| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5442678 | 52 (0.800) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 5.2% | intergenic (‑95/+113) | PP_4780/PP_4781 | acyl‑CoA dehydrogenase/sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | = 5442726 | 60 (0.960) | intergenic (‑143/+65) | PP_4780/PP_4781 | acyl‑CoA dehydrogenase/sensor histidine kinase | |||||
TGGTTGGTGACTTCGTGGGTTTCAGCGTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTGCAGCATGTGCGGGCT > NC_002947/5442540‑5442826 | tggttggtGACTTCGTGGGTTTCAGCGTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTGCTCTTAGGGGGTTTAAAAAGGG‑‑TTATTAATGAATAAACTGTTGGTtggtgggttgg > 1:334572/1‑144 (MQ=255) gTTGGTGACTTCGTGGGTTTCAGCGTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTgcgcgc < 7:103605‑M2/148‑1 (MQ=255) gTTGGTCACTTCGTGGGTTTCAGCGTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTGGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GGAGTAATCACTAAACGTGTGGGTGCGGCCGTgcgagc > 8:299300‑M2/2‑149 (MQ=255) ggggccTTCGTGGGTTGCTGCGTACTGGTGCAGGCGCCTCGGGGGGGTCCGGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGATGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTa < 4:154882/144‑1 (MQ=255) cGTGGGTTTCAGCGTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCgg < 5:14963/148‑1 (MQ=255) cGTGGGTTTCAGCGTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCgg < 2:227386/148‑1 (MQ=255) gTGGGTTGCAGCGTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGt < 4:126524/149‑1 (MQ=255) gTTTCAGCGTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTAc > 4:373104/1‑149 (MQ=255) agggTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTTGGCTTGAGAGACCGAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTTGGCAATGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 7:179303/145‑1 (MQ=255) aGCGTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg < 1:400203/149‑1 (MQ=255) gTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTGCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAt < 5:220846/149‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCAAGTGAAGCACTG‑‑CTTGAGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGAGATTActg > 8:244172/1‑147 (MQ=255) gCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCGGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACggtggt < 3:183292/149‑1 (MQ=255) gCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACgg < 6:15468/141‑1 (MQ=255) gCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACgg > 5:15468/1‑141 (MQ=255) gacacgggggggCTCCTGGTTCCGGGTAGGCTTGACTGACCCCGTTAAGCCCTG‑‑GTTGGCGGGTTTTTAAATGGCCAAATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTggc < 1:125527/143‑1 (MQ=19) cTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGg > 8:36705‑M2/1‑148 (MQ=255) tCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGg < 6:406443‑M2/148‑2 (MQ=255) tCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGg < 8:51448‑M2/148‑2 (MQ=255) aTCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGgcaa < 4:362010‑M2/149‑5 (MQ=255) cGGGGGGGTGCTGGATCCGGGTACGCTTGAGTGACCCAGTGAAGCTCTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCcgccaccaccgtattcgcgggttaacccgctcctacgcgcgcacgccagcaac < 8:188790‑M1/148‑54 (MQ=255) gggggCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGt > 6:217030/1‑99 (MQ=255) gggggCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGt < 5:217030/99‑1 (MQ=255) ggggCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCaacggt > 2:206542/1‑148 (MQ=255) gCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACGCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCaacggtgaac < 7:299300/149‑1 (MQ=255) gCTCCGGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCcgccaccaccgtattcgcgggtaaacccgctcctacgcgcgcacgccagcaaccacacgt < 7:61787‑M1/149‑61 (MQ=255) tCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCaacggtgaacgg > 4:305872/1‑149 (MQ=255) gATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACggtgggt < 5:406443/149‑1 (MQ=255) gATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACggtgggt > 7:49339/1‑149 (MQ=255) gggTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGata < 7:51448/149‑1 (MQ=255) gTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATAtt > 3:158906/1‑149 (MQ=255) tAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTg < 8:49339/149‑1 (MQ=255) ttGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCcag > 7:113604/1‑149 (MQ=255) ttGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGGAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCcag > 5:313675/1‑149 (MQ=255) gagagaCCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCcgccaccaccgtattcgcgggtaaacccgctcctacgcgcgcacgccagcaaccacacgtttagtcattaataccccttt < 8:112667‑M1/147‑81 (MQ=255) agaCCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCcag < 3:130291/144‑1 (MQ=255) agaCCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCcag > 4:130291/1‑144 (MQ=255) gaCCCAGTGAAGGACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAATGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGAc < 6:313675/148‑1 (MQ=255) aCCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGCTGGATATTGGCCAGCAGAccc > 5:97505/1‑149 (MQ=255) aaGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGGCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGACCGGTGGGTGGATATTGGCCAGCCGACCCGGCCCtgc > 8:305248/1‑147 (MQ=255) aCTG‑‑CTTGCGGGCTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCcgcg > 5:252856/1‑149 (MQ=255) gTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCt < 2:334572/149‑1 (MQ=255) tAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTc < 1:206542/149‑1 (MQ=255) aaaGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGgcaaccacacgtttagtcattaatacccctttgactaccccgcaagcagtgcttcactgggtctctc < 8:112667‑M2/147‑68 (MQ=255) aGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACagc < 3:362010/149‑1 (MQ=255) g‑‑gTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGAGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACagcgag > 1:43564/1‑149 (MQ=255) tAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGcc < 4:279166/113‑1 (MQ=255) aTGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAgcgccgcg > 7:164764/1‑149 (MQ=255) gACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGAGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGa < 2:66519/122‑1 (MQ=255) gACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAAAGGGTTTACCCTCGAATACGGTCGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGa > 1:66519/1‑122 (MQ=255) aCTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCt > 4:111745/1‑149 (MQ=255) cTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTg < 6:252856/149‑1 (MQ=255) cTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTg > 5:135042/1‑149 (MQ=255) tAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTg > 2:266624/1‑148 (MQ=255) tAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTg > 8:260975/1‑148 (MQ=255) tAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTg > 3:252486/1‑148 (MQ=255) aaaCGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTgca < 3:305872/149‑1 (MQ=255) aaCGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTcc < 2:387125/126‑1 (MQ=255) aaCGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTcc > 1:387125/1‑126 (MQ=255) aaCGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTc < 3:196182/125‑1 (MQ=255) aaCGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTc > 4:196182/1‑125 (MQ=255) aCGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGgcaaccacacgtttagtcattaatacccctttgactaccccgcaagcagtgcttcactgggtctctcaagcctacccggatcccggagc < 7:61787‑M2/149‑90 (MQ=255) gtgtGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGATCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTGCAGCAt > 7:64631/1‑149 (MQ=255) tgGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTGCAGCAtgt < 8:64631/148‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTGCAGCATGTGCg > 8:228087/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTAACCCGCGAATACGGTGGTGGCGgcaaccacacgtttagtcattaatacccctttgactaccccgcaagcagagcttcactgggtcactcaagcgtacccggatccagcacccccccg < 8:188790‑M2/148‑96 (MQ=255) ttGCcgccaccaccgtattcgcgggtaaacccgctcctacgcgcgcacgccagcaaccacacgtttagtcattaatacccctttgactaccccgcaagcagtgcttcactgggtctctcaagcctacccggatccaggagccccccgat < 4:362010‑M1/149‑146 (MQ=255) ccgccaccaccgtattcgcgggtaaacccgctcctacgcgcgcacgccagcaaccacacgtttagtcattaatacccctttgactaccccgcaagcagtgcttcactgggtctctcaagcctacccggatccaggagccccccgatgag > 8:36705‑M1/1‑1 (MQ=255) ccgccaccaccgtattcgcgggtaaacccgctcctacgcgcgcacgccagcaaccacacgtttagtcattaatacccctttgactaccccgcaagcagtgcttcactgggtctctcaagcctacccggatccaggagccccccgatga < 6:406443‑M1/148‑148 (MQ=255) ccgccaccaccgtattcgcgggtaaacccgctcctacgcgcgcacgccagcaaccacacgtttagtcattaatacccctttgactaccccgcaagcagtgcttcactgggtctctcaagcctacccggatccaggagccccccgatga < 8:51448‑M1/148‑148 (MQ=255) cTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGGCCTTGCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTGCTGCATGTGCGGGc < 6:97505/148‑1 (MQ=255) | TGGTTGGTGACTTCGTGGGTTTCAGCGTACTGGTGCAGGCTCATCGGGGGGCTCCTGGATCCGGGTAGGCTTGAGAGACCCAGTGAAGCACTG‑‑CTTGCGGGGTAGTCAAAGGG‑‑GTATTAATGACTAAACGTGTGGTTGCTGGCGTGCGCGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGATATTGGCCAGCAGACCCGGCCCTTCCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGAGCGCCGCGCCTGCAGCATGTGCGGGCT > NC_002947/5442540‑5442826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |