New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGCGGCCGCTAAGC > NC_002947/496948‑497244 | ggCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAaga < 8:233322/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAggc < 5:54705‑M2/149‑4 (MQ=255) ttCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGAGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAggc < 3:204366‑M2/149‑4 (MQ=255) 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aGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCgg > 2:93862/1‑149 (MQ=255) gAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGc < 3:80230/149‑1 (MQ=255) cATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGa < 2:156035/149‑1 (MQ=255) cATGGCCTTGTTGTGCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGa < 8:379587/149‑1 (MQ=255) tGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGc < 8:284302/149‑1 (MQ=255) 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gCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGtt > 4:342074/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTg < 3:81880/149‑1 (MQ=255) cgcgcgAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggccatgttctgccagaagcccggcgactcgctcaggcgcgggtatttcggctgc > 6:259683‑M2/1‑39 (MQ=255) cgcgcgAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTgg < 5:335283/149‑1 (MQ=255) gcgcgAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTggg < 5:338273/149‑1 (MQ=255) gcgcgAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTggg > 8:307181/1‑149 (MQ=255) gcgcgAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTggg < 4:161388/149‑1 (MQ=255) atcgAGAAAGCCTTTTTGAGCGCCAGGTT‑A‑GC‑GAAGATGAGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGACATTTGCGTTAAGCAAACAATGCCGCTGAGCGCATGTTGGGc > 4:4895/3‑149 (MQ=255) cgAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTa < 8:351760/149‑1 (MQ=255) gagaAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTAc < 5:369526/149‑1 (MQ=255) gagaAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTAc < 1:405526/149‑1 (MQ=255) cTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAgg < 1:216178/149‑1 (MQ=255) cTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAgg > 5:192460/1‑149 (MQ=255) gttgAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAgggg < 7:307181/148‑1 (MQ=255) tgcggCAGGGG‑C‑GC‑GTAGAGGCTTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGGGGGTAGCCGCTGGGGCAACTGGGACAGCCATGGGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGtt < 7:164508/147‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACa < 8:133829/135‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACa > 7:133829/1‑135 (MQ=255) gcgcCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGc > 1:398026/1‑149 (MQ=255) cgcCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGATCACCGTGGGTTTCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGGCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAATGGGCGTTGCt < 5:77454/149‑1 (MQ=255) aGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAg > 4:50494/1‑149 (MQ=255) ggTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGc < 7:94781/149‑1 (MQ=255) ggTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGc < 7:3104/149‑1 (MQ=255) g‑c‑gc‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGCGGc < 6:30660/149‑1 (MQ=255) aaGAGGCGGTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGCGGCCGCTa < 8:364120/149‑1 (MQ=255) agGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGCGGCCGCTAAGc < 3:342074/149‑1 (MQ=255) agGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGCGGCCGCTAAGc < 1:219457/149‑1 (MQ=255) | GGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTG‑C‑GC‑GAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGCGGCCGCTAAGC > NC_002947/496948‑497244 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |