| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5441588 = | 74 (1.140) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 5.0% | coding (996/1653 nt) | PP_4780 | acyl‑CoA dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 5441618 = | 79 (1.240) | coding (966/1653 nt) | PP_4780 | acyl‑CoA dehydrogenase | |||||
GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAGCGCACCGCGGAACTCCACCTCGCT > NC_002947/5441471‑5441764 | gtcCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGgccg > 5:184735/1‑149 (MQ=255) tcCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGgccgc > 8:173036/1‑149 (MQ=255) gTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGc < 5:108095/149‑1 (MQ=255) tcggcgaagagggacgcggcgtgccgaccatcatcgagatggtcgccatgacccggttcgactgcatggtcggctccagcgcactgatgcgccaggcgttgacgcaggcgGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGt > 3:69804‑M1/111‑149 (MQ=255) gCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGt > 6:251220/1‑148 (MQ=255) tCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCaa > 1:52021/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCaa > 1:235696/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAAc > 7:327232/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCaa < 5:221034/147‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGc < 7:173036/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGCCaggcg > 8:175424/1‑145 (MQ=255) gcgcCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGcc > 8:63234/1‑149 (MQ=255) cgcCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCt < 8:56975/149‑1 (MQ=255) ggacgcggcgtgccgaccatcatcgagatggtcgccatgacccggttcgactacatggtcggctccagcgcactgatgcgccaggcgttgacgcaggcgGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTg > 3:369831‑M1/100‑135 (MQ=255) ggacgcggcgtgccgaccatcatcgagatggtcgccatgacccggttcgactacatggtcggctccagcgcactgatgcgccaggcgttgacgcaggcgGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTg < 4:369831‑M1/36‑1 (MQ=255) ggCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGgcgc < 8:327232/149‑1 (MQ=255) gCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGgcgc < 8:301476/148‑1 (MQ=255) cATGCGCAAGCTCATGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGGCGGCCAGCCCGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCa < 4:205168/149‑1 (MQ=255) gCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTg > 3:39611/1‑148 (MQ=255) cTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGa < 4:94665/149‑1 (MQ=255) atCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCGCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGa < 7:222075/148‑1 (MQ=255) tCAGGGCGAGTGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAg > 2:155108/1‑149 (MQ=255) aGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAg < 4:39611/147‑1 (MQ=255) aGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGcc > 7:242013/1‑149 (MQ=255) ggCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGAGCTTGCGTTGCGCGCAATGGTGGGCCGCGTGCGTCATCGCCTGGCGCTCCAGCGCA‑CTgatgcgcc < 6:334001/149‑8 (MQ=255) cGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGAcc < 5:83173/149‑1 (MQ=255) gAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCa < 6:184735/149‑1 (MQ=255) aGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCAt < 8:66780/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATg < 2:230543/149‑1 (MQ=255) tCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGaa > 7:338510/1‑149 (MQ=255) tCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGaa > 4:90124/1‑149 (MQ=255) tttCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAg < 8:22905/140‑1 (MQ=255) tttCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAg > 7:22905/1‑140 (MQ=255) tttCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑gg > 4:1477/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGt < 6:135163/115‑1 (MQ=255) cAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGt > 5:135163/1‑115 (MQ=255) ccAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCg < 3:144961/149‑1 (MQ=255) aGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGAc < 7:63234/149‑1 (MQ=255) cAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCga < 2:235696/149‑1 (MQ=255) cAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCga > 3:134924/1‑149 (MQ=255) aGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCgat < 5:251220/149‑1 (MQ=255) gCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCgg > 5:12066/1‑148 (MQ=255) cATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGaa < 8:260982/114‑1 (MQ=255) cATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGaa > 7:260982/1‑114 (MQ=255) cATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCa > 4:256384/1‑149 (MQ=255) 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aaTGGCTGCTTGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgcc > 3:211922/1‑149 (MQ=255) tGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgccgc > 3:390556/1‑149 (MQ=255) ctgctCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTc > 3:15534/1‑149 (MQ=255) tgctCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTcc > 7:359749/1‑149 (MQ=255) ctCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATgg > 5:90152/1‑113 (MQ=255) ctCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATgg < 6:90152/113‑1 (MQ=255) tCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCctc > 2:251519/1‑149 (MQ=255) ttCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCa < 8:105542/92‑1 (MQ=255) ttCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCa > 7:105542/1‑92 (MQ=255) ttCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTc < 6:12066/149‑1 (MQ=255) gCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCGGCGTCCATCTTCGcc > 8:58941/1‑148 (MQ=255) cACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGa < 2:140953/149‑1 (MQ=255) acgcaggcggcccaccattgcgcgcatcgcaaggtcggcCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGa > 3:69804‑M2/40‑149 (MQ=255) cccgcccgCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGatc < 4:15534/149‑1 (MQ=255) ccgcccgcCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCGTGAGGAGCCCACCAGGCAGGGGAACC‑GGGGCAGGGCGCCCAGGTGGATGATGGGCGGCACGCCGCGGCCAACTTGGCCGag > 1:330666/1‑147 (MQ=255) ccgcccgcCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgccgc < 2:363246/131‑1 (MQ=255) ccgcccgcCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgccgc > 1:363246/1‑131 (MQ=255) caggcggcccaccattgcgcgcatcgcaaggtcggcCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGTAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTcc > 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caccattgcgcgcatcgcaatggtgggcCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGc > 3:283813‑M2/29‑148 (MQ=255) gACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGc > 1:300918/1‑147 (MQ=255) aCCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgc < 4:266645/118‑1 (MQ=255) aCCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCAcgc > 3:266645/1‑118 (MQ=255) aCCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAg > 1:192739/1‑149 (MQ=255) cTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCAc < 4:12157/142‑1 (MQ=255) cTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCAc > 3:12157/1‑142 (MQ=255) ttGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAgcg > 5:164424/1‑148 (MQ=255) aTGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAGCGCACcgt < 4:390556/149‑2 (MQ=255) aTGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAGCGCACcgc > 5:80721/1‑149 (MQ=255) cgcgcAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAGCGCACCGCGGa < 2:192739/149‑1 (MQ=255) gcgcAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAGCGCACCGCGGaa < 6:164424/149‑1 (MQ=255) gcgcAATGGAGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCAAGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAGCGCACCGCGGaa < 7:58941/149‑1 (MQ=255) gcAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGatcat < 5:142256/126‑1 (MQ=255) gcAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGatcat > 6:142256/1‑126 (MQ=255) tggGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACCAGGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAGCGCACCGCGGAACTCCACCt > 1:115491/1‑149 (MQ=255) gcCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAGCGCACCGCGGAACTCCACCTCGCt > 3:136688‑M2/3‑149 (MQ=255) | GTCCAGTTGCTCCAGCGCCTGGCCCATGCGCAAGCTCAGGGCGAGCGCAGCCTCGCTTTCCAGGGCCAGGTCGGCCAGCACGTTCTGCATCAATGGCTGCTCGTTCAGCACCCGCCCGCCGACCTTGCGATGCGCGCAATGGTGGGCCGCCTGCGTCAACGCCTGGCGCATCAGTGCG‑CTGGAGCCGACCATGCAGTCGAACC‑GGGTCATGGCGACCATCTCGATGATGGTCGGCACGCCGCGTCCCTCTTCGCCGATCATCCACGCCAGCGCACCGCGGAACTCCACCTCGCT > NC_002947/5441471‑5441764 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |