2:235696/149‑1 (MQ=255) aGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCgat < 5:251220/149‑1 (MQ=255) gCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCgg > 5:12066/1‑148 (MQ=255) cATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGaa < 8:260982/114‑1 (MQ=255) cATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGaa > 7:260982/1‑114 (MQ=255) cATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCa > 4:256384/1‑149 (MQ=255) cATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCa > 6:383989/1‑149 (MQ=255) aTCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCAt > 8:159864/1‑83 (MQ=255) aTCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCAt < 7:159864/83‑1 (MQ=255) tCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcg > 6:383367/1‑149 (MQ=255) cAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑Ct < 6:142648/90‑1 (MQ=255) cAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑Ct > 5:142648/1‑90 (MQ=255) cAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgc > 2:10413/1‑149 (MQ=255) aaTGGCTGCTTGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgcc > 3:211922/1‑149 (MQ=255) tGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgccgc > 3:390556/1‑149 (MQ=255) ctgctCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTc > 3:15534/1‑149 (MQ=255) tgctCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTcc > 7:359749/1‑149 (MQ=255) ctCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATgg < 6:90152/113‑1 (MQ=255) ctCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATgg > 5:90152/1‑113 (MQ=255) tCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCctc > 2:251519/1‑149 (MQ=255) ttCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCa < 8:105542/92‑1 (MQ=255) ttCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCa > 7:105542/1‑92 (MQ=255) ttCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTc < 6:12066/149‑1 (MQ=255) gCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCGGCGTCCATCTTCGcc > 8:58941/1‑148 (MQ=255) cACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGa < 2:140953/149‑1 (MQ=255) cccgcccgCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGatc < 4:15534/149‑1 (MQ=255) ccgcccgcCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCGTGAGGAGCCCACCAGGCAGGGGAACCGGGGCAGGGCGCCCAGGTGGATGATGGGCGGCACGCCGCGGCCAACTTGGCCGag > 1:330666/1‑147 (MQ=255) ccgcccgcCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgccgc < 2:363246/131‑1 (MQ=255) ccgcccgcCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgccgc > 1:363246/1‑131 (MQ=255) gcccgccGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGatcatc < 1:155108/149‑1 (MQ=255) ccgccgACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCa < 1:251519/149‑1 (MQ=255) GCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGt > 6:220915‑M1/1‑127 (MQ=255) GCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGt < 5:220915‑M1/127‑1 (MQ=255) | CAGCCGGGCAAAATGCGCCTGTTGCGGGTC‑GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACC‑TTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCA > NC_002947/5441441‑5441734 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |