New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5555200 = | 73 (1.120) | 6 (0.100) | 5/246 | NT | 8.4% | coding (325/459 nt) | PP_4887 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5555263 = | 63 (1.040) | coding (262/459 nt) | PP_4887 | hypothetical protein |
AGTTTCGATGCTGCTTAAAGCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATT > NC_002947/5555052‑5555347 | aGTTTCGATGCTGCTTAAAGCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCa < 2:6105/149‑1 (MQ=255) tttCGATGCTGCTTAAAGCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGa > 5:362561/1‑149 (MQ=255) ggacgtccccggctggctggcccgggccttccgcattcgcgactttatctcacgccgtttcaatgtcgccgatatccacggcttcactcgcggcgatccaatgcatgtgccagccgtcggtgagcgcctggacttcttcactgtcgaga > 5:396589‑M1/147‑149 (MQ=255) ggacgtccccggctggctggcccgggccttccgcattcgcgactttatctcacgccgtttcaatgtcgccgatatccacggcttcactcgcggcgatccaatgcatgtgccagccgtcggtgagcgcctggacttcttcactgtcga > 8:308610‑M1/147‑147 (MQ=255) tCGATGCTGCTTAAAGCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTATGCTTTGCCCGTAAACATCCATGCAGAc > 6:348577/1‑148 (MQ=255) gATGCTGCTTAAAGCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCAt > 8:157460/1‑149 (MQ=255) tccccggctggctggcccgggccttccgcattcgcgactttatctcacgccgtttcaatgtcgcctatatccacggcttcactcgcggcgatccaatgcatgtgccagccgtcggtgagcgcctggacttcttcactgtcgAGACCATc > 8:320083‑M1/142‑149 (MQ=255) ctgctTAAAGCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCagc > 1:80418/1‑147 (MQ=255) gctTAAAGCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCg < 6:203021/148‑1 (MQ=255) gctTAAAGCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCg > 5:203021/1‑148 (MQ=255) aGCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTg > 8:280580/1‑149 (MQ=255) gCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATATACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGc > 1:314031/1‑149 (MQ=255) cAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTcgc > 5:310490/1‑149 (MQ=255) cAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTcgc < 7:77038/149‑1 (MQ=255) gCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTcgcgc < 8:126885/149‑1 (MQ=255) gCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTcgcgc < 6:344527/149‑1 (MQ=255) cttccgcattcgcgactttatctcacgccgtttcaatgtcgccgatatccacggcttcactcgcggcgatccaatgcatgtgccagccgtcggtgagcgcctggacttcttcactgtcgAGACCATCa > 5:163168‑M1/120‑128 (MQ=255) cttccgcattcgcgactttatctcacgccgtttcaatgtcgccgatatccacggcttcactcgcggcgatccaatgcatgtgccagccgtcggtgagcgcctggacttcttcactgtcgAGACCATCa < 6:163168‑M1/9‑1 (MQ=255) ttccgcattcgcgactttatctcacgccgtttcaatgtcgccgatatccacggcttcactcgcggcgatccaatgcatgtgccagccgtcggtgagcgcctggacttcttcactgtcgAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTcgcgcg < 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cTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGaa > 1:154677/1‑144 (MQ=255) ttACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGAc > 3:266960/1‑115 (MQ=255) ttACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGAc < 4:266960/115‑1 (MQ=255) ttACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAg > 2:395299/1‑148 (MQ=255) ttACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAg > 6:82224/1‑148 (MQ=255) ttACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAg > 4:335060/1‑148 (MQ=255) tACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCa > 6:144348/1‑149 (MQ=255) ggCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAgctgc < 4:166366/149‑1 (MQ=255) tatctcacgccgtttcaatgtcgccgatatccacggcttcactcgcggcgatccaatgcatgtgccagccgtcggtgagcgcctggacttcttcactgtcgAGAc < 3:355610‑M1/4‑1 (MQ=255) tatctcacgccgtttcaatgtcgccgatatccacggcttcactcgcggcgatccaatgcatgtgccagccgtcggtgagcgcctggacttcttcactgtcgAGAc > 4:355610‑M1/102‑105 (MQ=255) ccATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGctgctg < 8:13339/149‑1 (MQ=255) tGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTc < 3:338325/149‑1 (MQ=255) 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tATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGAACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGAGCTCAcc > 7:372382/1‑148 (MQ=255) ttGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAc < 2:257959/149‑1 (MQ=255) acaGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTgg > 2:153534/1‑148 (MQ=255) acaGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTgg > 1:276840/1‑148 (MQ=255) aGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGcac < 7:280580/149‑1 (MQ=255) 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tgtgGGCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTg < 2:83017/149‑1 (MQ=255) tgGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGa < 6:310490/149‑1 (MQ=255) gCTTAAGCTTTTCCCGTACACATCGATGCAGACCATCTCCGCCAAGTGGGTGTCGCGCTAAGTCAGCAGCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGTCAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTTGCACATGCATTGGATcgccgc < 8:367347/149‑1 (MQ=255) aaGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGAATTGGATCGCCGCGAGt > 7:334806/1‑149 (MQ=255) ttGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGc > 3:288155/1‑149 (MQ=255) cccGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGt < 2:276840/149‑1 (MQ=255) cccGAACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGAAGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCCCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGt < 7:149010/149‑1 (MQ=255) cGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGACGGGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTg < 1:71342/149‑1 (MQ=255) gTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGa > 4:103641/1‑149 (MQ=255) acacATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGata > 8:229939/1‑149 (MQ=255) cacaTCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGatat > 2:292488/1‑149 (MQ=255) acaTCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATc < 3:335060/149‑1 (MQ=255) aTCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCgg > 3:25163/1‑149 (MQ=255) aTCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCgg > 7:28675/1‑149 (MQ=255) cATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGa < 7:229939/149‑1 (MQ=255) AGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACAtt < 7:386227‑M1/148‑1 (MQ=255) | AGTTTCGATGCTGCTTAAAGCTTCTCCAGCATTTTCCTTACGATCAGGCCATGCACCATGCCGACCGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATT > NC_002947/5555052‑5555347 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |