New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5555200 = | 73 (1.120) | 6 (0.100) | 5/246 | NT | 8.4% | coding (325/459 nt) | PP_4887 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5555263 = | 63 (1.040) | coding (262/459 nt) | PP_4887 | hypothetical protein |
CGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGGCCAGCCAGCCGGGGACGTCC > NC_002947/5555117‑5555408 | cGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCA‑‑GCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACa < 2:80418/149‑1 (MQ=255) cGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGACCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAACTCAGAACCAGCTGCTGGACGCTGATGGTCTCGa > 7:367347/1‑149 (MQ=255) gcagcaTGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGa > 7:45534/1‑147 (MQ=255) gcagcaTGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACa < 5:144348/149‑1 (MQ=255) tcAACCTGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGaagaag < 5:5494/148‑1 (MQ=255) aCAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTgaagaa < 3:280822/148‑1 (MQ=255) aCAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTgaagaa < 7:69441/148‑1 (MQ=255) aaCCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGAc > 6:198037/1‑137 (MQ=255) aaCCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGAc < 5:198037/137‑1 (MQ=255) aaCCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTgaagaa < 6:192627/146‑1 (MQ=255) aaCCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTgaagaa > 5:192627/1‑146 (MQ=255) aaCCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGcagaag > 6:5494/1‑147 (MQ=255) aaCCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTc > 2:71342/1‑149 (MQ=255) aaCCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTc > 7:279132/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTcc < 8:279132/149‑1 (MQ=255) aCCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTcc < 1:107155/149‑1 (MQ=255) cGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAg < 2:314031/149‑1 (MQ=255) aaGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCa > 4:117673/1‑149 (MQ=255) aGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCAc < 1:395299/149‑1 (MQ=255) 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acaGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTgg > 2:153534/1‑148 (MQ=255) aGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGcac < 7:280580/149‑1 (MQ=255) gCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGcaca < 5:13493/149‑1 (MQ=255) gCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGcaca > 2:334143/1‑149 (MQ=255) cACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACAt > 4:378108/1‑149 (MQ=255) 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aaGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGAATTGGATCGCCGCGAGt > 7:334806/1‑149 (MQ=255) ttGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGc > 3:288155/1‑149 (MQ=255) cccGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGt < 2:276840/149‑1 (MQ=255) cccGAACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGAAGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCCCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGt < 7:149010/149‑1 (MQ=255) cGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGACGGGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTg < 1:71342/149‑1 (MQ=255) 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aTCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCgg > 7:28675/1‑149 (MQ=255) cATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGa < 7:229939/149‑1 (MQ=255) AGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACAtt < 7:386227‑M1/148‑1 (MQ=255) gaccatcagcgaccagcagctggtgctgacttcgcgcgacacgcacttggcggtgatggtctCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTg > 6:341247‑M2/63‑148 (MQ=255) gaccatcagcgaccagcagctggtgctgacttcgcgcgacacgcacttggcggtgatggtctCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTg > 4:33280‑M2/63‑148 (MQ=255) GACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACAt > 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aGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGaa < 8:379801/146‑1 (MQ=255) aGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGaa > 7:379801/1‑146 (MQ=255) cACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGccc < 1:292488/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGCAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGgcca < 5:283437/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGgcca < 8:28675/149‑1 (MQ=255) ctgGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGgccagc < 3:378108/148‑1 (MQ=255) ctgGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGgccagc > 6:28426/1‑148 (MQ=255) ggTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGGccagccag > 6:47135/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATCCGGAAGGCCCGGGCcagccagc > 2:211555/1‑149 (MQ=255) cGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCAAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGGCGCGAATGCGGAAGGCCCGGGCCAGCCAGCCg < 5:348577/149‑1 (MQ=255) gCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGGCCAGCCAGCCgg > 6:352292/1‑149 (MQ=255) cTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTcgc > 4:103208/1‑118 (MQ=255) cTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTcgc < 3:103208/118‑1 (MQ=255) tgatggtctCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAg > 5:163168‑M2/10‑128 (MQ=255) tgatggtctCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAg < 6:163168‑M2/119‑1 (MQ=255) gatggtctCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATAGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGGCCAGCCAGCCGGGGa > 8:320083‑M2/9‑149 (MQ=255) gtctCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATa < 3:355610‑M2/101‑1 (MQ=255) gtctCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATa > 4:355610‑M2/5‑105 (MQ=255) tctCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGGCCAGCCAGCCGGGGACGTcc > 5:396589‑M2/4‑149 (MQ=255) tCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGGCCAGCCAGCCGGGGACGTcc > 8:308610‑M2/2‑147 (MQ=255) | CGGCAGCATGTACAACCGGCCAAAAGTATTGAGGCACAGCACCGATGTGGTCACGCTTAAGCTTTGCCCGTACACATCCATGCAGACCATCACCGCCAAGTGCGTGTCGCGCGAAGTCAGCACCAGCTGCTGGTCGCTGATGGTCTCGACAGTGAAGAAGTCCAGGCGCTCACCGAC‑GGCTGGCACATGCATTGGATCGCCGCGAGTGAAGCCGTGGATATCGGCGACATTGAAACGGCGTGAGATAAAGTCGCGAATGCGGAAGGCCCGGGCCAGCCAGCCGGGGACGTCC > NC_002947/5555117‑5555408 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |